基于ITS序列的中国樱桃、欧洲甜樱桃和毛樱桃种内遗传多样性及种间关系分析

王 浩?1，黄智林1，陈 涛2，张 静2，王 燕2，陈 清1，汤浩茹1,2，王小蓉1,2,*

1四川农业大学园艺学院，成都 611130；2四川农业大学果蔬研究所，成都 611130

出版日期:2018-01-25发布日期:2018-01-25

Genetic Diversity and Relationship Analysis Among Cerasus pseudocerasus，C. avium，and C. tomentosa Based on Internal Transcribed Spacer（ITS）Sequences

WANG Hao1，HUANG Zhilin1，CHEN Tao2，ZHANG Jing2，WANG Yan2，CHEN Qing1，TANG Haoru1,2，and WANG Xiaorong1,2,*

1College of Horticulture，Sichuan Agricultural University，Chengdu 611130，China；2Institute of Pomology and Olericulture，Sichuan Agricultural University，Chengdu 611130，China

Online:2018-01-25Published:2018-01-25

摘要/Abstract

摘要： 对中国樱桃[Cerasus pseudocerasus（Lindl.）G. Don]（地方种质35份，野生资源35份），欧洲甜樱桃[C. avium（L.）Moench]（18份）和毛樱桃[C. tomentosa（Thunb.）Wall.]（7份）共95份材料的核糖体内转录间隔区（ITS，internal transcribed spacer）序列进行了测定和分析，以期从ITS的DNA序列变异角度揭示种内遗传多样性及种间遗传关系。结果表明：（1）96条ITS序列比对后长度为712 bp，G + C含量为58.1%，检测到71个变异位点（9.97%），共定义了37个单倍型；中国樱桃、欧洲甜樱桃和毛樱桃的单倍型多样性和核酸多样性分别为0.840和0.00466、0.928和0.00396、0.905和0.00564，中国樱桃中栽培种质遗传多样性明显低于其野生资源；（2）种间遗传关系显示，中国樱桃与欧洲甜樱桃之间的遗传距离较近（0.019），而与毛樱桃遗传距离较远（0.048）；（3）邻接聚类和单倍型网络分析显示3个种分别聚为3个分支，种间具有较大的遗传分化。同时，选择3个种的代表单倍型进行其ITS序列的二级结构预测分析，3个种之间ITS1区、ITS2区的二级结构差异较大，最小自由能差异显著，进一步揭示了3个种间的遗传关系较远。综合分析认为，3个樱桃种内均具有较高的遗传多样性，种间具有较大的遗传分化，遗传关系较远，其中毛樱桃与中国樱桃和欧洲甜樱桃的遗传关系均较远。

引用本文

王 浩?1，黄智林1，陈 涛2，张 静2，王 燕2，陈 清1，汤浩茹1,2，王小蓉1,2,*. 基于ITS序列的中国樱桃、欧洲甜樱桃和毛樱桃种内遗传多样性及种间关系分析[J]. 园艺学报, 2018, 45(1): 126-138.
WANG Hao1，HUANG Zhilin1，CHEN Tao2，ZHANG Jing2，WANG Yan2，CHEN Qing1，TANG Haoru1,2，and WANG Xiaorong1,2,*. Genetic Diversity and Relationship Analysis Among Cerasus pseudocerasus，C. avium，and C. tomentosa Based on Internal Transcribed Spacer（ITS）Sequences[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2018, 45(1): 126-138.





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