简介
研究方向
发表论著
承担科研项目
项目组情况
招生信息
米双利(MI Shuangli)
博士生导师,研究员
E-Mail:mishl@big.ac.cn
研究领域:基因组学、生物化学与分子生物学
导师简介:学习经历:
1999年-2005年 北京大学 生命科学院 理学博士
工作经历:
2005年7月-2008年7月 Postdoctoral Fellow, Department of Medicine, Section of Hematology/Oncology, University of Chicago, USA
2008年7月-2009年8月 Postdoctoral Scholar/Research Associate, Pharmacogenetics Anticancer Agents Research Group, University of Chicago, USA
2009年8月至今 中国科学院北京基因组研究所 研究员 博士生导师
学术兼职:
获奖及荣誉:
1. 非编码RNA(microRNA, long-noncoding RNA等)在白血病的发生、发展及耐药机制中的作用;
2. 肿瘤细胞的外泌体RNA 分选机制及分子标志物研究,为精准医疗提供临床前转化研究;
3. 肠道菌群对代谢性疾病的调节作用。
近期主要学术成果:
1. Zheng Y, Shen W, Zhang J, Yang B, Liu YN, Qi HH, Yu X. Lul SY, Chen Y, Xu YZ, Lp Y, Gage FH, Mi SL*, Yao J*. CRISPR interference-based specific and efficient gene inactivation in the brain. Nature Neuroscience. 2018, 21: 447-454.
2. Mertens J, Wang QW, Kim Y, Yu Diana X, Pham S, Yang B, Zheng Y, Diffenderfer KE, Zhang J, Soltani S, Eames T, Schafer ST, Boyer L, Marchettto MC, Numberger JI, Calabrese LR, Odegaard KJ, Mccarthy MJ, Zandi PP, Alba M, Bievergelt CM, Mi SL, Brennabd KJ, Kelsoe JR, Gage FH, Yao J. Differential responses to lithium in hyperexcitable neurons from patients with bipolar disorder. Nature. 2015, 527: 95-99.
3. Zhang J, Li S, Li L, Li M, Guo CY, Yao J, Mi SL*. Exosomal MicroRNA: Trafficking, sorting and function. Genomics Proteomics Bioinformatics. 2015,13(1):17-24.
4. Mi SL, Zhang J, Zhang W, Huang RS. Circulating microRNAs as biomarkers for inflammatory diseases. MicroRNA. 2013, 2(1):64-72.
5. Wang QF, Wu G, Mi SL, He FH, Wu J, Dong JH, Luo RT, Mattison R, Kaberlein JJ, Prabhakar S, Ji HK, Thirman MJ. MLL Fusion Proteins Preferentially Regulate a Subset of Wild Type MLL Target Genes in the Leukemic Genome. Blood. 2011, 117: 6895-6905.
6. Wen YJ, Gamazon ER, Bleibel WK, Wing C, Mi SL, McIlwee BE, Delaney SM, Duan SW, Im HK, Dolan ME. An eQTL-based method identifies CTTN and ZMAT3 as pemetrexed susceptibility markers. Hum Mol Genet. 2012, 21: 1470-1480.
7. Tao Y, Ruan J, Yeh SH, Lu X, Wang Y, Zhai WW, Cai J, Ling SP, Gong Q, Chong ZC, Qu ZZ, Li QQ, Liu J, Yang J, Zheng CH, Zeng CQ, Wang HY, Zhang J, Wang SH, Hao LT, Dong LL, Li WJ, Sun M, Zou W, Yu CX, Li CH, Liu GJ, Jiang L, Xu J, Huang HW, Li CY, Mi SL, Zhang B, Chen BX, Zhao WM, Hu SN, Zhuang SM, Shen Y, Shi SH, Brown C, White KP, Chen DS, Chen PJ, Wu CI. Rapid growth of a hepatocellular carcinoma and the driving mutations revealed by cell-population genetic analysis of whole-genome data. P Natl Acad Sci USA. 2011, 108: 12042-12047.
