简介
研究方向
发表论著
承担科研项目
项目组情况
招生信息
杨运桂(YANG Yungui)
博士生导师,研究员,****科学基金获得者
E-Mail:ygyang@big.ac.cn
研究领域:基因组学、生物化学与分子生物学、生物信息学等
导师简介:学习经历:
1991年9月-1995年8月 复旦大学生命科学院 微生物学 理学学士学位
1995年9月-2000年8月 中国科学院上海药物所/上海生物工程研究中心 理学博士学位,导师:杨胜利教授/中国工程院院士
工作经历:
2008年11月至今,中科院北京基因组研究所,研究员
2005年11月-2008年11月,英国癌症研究署,博士后,导师:Tomas Lindhal教授/英国皇家科学院院士、2015诺贝尔化学奖得主
2000年9月-2005年11月,法国世界卫生组织国际癌症研究署,博士后/Staff Scientist,导师:汪兆琦教授/欧洲科学院院士
学术兼职:
DNA repair (Amsterdam) (2010-) 编委
Journal of Genetics and Genomics 编委(2017-)
RNA Biology 编委(2018-)
Genomics, Proteomics & Bioinformatics (Beijing) 编委(2010-),副主编(2015-)
中国生物化学与分子生物学RNA专业委员会副主任(2016-)
中国科学院北京基因组研究所第四届学术委员会主任(2017-)
中国科学院“器官重建与制造”A类战略性先导科技专项总体组专家(2017-)
国家自然科学基金委重大计划“生物大分子动态修饰与化学干预”指导专家组成员(2017-)
国家自然科学基金委重大研究计划“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”指导专家组成员(2018-)
中国生物化学与分子生物学会第十二届理事会常务理事兼副秘书长(2018-)
获奖及荣誉:
2012 中国科学院大学-BHPB 导师科研奖
2013 中国科学院青年科学家国际合作奖
2013 中国科学院朱李月华优秀教师奖
2015 中国科学院特聘研究员
2016 国家“****”科学基金获得者
2016 科技部创新人才推进计划-中青年科技创新领军人才
2017 国家“****”科技创新领军人才
2017 Sanofi-Cell Research优秀研究文章奖
2017 中国生命科学研究领域十大进展
2018 第三届中国科协优秀科技论文
2018 中国科学院优秀导师奖
2018 享受国务院政府特殊津贴专家
RNA表观遗传学特征、调控和功能
近期主要学术成果:
1. Chunxia Zhang, Yusheng Chen, Baofa Sun, Lu Wang, Ying Yang, Dongyuan Ma, Junhua Lv, Jian Heng, Yanyan Ding, Yuanyuan Xue, Xinyan Lu, Wen Xiao, Yun-Gui Yang* and Feng Liu*. m6A modulates haematopoietic stem and progenitor cell specification. Nature 549 (7671): 273-276(2017)(2017中国生命科学研究十大进展)
2. Wen XIAO, Samir ADHIKARI, Ujwal DAHAL, Yu-Sheng CHEN, Ya-Juan HAO, Bao-Fa SUN, Hui-Ying SUN, Ang LI, Xiao-Li PING, Wei-Yi LAI, Xing WANG, Chun-Min HUANG, Ying YANG, Guibin JIANG, Hai-Lin WANG, Qi ZHOU, Xiu-Jie WANG, Yong-Liang ZHAO, Yun-Gui YANG*. Nuclear m6A reader YTHDC1 regulates mRNA splicing. Mol Cell 61(4):507-519 (2016) (Hotspot in Trends In Genetics)
3. Tong CHEN, Ya-Juan HAO, Ying ZHANG, Miao-Miao LI, Meng WANG, Yongsheng WU, Ying LV, Jie HAO, Libin WANG, Ang LI, Ying YANG, Kang-Xuan JIN, Xu ZHAO, Yuhuan LI, Xiao-Li PING, Wei-Yi LAI, Li-Gang WU, Guibin JIANG, Hai-Lin WANG, Lisi SANG, Xiu-Jie WANG*, Yun-Gui YANG*, Qi ZHOU*. m6A RNA methylation is regulated by microRNAs and promotes reprogramming to pluripotency. Cell Stem Cell 16(3):289–301 (2015). (Cell Stem Cell 封面特别报道及Cell 出版社研究特色论文评论Cover story)
4. Xiao-Li PING, Bao-Fa SUN, Lu WANG, Wen XIAO, Xin YANG, Wen-Jia WANG, Samir ADHIKARI, Yue SHI, Ying LV, Yu-Sheng CHEN, Xu ZHAO, Ang LI, Ying YANG, Ujwal DAHAL, Xiao-Min LOU, Xi LIU, Jun HUANG, Wei-Ping YUAN, Xiao-Fan ZHU, Tao CHENG, Yong-Liang ZHAO, Xinquan WANG, Jannie DANIELSEN, Feng LIU*, Yun-Gui YANG*. Mammalian WTAP is a regulatory subunit of the RNA N6-methyladenosine methyltransferase. Cell Res 24(2):177–189(2014).(Natl Sci Rev 研究特色论文 Highlight in Natl Sci Rev)
