葡萄PP2C家族基因的鉴定与表达分析
何红红1,路志浩2,马宗桓1,梁国平1,马丽娟1,万 鹏1,毛 娟1,*(1甘肃农业大学园艺学院,兰州 730070;2华中农业大学园艺林学学院,武汉 430070)
出版日期:
2018-07-25发布日期:
2018-07-25Genome-Wide Identification and Expression Analysis of the PP2C Gene Family in Vitis vinifera
HE Honghong1,LU Zhihao2,MA Zonghuan1,LIANG Guoping1,MA Lijuan1,WAN Peng1,and MAO Juan1,*(1College of Horticulture,Gansu Agricultural University,Lanzhou 730070,China;2College of Horticulture and Forestry Sciences,Huazhong Agricultural University,Wuhan 430070,China)
Online:
2018-07-25Published:
2018-07-25摘要/Abstract
摘要: 参考拟南芥(Arabidopsis thaliana)的PP2C基因注册序列,从葡萄(Vitis vinifera)全基因组中鉴定得到PP2C家族基因27个,分为10个亚族A、C ~ I、K、L。编码氨基酸181 ~ 1 084个,理论等电点4.46 ~ 8.98。亚细胞定位分析表明,葡萄PP2C基因家族主要在细胞质、叶绿体和细胞核中表达。二级结构主要以α–螺旋和不规则卷曲为主。葡萄PP2C基因芯片表达谱分析发现,该家族成员在葡萄不同组织中响应不同的逆境胁迫。qRT-PCR分析表明,葡萄试管苗在100和50 mmol ? L-1 ABA、10% NaCl和10% PEG单独处理6 h后VvPP2C02的诱导表达量最高,分别是对照的11倍、8倍、14倍和13倍。
中图分类号:
S 663.1
引用本文
何红红1,路志浩2,马宗桓1,梁国平1,马丽娟1,万 鹏1,毛 娟1,*. 葡萄PP2C家族基因的鉴定与表达分析[J]. 园艺学报, 2018, 45(7): 1237-1250.
HE Honghong1,LU Zhihao2,MA Zonghuan1,LIANG Guoping1,MA Lijuan1,WAN Peng1,and MAO Juan1,*. Genome-Wide Identification and Expression Analysis of the PP2C Gene Family in Vitis vinifera[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2018, 45(7): 1237-1250.
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