矮牵牛PDS基因的克隆及其在shRNA介导的基因沉默中的应用

杨 莎*，张 彬*，韩 垚，杨 霞，李名扬，郭余龙**

西南大学园艺园林学院，重庆市花卉工程技术中心，南方山地园艺学教育部重点实验室，重庆 400715

出版日期:2017-02-25发布日期:2017-02-25

Cloning of Petunia PDS Gene and Its Application in shRNA-mediated Gene Silencing

YANG Sha^*，ZHANG Bin^*，HAN Yao，YANG Xia，LI Mingyang，and GUO Yulong^**

Chongqing Engineering Research Center for Floriculture，Key Laboratory of Horticulture Science for Southern Mountainous Regions，Ministry of Education，College of Horticulture and Landscape Architecture，Southwest University，Chongqing，China

Online:2017-02-25Published:2017-02-25

摘要/Abstract

摘要： 以矮牵牛（Petunia hybrida）自交系‘Mitchell Diploid’（MD）为材料，通过3′ RACE和5′ RACE获得了其八氢番茄红素脱氢酶基因（PhPDS）的cDNA序列，进而通过PCR扩增出编码区的基因组序列。分析结果显示，PhPDS的cDNA序列全长2 182 bp，编码区序列1 746 bp，编码582个氨基酸。推测的蛋白质序列具有类胡萝卜素脱氢酶的保守结构域特征。编码区的基因组序列长7 609 bp，结构与番茄和拟南芥等PDS基因相似，具有14个外显子和13个内含子。利用博德研究所的小发夹RNA（shRNA）设计程序设计了两个针对PhPDS的shRNA，构建植物表达载体转化矮牵牛后，从其中一个载体的转化子中获得白色愈伤组织和幼枝，对白色幼枝的RT-PCR检测表明，其PDS基因的cDNA累积量减少，表明shRNA基因沉默技术能在矮牵牛中应用。以PDS基因为靶基因比用花色素合成基因研究基因沉默技术能更快地分析基因沉默的效果，全长序列的获得将有助于PDS基因在矮牵牛基因沉默技术研究中的应用。
中图分类号:
S 681.6

引用本文

杨 莎*，张 彬*，韩 垚，杨 霞，李名扬，郭余龙**. 矮牵牛PDS基因的克隆及其在shRNA介导的基因沉默中的应用[J]. 园艺学报, 2017, 44(2): 315-322.
YANG Sha*，ZHANG Bin*，HAN Yao，YANG Xia，LI Mingyang，and GUO Yulong**. Cloning of Petunia PDS Gene and Its Application in shRNA-mediated Gene Silencing[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2017, 44(2): 315-322.





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