8. Mi SL, Li ZJ, Chen P, He CJ, Cao DL, Elkahloun A, Lu J, Pelloso LA , Wunderlich M, Huang H. Aberrant overexpression and function of the miR-17-92 cluster in MLL-rearranged acute leukemia. P Natl Acad Sci USA. 2010, 107: 3710-3715.
9. Hartford CM, Duan SW, Delaney SM, Mi SL, Kistner EO, Lamba JK, Huang RS, Dolan ME. Population Specific Genetic Variants Important in Susceptibility to Cytarabine Arabinoside Cytotoxicity. Blood. 2009, 113: 2145-2153.
10. Duan SW, Mi SL, Zhang W, Dolan ME. Comprehensive analysis of the impact of SNPs and CNVs on human microRNAs and their regulatory genes. RNA biology. 2009, 6: 412-425. (* contribute equally)
11. Mi SL, Lu J, Sun M, Li ZJ, Zhang H, Neilly MB, Wang Y, Qian ZJ, Jin J, Zhang YM, Bohlander SK, Le Beau MM, Larson RA, Golub TR, Rowley JD, Chen JJ. MicroRNA expression signatures accurately discriminate acute lymphoblastic leukemia from acute myeloid leukemia. P Natl Acad Sci USA. 2007, 104: 19971-19976.
1. 北京市科技计划项目,基于肠道基因组学的血糖调控健康食品开发,2017-2019,在研,主持
2. 国家自然科学基金重大国际合作研究项目:利用开放科学数据云促进高通量肿瘤基因组研究,2012-2016,在研,主持;
3. 科技部973项目:DNA损伤响应重要蛋白维持基因组稳定性机制研究,2015-2019,在研,课题骨干
4. 科技部973项目:在肺癌微环境中表观遗传修饰对肺癌发展转移的作用机制,2011-2015,在研,课题骨干;
5. 国家自然科学基金面上项目:白血病异常融合蛋白MLL-ENL对小鼠细胞全基因组microRNA的表达调控研,2011-2013,结题,主持;
6. 教育部留学回国人员启动基金,主持。
目前对肿瘤发生的认识已经不仅停留在基因的序列变异和基因表达水平异常方面,而是有更多的表观遗传因素与其有关,造成了肿瘤的复杂性与治疗难度,是当前肿瘤研究的热点与重点。非编码RNA(non-coding RNA)是近年来发现的占基因组98%的重要组成部分,是表观遗传因素的一个主要方面,特别是它能够对基因组进行精确和多样的调控,使其引起了学界广泛的关注。本研究组利用转录组测序、ChIRP-seq等多种高通量测序手段探索非编码RNA(包括microRNA, long non-coding RNA等)在白血病的发生、发展、耐药,血细胞种系分化中的作用,并阐明其深层次机制。
外泌体(exosome)是新近发现的一类囊泡型细胞亚结构,内含多种核酸和蛋白成分,能够随体液循环并被受体细胞吸收,将内含物释放给受体细胞,调节受体细胞功能。肿瘤能够释放大量外泌体,并对肿瘤的发展、转移起到重要作用。由于肿瘤外泌体能够在血液中检出,成为新型的肿瘤诊断标志物。本研究组运用组学研究手段,鉴定外泌体的内容物组成,并阐明肺癌分泌的外泌体RNA如何影响肿瘤微环境,促进肿瘤发展。同时结合肺癌临床样本,找出适合中国人群的外泌体诊断分型标志物,为肺癌的精准医疗提供研究。
肠道微生态失衡与多种慢性疾病的发生相关。本研究组应用宏基因组测序技术,发展新型数据分析方法,对慢性疾病(如糖尿病、肿瘤、神经精神疾病等)人群的肠道菌群结构与平衡进行研究,为疾病的个性化预防和精准治疗提供理论依据。
欢迎分子与细胞生物学,遗传学,基因组学,生物信息学,医学专业背景的同学报考!
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