苹果茎沟病毒吉林沙果分离物全基因组序列分析

李正男，张双纳，张尊平，范旭东，任 芳，胡国君，董雅凤*

中国农业科学院果树研究所，国家落叶果树脱毒中心，辽宁兴城 125100

出版日期:2018-04-25发布日期:2018-04-25


基金资助:中央级公益性科研院所基本科研业务费专项（1610182016017）；中国农业科学院科技创新工程项目（CAAS-ASTIP-2016-RIP）

Analysis of the Complete Genome of Apple stem grooving virus Isolate Jilin-shaguo

LI Zhengnan，ZHANG Shuangna，ZHANG Zunping，FAN Xudong，REN Fang，HU Guojun，and DONG Yafeng*

National Center for Eliminating Viruses from Deciduous Fruit Tree，Research Institute of Pomology，Chinese Academy of Agricultural Sciences，Xingcheng，Liaoning 125100，China

Online:2018-04-25Published:2018-04-25

摘要/Abstract

摘要： 通过RT-PCR结合RACE技术扩增到苹果茎沟病毒（Apple stem grooving virus，ASGV）吉林沙果分离物（ASGV-JLSG）全长基因组（登录号：FM616381），共含有6 496个核苷酸（nt），编码两个彼此重叠的开放阅读框（Open reading frame，ORF）。ORF1（37 ~ 6 354 nt）编码1个241 kD的多聚蛋白，含有甲基转移酶（Methyltransferase）、木瓜蛋白酶（Papain-like-protease）、解旋酶（Nucleotide triphosphate-binding helicase）、RNA依赖的RNA聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase）和C端的外壳蛋白（Coat protein，CP）等结构域。ORF2（4 788 ~ 5 750 nt）编码1个36 kD的运动蛋白（Movement protein，MP）。ASGV-JLSG分离物与GenBank公布的29个ASGV分离物全基因核苷酸序列一致性为79.20% ~ 86.60%。系统发育分析结果表明，30个ASGV分离物分成2个组，分离物间没有表现出寄主专一性和地理分布规律。重组分析发现，ASGV-JLSG分离物是苹果茎沟病毒黄花梨分离物（ASGV-HH，JN701424）和柑橘碎叶病毒满头红分离物（CTLV-MTHK，C588948）的重组体。本研究中获得的ASGV-JLSG分离物基因组是来源于中国东北地区的首个ASGV基因组序列。
中图分类号:
S 661.1

引用本文

李正男，张双纳，张尊平，范旭东，任 芳，胡国君，董雅凤*. 苹果茎沟病毒吉林沙果分离物全基因组序列分析[J]. 园艺学报, 2018, 45(4): 641-649.
LI Zhengnan，ZHANG Shuangna，ZHANG Zunping，FAN Xudong，REN Fang，HU Guojun，and DONG Yafeng*. Analysis of the Complete Genome of Apple stem grooving virus Isolate Jilin-shaguo[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2018, 45(4): 641-649.





PDF全文下载地址:

http://www.ahs.ac.cn/CN/article/downloadArticleFile.do?attachType=PDF&id=6318