5. Guanqun ZHENG, John DAHI, Yamei NIU, Peter FEDORCSAK, Chun-Min HUANG, Charles LI, Cathrine VAGBO, Yue SHI, Wen-Ling WANG, Shu-Hui SONG, Zhike LU, Ralph BOSMANS, Qing DAI, Ya-Juan HAO, Xin YANG, Wen-Ming ZHAO, Wei-Min TONG, Xiu-Jie WANG, Florian BOGDAN, Kari FURU, Ye FU, Guifang JIA, Xu ZHAO, Jun LIU, Hans KROKAN, Arne KLUNGLAND*, Yun-Gui YANG*, Chuan HE*. ALKBH5 is a mammalian RNA demethylase that impacts RNA metabolism and mouse fertility. Mol Cell 49(1):18-29 (2013).(Science 期刊高级编辑 Guy Riddihough 以 RNA 生物学研究前沿热点在 Science Editor’s Choice 评论)
1. 中国科学院前沿科学重点研究, RNA甲基化表观转录组学测序新技术和新理论,2017.05-2022.04,在研,主持;
2. 中国科学院-北京协和医院合作项目, 胰腺癌新机制研究及其精准临床诊治体系建立,2017/01-2019/12,在研,主持;
3. 中以NSFC-ISF合作研究项目,解析神经发育疾病基因MeCP2和LIS1相互作用的分子机制,2017.01-2019.12,在研,主持;
4. 国家“****”科学基金,基因表达调控与表观遗传学,2017.01-2021.12,在研,主持;
5. 国家重点研发计划精准医学研究重点专项,表观基因组学检测技术研发与临床应用,2016.07-2018.12,在研,主持;
6. 战略性先导科技专项-B类, 污染物诱发核酸损伤、修复与基因突变的分子机制,2014.07-2019.06,在研,骨干;
7. 国家自然科学基金重点项目,RNA m6A修饰甲基转移酶复合物及其表观调控因子鉴定和作用机制研究,2015.01-2019.12,在研,主持;
8. 国家自然科学基金面上项目, RNA表观遗传新机制调控DNA双链断裂修复分子机理研究,2014.01-2017.12,在研,主持;
9. 国家自然科学基金重大研究计划(集成项目),DNA与RNA甲基化表观修饰对单倍体干细胞多能性与发育能力影响的机制研究,2014.01-2016.12,已结题,参加;
10. 科技部 973,中国人前列腺癌的表观遗传特征及调控机制,2012.01-2016.09,已结题,骨干;
11. 科技部 973,组蛋白甲基化对肺癌发生发展的作用及其机制,2011.01-2015.12,已结题,主持;
12. 国家自然科学基金面上项目,ALKBH4加双氧酶介导的细胞分裂重要功能因子去甲基化机制研究,2011.01-2013.12,已结题,主持;
13. 国家自然科学基金面上项目,DNA损伤检验点和DNA双链断裂修复途径的相互协调维持基因组稳定性的分子机理的研究,2009.01-2011.12,已结题,主持;
课题组于2008年11月成立,系统研究表观转录组调控与RNA甲基化功能机理,在拓展RNA甲基化表观转录组调控的前沿新领域合作研究中,发现人源 RNA m6A修饰甲基转移酶复合物METTL3/METTL14/WTAP(Cell Res 2014 年,为 Natl Sci Rev 研究特色论文),揭示非编码miRNA介导的m6A甲基化位点形成的选择性机制(Cell Stem Cell 2015,入选当期封面特写报道和 Cell 出版社的研究特色论文),参与鉴定m6A去甲基化酶ALKBH5(Mol Cell 2013,作为 RNA 生物学研究前沿热点入选 Science Editor’s Choice)和FTO(Nat Chem Biol 2011),发现m6A修饰作为mRNA新顺式元件调控mRNA剪接和翻译功能(Cell Res 2014,为 Cell Res 研究特色论文;Mol Cell 2016,为Trends In Genetics Hotspot论文;Cell Res 2017),揭示m6A调控造血干细胞定向分化和精子发生减数分裂机制 (Nature 2017; Cell Res 2017, 入选当期封面特写报道);还发现了m5C修饰通过其结合蛋白ALYREF调控mRNA出核机制(Cell Res 2017, 入选当期封面特写报道)。这些结果表明RNA甲基化修饰具有可逆性并调控RNA加工代谢作用,拓展了RNA甲基化表观转录组前沿性领域,并应邀撰写多篇综述(Genom Prote Bioinfor 2013; Curr Diab Rep 2014; Sci Bull 2015; RNA Biol 2016)。
课题组研发RNA化学修饰高通量测序和分析技术,系统研究RNA甲基化及其修饰酶,阐明其功能及遗传性状(表型)和疾病关联的调控机制。
生化、分子、细胞、基因组学与生物信息学及理科类
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