梨蔗糖合成相关酶SUS和SPS基因家族的鉴定与表达分析
吕佳红,王英珍,程 瑞,王国明,张绍铃,吴 俊,张虎平*(南京农业大学园艺学院,梨工程技术研究中心,南京 210095)
出版日期:
2018-03-25发布日期:
2018-03-25Genome-wide Identification and Expression Analysis of Sucrose Synthase (SUS)and Sucrose Phosphate Synthase(SPS)Gene Families in Pear
Lü Jiahong,WANG Yingzhen,CHENG Rui,WANG Guoming,ZHANG Shaoling,WU Jun,and ZHANG Huping*(Department of Horticulture,Centre of Pear Engineering Technology Research,Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095,China)
Online:
2018-03-25Published:
2018-03-25摘要/Abstract
摘要: 运用生物信息学方法,对梨蔗糖合酶(SUS)和蔗糖磷酸合成酶(SPS)基因进行全基因组鉴定与基因结构、系统发育关系、蛋白质保守功能域、染色体定位和基因进化模式分析,利用转录组数据和实时荧光定量PCR技术分析低蔗糖型‘砀山酥梨’和高蔗糖型‘翠冠’果实发育过程中SUS和SPS家族基因的表达模式。结果表明,梨中包含17个SUS基因(PbrSUS1 ~ PbrSUS17)和8个SPS基因(PbrSPS1 ~ PbrSPS8);SUS基因家族分为3个亚家族,分别为SUS1、SUSA和SUS2。梨SUS和SPS基因家族成员不均匀地分布在10条染色体上,主要通过片段复制事件进行扩张,且在进化过程中主要受纯化选择作用。PbrSPS3、PbrSPS4、PbrSPS8、PbrSUS2和PbrSUS15是调控梨果实蔗糖合成积累的重要基因。
中图分类号:
S 661.2
引用本文
吕佳红,王英珍,程 瑞,王国明,张绍铃,吴 俊,张虎平*. 梨蔗糖合成相关酶SUS和SPS基因家族的鉴定与表达分析[J]. 园艺学报, 2018, 45(3): 421-435.
Lü Jiahong,WANG Yingzhen,CHENG Rui,WANG Guoming,ZHANG Shaoling,WU Jun,and ZHANG Huping*. Genome-wide Identification and Expression Analysis of Sucrose Synthase (SUS)and Sucrose Phosphate Synthase(SPS)Gene Families in Pear[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2018, 45(3): 421-435.
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