卷丹LlAGO1基因的克隆及表达分析
杨盼盼1,2,徐 华2,徐雷锋2,唐玉超2,何国仁2,曹雨薇2,袁素霞2,任君芳3,明 军1,2,*1南京林业大学风景园林学院,南京 210037;2中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京 100081;3阿坝州林业科学技术研究所,四川汶川 623000
出版日期:
2018-04-25发布日期:
2018-04-25基金资助:
国家自然科学基金项目(31272205,31672196);农业部中央级公益性科研院所基本科研业务费项目(1610102016011);中国农业科学院科技创新工程项目;农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室项目Cloning and Expression Analysis of LlAGO1 in Lilium lancifolium
YANG Panpan1,2,XU Hua2,XU Leifeng2,TANG Yuchao2,HE Guoren2,CAO Yuwei2,YUAN Suxia2,REN Junfang3,and MING Jun1,2,*1College of Landscape Architecture,Nanjing Forestry University,Nanjing 210037,China;2The Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081,China;3Aba Prefecture Institute of Forestry Science and Technology,Wenchuan,Sichuan 623000,China
Online:
2018-04-25Published:
2018-04-25摘要/Abstract
摘要: 以卷丹(Lilium lancifolium)叶腋组织为研究材料,利用RT-PCR和RACE技术克隆得到AGO1基因的cDNA全长,命名为LlAGO1。其全长4 014 bp,开放阅读框长3 687 bp,编码1 228个氨基酸残基,其编码蛋白分子量为135.36 kD,理论等电点(pI)为9.57。氨基酸序列分析表明LlAGO1含有PAZ和Piwi两个AGO1典型的结构域;信号肽预测结果表明LlAGO1蛋白不存在信号肽,为非分泌蛋白;亚细胞定位预测其主要定位于细胞核;与相关同源蛋白高度相似,且与芦笋AGO1a蛋白(XP_020260210.1)亲缘关系最近。qRT-PCR分析结果表明:LlAGO1在卷丹叶腋、鳞片、根、叶等不同组织均有表达,其中在叶腋中的表达量最高,叶片和根中的表达较弱;腋生珠芽形成过程中,LlAGO1仅在可形成珠芽的上部叶腋表达,且在珠芽形成时表达量最高,而在不形成珠芽的下部叶腋几乎不表达,推测LlAGO1可能与卷丹珠芽的形成相关。
中图分类号:
S 682.2
引用本文
杨盼盼1,2,徐 华2,徐雷锋2,唐玉超2,何国仁2,曹雨薇2,袁素霞2,任君芳3,明 军1,2,*. 卷丹LlAGO1基因的克隆及表达分析[J]. 园艺学报, 2018, 45(4): 784-794.
YANG Panpan1,2,XU Hua2,XU Leifeng2,TANG Yuchao2,HE Guoren2,CAO Yuwei2,YUAN Suxia2,REN Junfang3,and MING Jun1,2,*. Cloning and Expression Analysis of LlAGO1 in Lilium lancifolium[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2018, 45(4): 784-794.
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