苹果CR4基因家族鉴定与表达分析

吕前前，刘钰玺，李静轩，马宗桓，姜雪峰，王宝林，毛 娟，褚明宇，陈佰鸿，左存武*

甘肃农业大学园艺学院，兰州 730070

出版日期:2018-10-25发布日期:2018-10-25


基金资助:甘肃农业大学学生科研训练计划SRTP项目（20171028）；国家自然科学基金项目（31860545；31501728）；甘肃省科技重大专项（18ZD2NA006）；甘肃农业大学引进人才专项（GSAU-RCZX201712）

Identification and Expression Analysis of CR4 in Apple

Lü Qianqian，LIU Yuxi，LI Jingxuan，MA Zonghuan，JIANG Xuefeng，WANG Baolin，MAO Juan，CHU Mingyu，CHEN Baihong，and ZUO Cunwu*

Department of Horticulture，Gansu Agricultural University，Lanzhou 730070，China

Online:2018-10-25Published:2018-10-25

摘要/Abstract

摘要： 以RCC1（PF00415）、TNFR_c6（PF00020）和Pkinase（PF00069）保守域全蛋白序列为种子序列，在苹果全基因组范围比对分析了CRINKLY4（CR4）家族成员，对其理化性质、进化关系、染色体分布等进行了分析；基于qPCR分析了CR4基因在苹果腐烂病发生和低温胁迫过程中的表达情况。通过分析，共获得8个苹果CR4基因，其氨基酸序列大小介于668 ~ 1 690，分子量介于71.73 ~ 187.61 kD，等电点介于5.69 ~ 8.66，主要位于质膜；根据进化分析将其分为两个亚组。PCR表达分析结果表明，CR4基因在苹果不同组织和品种间存在不同的表达模式。分别有8个和6个CR4基因在苹果花芽感受低温和接种腐烂病菌后至少在1个时间点发生差异表达。其中，MD03G1068800在花芽感受低温后上调达25倍以上，而MD00G1166500和MD01G1153100在腐烂病发生后上调达150倍以上，以上3个CR4基因可作为后续功能研究的候选基因。
中图分类号:
S 661.1

引用本文

吕前前，刘钰玺，李静轩，马宗桓，姜雪峰，王宝林，毛 娟，褚明宇，陈佰鸿，左存武*. 苹果CR4基因家族鉴定与表达分析[J]. 园艺学报, 2018, 45(10): 2019-2029.
Lü Qianqian，LIU Yuxi，LI Jingxuan，MA Zonghuan，JIANG Xuefeng，WANG Baolin，MAO Juan，CHU Mingyu，CHEN Baihong，and ZUO Cunwu*. Identification and Expression Analysis of CR4 in Apple[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2018, 45(10): 2019-2029.





PDF全文下载地址:

http://www.ahs.ac.cn/CN/article/downloadArticleFile.do?attachType=PDF&id=6471