苹果抗炭疽菌叶枯病基因SNP和InDel标记的HRM筛选
刘源霞1，兰进好2，柏素花3，孙晓红3，刘春晓1，张玉刚1，戴洪义1,*1青岛农业大学园艺学院，青岛市园艺植物遗传改良与育种重点实验室，山东青岛 266109；2青岛农业大学农学与植物保护学院，山东青岛 266109；3青岛农业大学生命科学学院，山东青岛 266109
出版日期:2017-02-25发布日期:2017-02-25基金资助:国家自然科学基金项目（31372032）；国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目（CARS-28-01-07）；山东省良种产业化工程项目（620902）；“泰山****”建设工程和青岛市民生科技计划项目（15-9-2-99-nsh，14-2-3-38-nsh）；‘十二五’国家科技支撑计划项目（2013BAD02B01）；山东省优秀中青年科学家科研奖励基金项目（BS2014SW027）Screening of SNP and InDel Markers to Glomerella Leaf Spot Resistance Gene Locus in Apple Using HRM Technology
LIU Yuanxia1，LAN Jinhao2，BAI Suhua3，SUN Xiaohong3，LIU Chunxiao1，ZHANG Yugang1，and DAI Hongyi1,*1Qingdao Key Laboratory of Genetic Improvement and Breeding in Horticultural Plants，College of Horticulture，Qingdao Agricultural University，Qingdao，Shandong 266109，China；2College of Agronomy and Crop Protection，Qingdao Agricultural University，Qingdao，Shandong 266109，China；3College of Life Sciences，Qingdao Agricultural University，Qingdao，Shandong 266109，China
Online:2017-02-25Published:2017-02-25摘要/Abstract
摘要： 以207株‘金冠’与‘富士’苹果的F1杂交分离群体实生树为试材，挑选抗炭疽菌叶枯病基因Rgls位点区域内的，第15条染色体上，位于SSR标记S0304673和S0405127之间500 kb物理距离内，由全基因组重测序技术所获得的与抗该病相关的10个SNP及10个InDel标记，通过高分辨率熔解曲线（High Resolution Melting，HRM）技术筛选出与基因Rgls位点紧密连锁的2个SNP及4个InDel标记。通过对重组个体的基因型及表型分析，发现标记InDel4227和InDel4254表现出与Rgls基因位点共分离，将基因Rgls精细定位于标记InDel4199 和SNP4299之间100 kb的物理距离内。对该基因位点两侧4.1 ~ 4.3 Mb距离内的基因进行统计分析，表明在该区段内存在40个有功能注释的基因，涉及到细胞组成、分子功能和生物过程方面共19个GO分类。
中图分类号:
S 661.1
引用本文
刘源霞1，兰进好2，柏素花3，孙晓红3，刘春晓1，张玉刚1，戴洪义1,*. 苹果抗炭疽菌叶枯病基因SNP和InDel标记的HRM筛选[J]. 园艺学报, 2017, 44(2): 215-222.
LIU Yuanxia1，LAN Jinhao2，BAI Suhua3，SUN Xiaohong3，LIU Chunxiao1，ZHANG Yugang1，and DAI Hongyi1,*. Screening of SNP and InDel Markers to Glomerella Leaf Spot Resistance Gene Locus in Apple Using HRM Technology[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2017, 44(2): 215-222.
PDF全文下载地址:
http://www.ahs.ac.cn/CN/article/downloadArticleFile.do?attachType=PDF&id=5770
