高温胁迫下茄子qRT-PCR内参基因筛选及稳定性分析
庞强强1,2,3,李植良1,罗少波1,陈日远2,金庆敏1,黎振兴1,李德明3,孙保娟1,*,孙光闻2,*1广东省农业科学院蔬菜研究所,广州 510640;2华南农业大学园艺学院,广州 510642;3海南省农业科学院蔬菜研究所,海口 570100
出版日期:
2017-03-25发布日期:
2017-03-25Selection and Stability Analysis of Reference Gene for qRT-PCRin Eggplant Under High Temperature Stress
PANG Qiangqiang1,2,3,LI Zhiliang1,LUO Shaobo1,CHEN Riyuan2,JIN Qingmin1,LI Zhenxing1,LI Deming3,SUN Baojuan1,*,and SUN Guangwen2,*1Vegetable Research Institute,Guangdong Academy of Agricultural Sciences,Guangzhou 510640,China;2Horticultural College,South China Agricultural University,Guangzhou 510642,China;3Vegetable Research Institute,Hainan Academy of Agricultural Sciences,Haikou 570100,China
Online:
2017-03-25Published:
2017-03-25摘要/Abstract
摘要: 为筛选茄子(Solanum melongena L.)高温胁迫下稳定表达的内参基因,以不同茄子品系(种)为研究对象,PCR技术对来自茄子高温胁迫转录组数据库8个候选内参基因(SmEF1a、SmEF2、Sm40sRPS29、Sm60sRPL24、SmTRX、SmCK I、SmDAHPS I、SmUCP)和SmActin在不同试验情况下进行表达检测,并结合GeNorm、NormFinder、BestKeeper和ReFinder软件综合评价9个内参基因的表达稳定性。结果表明,在茄子热敏品系05-1和耐热品系05-4经高温处理不同时间的样品和不同组织样品以及10个耐热性不同的茄子品系(种)中,9个内参基因的表达丰度及稳定性存在差异;茄子热敏品系05-1和耐热品系05-4高温胁迫处理不同时间样品中表达稳定性最好的是SmEF1a和SmUCP;其不同组织中表达水平最稳定的是SmEF1a和SmTRX;高温胁迫下不同茄子品系(种)中以SmTRX和SmEF2的表达稳定性最好。综合来看,SmEF1a和SmTRX在所有茄子试验样品中的表达稳定性最好,而SmActin和SmCK I的表达稳定性较差。利用实时荧光定量
引用本文
庞强强1,2,3,李植良1,罗少波1,陈日远2,金庆敏1,黎振兴1,李德明3,孙保娟1,*,孙光闻2,*. 高温胁迫下茄子qRT-PCR内参基因筛选及稳定性分析[J]. 园艺学报, 2017, 44(3): 475-486.
PANG Qiangqiang1,2,3,LI Zhiliang1,LUO Shaobo1,CHEN Riyuan2,JIN Qingmin1,LI Zhenxing1,LI Deming3,SUN Baojuan1,*,and SUN Guangwen2,*. Selection and Stability Analysis of Reference Gene for qRT-PCRin Eggplant Under High Temperature Stress[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2017, 44(3): 475-486.
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