桃FLA家族基因的生物信息学及表达分析

出版日期:2017-04-25发布日期:2017-04-25

Bioinformatic and Expression Analysis of Fasciclin-like Arabinogalactan Proteins（FLAs）Gene Family in Peach

（1College of Food Science and Technology，Shanghai Ocean University，Shanghai 201306，China；2College of Biological and Environmental Sciences，Zhejiang Wanli University，Ningbo，Zhejiang 315100，China）

Online:2017-04-25Published:2017-04-25

摘要/Abstract

摘要： 从桃基因组数据库筛选出了12个假定的成束状阿拉伯半乳糖蛋白（FLA）基因序列。对其蛋白结构进行分析，结果显示PpFLA7不具有特定的阿拉伯糖或半乳糖糖基化位点，不属于典型的FLA家族。PpFLA6的氨基酸组成和保守域的分布与其他成员相比差别较大。聚类分析结果表明PpFLAs家族可以分为CladeⅠ、CladeⅡ和Clade Ⅲ 3类。利用荧光定量PCR（qPCR）对不同组织和成熟阶段果实中的FLA进行表达分析，发现各个成员在不同时期的组织中差异化表达，其中PpFLA4在果实成熟阶段显著上调表达，暗示其可能在桃果实的成熟阶段扮演重要角色。
中图分类号:
S 662.1

引用本文

卞 坤1,2，邵佳蓉2，徐利伟2，沈子明1,2，陈 伟2，杨震峰2,*. 桃FLA家族基因的生物信息学及表达分析[J]. 园艺学报, 2017, 44(4): 653-663.
BIAN Kun1,2，SHAO Jiarong2，XU Liwei2，SHEN Ziming1,2，CHEN Wei2，and YANG Zhenfeng2,*. Bioinformatic and Expression Analysis of Fasciclin-like Arabinogalactan Proteins（FLAs）Gene Family in Peach[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2017, 44(4): 653-663.





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