柑橘鳞皮病毒3个分离物全基因组序列分析

李 敏，周天宇，张 松，杨方云，周 彦，周常勇，李中安*，曹孟籍*

西南大学/中国农业科学院柑桔研究所，重庆 400712

出版日期:2018-10-25发布日期:2018-10-25


基金资助:国家重点研发计划政府间国际科技创新合作重点专项（2017YFE0110900）；重庆市科委社会事业与民生保障科技创新专项（cstc2016shms-ztzx800003）；重庆市基础科学与前沿技术研究专项（cstc2017jcyjBX0016）；国家自然科学基金项目（31501611）；重庆市研究生科研创新项目（CYS18133）

Complete Genome Sequence Analysis of Three Citrus psorosis virus Isolates

LI Min，ZHOU Tianyu，ZHANG Song，YANG Fangyun，ZHOU Yan，ZHOU Changyong，LI Zhongan*，and CAO Mengji*

Citrus Research Institute，Southwest University/Chinese Academy of Agricultural Sciences，Chongqing 400712，China

Online:2018-10-25Published:2018-10-25

摘要/Abstract

摘要： 运用转录组测序和RT-PCR方法克隆测定了柑橘鳞皮病毒（Citrus psorosis virus，CPsV）3个分离物CHN-1、CHN-2和CHN-3的全基因组。序列分析结果表明，CHN-1、CHN-2和CHN-3的基因组全长分别为11 282、11 279和11 278 nt，均包含4个开放阅读框。CHN-1、CHN-2和CHN-3之间的核苷酸相似性为93.48% ~ 95.98%，编码氨基酸相似性为98.18% ~ 98.86%；与6个已知国外CPsV分离物的外壳蛋白基因核苷酸序列相似性为85.83% ~ 95.23%，其对应氨基酸序列相似性为94.09% ~ 99.32%。系统进化分析显示CHN-1、CHN-2和CHN-3与地中海沿岸国家的CPsV分离物聚为一簇，可能具有共同的起源。
中图分类号:
S 666

引用本文

李 敏，周天宇，张 松，杨方云，周 彦，周常勇，李中安*，曹孟籍*. 柑橘鳞皮病毒3个分离物全基因组序列分析[J]. 园艺学报, 2018, 45(10): 2030-2036.
LI Min，ZHOU Tianyu，ZHANG Song，YANG Fangyun，ZHOU Yan，ZHOU Changyong，LI Zhongan*，and CAO Mengji*. Complete Genome Sequence Analysis of Three Citrus psorosis virus Isolates[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2018, 45(10): 2030-2036.





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