苹果LysM类受体激酶基因家族鉴定与表达分析

左存武，张卫娜，毛 娟，姜雪峰，马宗桓，苏 静，陈佰鸿*

（甘肃农业大学园艺学院，兰州 730070）

出版日期:2017-04-25发布日期:2017-04-25

Genome Wide Identification and Expression Analysis of LysM Receptor- like Kinase in Apple

ZUO Cunwu，ZHANG Weina，MAO Juan，JIANG Xuefeng，MA Zonghuan，SU Jing，and CHEN Baihong*

（Department of Horticulture，Gansu Agricultural University，Lanzhou 730070，China）

Online:2017-04-25Published:2017-04-25

摘要/Abstract

摘要： 以LysM（PF01476）和Pkinase（PF00069）保守域全蛋白序列为种子序列，在全基因组范围比对分析了苹果（Malus × domestica Borkh.）LysM-RLK家族的成员，对其家族成员的理化性质、进化关系、染色体分布、基因结构等进行了分析；基于已公布的转录组学数据，分析了LysM-RLK基因在苹果组织、发育过程和生物胁迫中的表达情况。通过分析，共获得12个苹果LysM-RLK基因，其氨基酸序列大小介于553 ~ 1 053，分子量介于62.65 ~ 119.04 kD，等电点介于5.11 ~ 7.45，主要位于质膜；根据进化分析将其分为3个亚组，亚组内各成员的外显子—内含子结构呈现较为相似的特征。基因表达数据显示，苹果的4个LysM-RLK基因表达存在较大的组织特异性，7个基因在苹果腐烂病和再植病发病过程中为差异表达。
中图分类号:
S 661.1

引用本文

左存武，张卫娜，毛 娟，姜雪峰，马宗桓，苏 静，陈佰鸿*. 苹果LysM类受体激酶基因家族鉴定与表达分析[J]. 园艺学报, 2017, 44(4): 733-742.
ZUO Cunwu，ZHANG Weina，MAO Juan，JIANG Xuefeng，MA Zonghuan，SU Jing，and CHEN Baihong*. Genome Wide Identification and Expression Analysis of LysM Receptor- like Kinase in Apple[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2017, 44(4): 733-742.





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