结球甘蓝CML家族基因及其在授粉后柱头中的表达
蒲 敏1,4,*，罗绍兰1,*，廉小平2，曾 静3，张贺翠1，刘倩莹1，左同鸿1，朱利泉1,**（1西南大学农学与生物科技学院，重庆 400715；2重庆市蔬菜重点实验室，重庆 400715；3长江师范学院生命科学与技术学院，重庆 408100；4涪陵第十四中学校，重庆 408000）
出版日期:2018-11-25发布日期:2018-11-25Bioinformatics and Expression Analysis After Pollination of Stigma of CML Family Genes in Brassica oleracea var. capitata
PU Min1,4,*，LUO Shaolan1,*，LIAN Xiaoping2，ZENG Jing3，ZHANG Hecui1，LIU Qianying1，ZUO Tonghong1，and ZHU Liquan1,**（1College of Agronomy and Biotechnology，Southwest University，Chongqing 400715，China；2Key Laboratory in Olericulture of Chongqing，Chongqing 400715，China；3School of Life Science and Biotechnology，Yangtze Normal University，Chongqing 408100，China；4Fuling No. 14 Middle School，Chongqing 408000，China）
Online:2018-11-25Published:2018-11-25摘要/Abstract
摘要： 利用NCBI和甘蓝基因组数据库筛选获得了76个结球甘蓝CML家族基因，其随机分布在甘蓝的9条染色体上，染色体上最多的有12个基因，最少有1个基因。分析发现该基因家族编码蛋白氨基酸残基长度在109 ~ 365个之间，分子量大多在20 kD左右，为小分子蛋白，且均含有2 ~ 4个保守的EF-hand结构域。甘蓝的76个CML基因依据与拟南芥的CML家族的进化关系及序列相似性分为Ⅰ~ Ⅷ个亚家族，每个亚家族基因有较高的同源性，进化关系较近。经亚细胞预测分析发现大部分蛋白在质膜和胞外表达，少量在质膜、细胞核内和叶绿体等部位表达。数字表达谱分析发现在76个基因中，有25个基因在自花和异花授粉后差异表达，其中BoCML12、BoCML42、BoCML44、BoCML45、BoCML60、BoCML70、BoCML71 和BoCML74等8个基因在自花和异花授粉后表达趋势有较大差异，表明这8个基因以不同的方式参与调控甘蓝自花和异花授粉后的反应过程，有可能与甘蓝的自交不亲和性相关。
中图分类号:
S 635.1
引用本文
蒲 敏1,4,*，罗绍兰1,*，廉小平2，曾 静3，张贺翠1，刘倩莹1，左同鸿1，朱利泉1,**. 结球甘蓝CML家族基因及其在授粉后柱头中的表达[J]. 园艺学报, 2018, 45(11): 2129-2140.
PU Min1,4,*，LUO Shaolan1,*，LIAN Xiaoping2，ZENG Jing3，ZHANG Hecui1，LIU Qianying1，ZUO Tonghong1，and ZHU Liquan1,**. Bioinformatics and Expression Analysis After Pollination of Stigma of CML Family Genes in Brassica oleracea var. capitata[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2018, 45(11): 2129-2140.
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