牡丹休眠相关基因PsGRASs筛选、克隆和表达特性分析
吴 红，刘春英，付祥梅，盖树鹏，张玉喜*青岛农业大学生命科学学院，山东省高校植物生物技术重点实验室，山东青岛 266109
出版日期:2019-02-25发布日期:2019-02-25基金资助:国家自然科学基金面上项目（31471908，31692194）Screening，Cloning and Expression Patterns Analysis of PsGRASs Associated with Dormancy Release in Tree Peony（Paeonia suffruticosa）
WU Hong，LIU Chunying，FU Xiangmei，GAI Shupeng，and ZHANG Yuxi*Qingdao Agricultural University，College of Life Sciences，Key Lab of Plant Biotechnology in Universities of Shandong Province，Qingdao，Shandong 266109，China
Online:2019-02-25Published:2019-02-25摘要/Abstract
摘要： 通过筛选、克隆牡丹PsGRASs基因并进行表达模式分析，初步解析其是否参与牡丹休眠解除，以期为牡丹反季节催花提供候选基因。利用HMM（Hidden Markov Model）模型，基于GRAS基因家族的种子（Pfam号为PF03514）序列，利用BioEdit软件对牡丹花芽休眠的454测序转录组数据进行本地检索，筛选到2个具有GRAS结构域的序列。通过RACE扩增得到了其全长cDNA，其中PsGRAS1序列为2 308 bp，开放阅读框（open reading frame，ORF）为1 848 bp，编码615个氨基酸；PsGRAS2为2 034 bp，ORF为1 560 bp，编码518个氨基酸，两个编码PsGRASs 蛋白的同源性为19.87%。进化树结果表明，PsGRAS1蛋白与拟南芥GRAS家族中的DELLA亚家族的GAI和RGLs聚到一个大的分支，PsGRAS2蛋白与拟南芥HAMs（AtSCL6/15/22/26/27）并为一支，说明PsGRAS1和PsGRAS2来自GRAS家族的两个不同分支。组织表达结果显示PsGRAS1和PsGRAS2在牡丹初花期不同组织中表达水平不同，PsGRAS1在叶中表达水平最高，在雄蕊中最低；而PsGRAS2在苞片中表达水平最高，在花瓣中最低。在牡丹花芽休眠解除过程中，PsGRAS1呈下调趋势，低温28 d表达水平最低，而PsGRAS2呈先上调后下调趋势，低温14 d表达水平最高。在外源GA3处理7 d的牡丹花芽中，PsGRAS1的表达显著下降，而PsGRAS2显著提高。这表明PsGRAS1和PsGRAS2都参与了休眠过程，但功能不同。
中图分类号:
S 685.11
引用本文
吴 红，刘春英，付祥梅，盖树鹏，张玉喜*. 牡丹休眠相关基因PsGRASs筛选、克隆和表达特性分析[J]. 园艺学报, 2019, 46(2): 365-374.
WU Hong，LIU Chunying，FU Xiangmei，GAI Shupeng，and ZHANG Yuxi*. Screening，Cloning and Expression Patterns Analysis of PsGRASs Associated with Dormancy Release in Tree Peony（Paeonia suffruticosa）[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2019, 46(2): 365-374.
PDF全文下载地址:
http://www.ahs.ac.cn/CN/article/downloadArticleFile.do?attachType=PDF&id=6648
