辣椒bZIP家族基因的鉴定与表达分析
魏瑞敏1,2,郑井元1,刘 峰1,马艳青1,李雪峰1,杨博智1,邹学校1,谢玲玲1,*,戴雄泽1,*1湖南省蔬菜研究所,长沙 410125;2湖南大学研究生院隆平分院,长沙 410125
出版日期:
2018-08-25发布日期:
2018-08-25基金资助:
国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-24-A-14)Genome Wide Identification and Expression Analysis of the bZIP Gene Family in Pepper
WEI Ruimin,ZHENG Jingyuan,LIU Feng,MA Yanqing,LI Xuefeng,YANG Bozhi,ZOU Xuexiao,XIE Lingling*,and DAI Xiongze*1Institute of Vegetable,Hunan Academy of Agricultural Sciences,Changsha 410125,China;2College of Longping,Graduate School of Hunan University,Changsha 410125,China
Online:
2018-08-25Published:
2018-08-25摘要/Abstract
摘要: 利用生物信息学的方法对辣椒bZIP家族基因进行全面鉴定与进化分析,并在此基础上对基因染色体定位、蛋白质保守基序和基因结构等进行分析,并通过qRT-PCR方法检测基因的组织表达模式和在ABA胁迫下的应答等。结果表明,从辣椒基因组中共鉴定出54个bZIP家族基因,这些基因分散分布在辣椒的11条染色体上;系统进化分析表明辣椒bZIP基因家族可以分为10组,每组所含有的基因数不等;该家族成员每个基因含有0 ~ 11个内含子;bZIP家族基因具有不同的表达模式;外源激素ABA处理可以明显抑制或者激活该家族基因成员的表达。
中图分类号:
S 641.3
引用本文
魏瑞敏1,2,郑井元1,刘 峰1,马艳青1,李雪峰1,杨博智1,邹学校1,谢玲玲1,*,戴雄泽1,*. 辣椒bZIP家族基因的鉴定与表达分析[J]. 园艺学报, 2018, 45(8): 1535-1550.
WEI Ruimin,ZHENG Jingyuan,LIU Feng,MA Yanqing,LI Xuefeng,YANG Bozhi,ZOU Xuexiao,XIE Lingling*,and DAI Xiongze*. Genome Wide Identification and Expression Analysis of the bZIP Gene Family in Pepper[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2018, 45(8): 1535-1550.
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