简介
研究方向
发表论著
承担科研项目
项目组情况
招生信息

蒋岚(JIANG Lan)
博士生导师，研究员
E-Mail：jiangl@big.ac.cn
研究领域：基因组学 生物信息学
导师简介：学习经历：
2001年9月-2005年7月 武汉大学 国土资源管理专业（计算机双学位） 理学学士学位
2007年9月-2013年7月 北京基因组研究所 基因组学 博士学位
工作经历：
2018至今 中国科学院北京基因组研究所 研究员 博士生导师
2013年- 2018年 哈佛医学院 博士后研究员
2005年- 2007年 北京华大基因研究中心 生物信息工程师
学术兼职：

获奖及荣誉：
2017年 Charles A. King Trust Postdoctoral Research Fellowship
2017年 Harvard Medical School Epigenetics Travel Grant
2014年 中国科学院百篇优秀博士论文
2013年 吴瑞奖学金
2013年 中国科学院院长特别奖


表观遗传学、干细胞、肿瘤、神经科学

近期主要学术成果：
*Equal contribution
1. Djekide M, Inoue A, Matoba S, Suzuk T, Zhang C, Lu F, Jiang L, and Zhang Y. (2018) Cell Report. Reprogramming of chromatin accessibility in somatic cell nuclear transfer is DNA replication independent. PMID: **
2. Jiang L, Daphne T, Yuan GC. (2018) Cell Systems. Assessing Inequality in Transcriptomic Data. PMID: **
3. Inoue A, Jiang L, Lu F, and Zhang Y. (2017) Genes Dev. Genomic imprinting of Xist by maternal H3K27me3. PMID: **
4. Inoue A*, Jiang L*, Lu F*, Suzuki T, and Zhang Y. (2017) Nature. Maternal H3K27me3 controls DNA methylation-independent genomic imprinting. PMID: **
5. Chen R*, Wu X*, Jiang L*, and Zhang Y. (2017) Cell Report. Single-cell RNA-seq reveals hypothalamic cell diversity. PMID: **
6. Jiang L, Chen H, Pinello L, Yuan GC. (2016) Genome Biol. GiniClust: detecting rare cell types from single-cell gene expression data with Gini index. PMID: **.
7. Kim TH, Saadatpour A, Guo G, Saxena M, Cavazza A, Desai N, Jadhav U, Jiang L, Rivera MN, Orkin SH, Yuan GC, Shivdasani RA. Single-Cell Transcript Profiles Reveal Multilineage Priming in Early Progenitors Derived from Lgr5(+) Intestinal Stem Cells. (2016) Cell Rep. PMID: **.
8. Wang K, Ma Q, Jiang L, Lai S, Lu X, Hou Y, Wu CI, Ruan J. (2016) BMC Genomics. Ultra-precise detection of mutations by droplet-based amplification of circularized DNA. PMID: **
9. Lu F*, Liu Y*, Jiang L*, Yamaguchi S, Zhang Y. Role of Tet proteins in enhancer activity and telomere elongation. (2014) Genes Dev. PMID: **.
Comment in:
Epigenetics: Enhancers under TET control. [Nat Rev Mol Cell Biol. 2014]
10. Jiang L*, Zhang J*, Wang JJ*, Wang L, Zhang L, Li G, Yang X, Ma X, Sun X, Cai J, Zhang J, Huang X, Yu M, Wang X, Liu F, Wu CI, He C, Zhang B, Ci W, Liu J. Sperm, but not oocyte, DNA methylome is inherited by zebrafish early embryos. (2013) Cell. PMID: **.
Comment in:
Beyond DNA: programming and inheritance of parental methylomes. [Cell. 2013]
Development: Zebrafish early methylomes. [Nat Rev Genet. 2013]
11. Ruan J*, Jiang L*, Chong Z*, Gong Q*, Li H, Li C, Tao Y, Zheng C, Zhai W, Turissini D, Cannon CH, Lu X, Wu CI. Pseudo-Sanger sequencing: massively parallel production of long and near error-free reads using NGS technology. (2013) BMC Genomics. PMID: **.
12. Wang L*, Jiang L*, Hu S, Wang Y. Characterization of evolutionarily conserved microRNAs in amphioxus. (2010) Genomics Proteomics Bioinformatics. PMID: **.
13. Tao Y, Ruan J, Yeh SH, et al. (Author #28/44). Rapid growth of a hepatocellular carcinoma and the driving mutations revealed by cell-population genetic analysis of whole-genome data. (2011) PNAS. PMID: **.
14. Xia Q, Guo Y, Zhang Z, et al. (Author #20/58). Complete resequencing of 40 genomes reveals domestication events and genes in silkworm. (2009) Science. PMID: **.
15. Chong Z, Zhai W, Li C, Gao M, Gong Q, Ruan J, Li J, Jiang L, Lv X, Hungate E, Wu CI. The evolution of small insertions and deletions in the coding genes of Drosophila melanogaster. (2013) Mol Biol Evol. PMID: **.




　　经典的遗传学和演化理论告诉我们，基因的随机突变导致物种性状的多样性，自然选择筛选最具适应性的表型。然而，单纯的基于DNA序列的遗传学并不足以解释自然界中看到的物种表型的极大丰富性。例如，多细胞生物在发育过程中可以基于同一套基因组建立起多种功能特异的细胞类型；即使是使用克隆技术生出的猫，毛色也会有差异；营养状态的不同，会导致同一基因型的蜜蜂卵，分别发育成工蜂和蜂后。随着近年来表观遗传学（epigenetics）研究的发展，越来越多的证据表明，表观遗传学信息，例如DNA碱基和染色质组蛋白上的修饰，参与了物种对环境快速变化的适应，并有可能充当了性状的代际遗传的媒介。 课题组负责人围绕着“非DNA序列的遗传信息在代际之间遗传的机制和功能”这一核心议题，在博士研究生期间和博士后训练期间，各有一项代表性成果, 分别发表在Cell和Nature上。
　　组蛋白修饰介导的印记基因是在哺乳动物中首次被报道，在表观遗传学方向开拓了全新的重要研究方向。后续有很多工作迫切的需要展开进行。课题组负责人计划使用先进的表观基因组学，合成生物学，单细胞转录组学，以及进化生物学等多种手段，对这种新的印记基因机制进行系统分析，以期使我们对于印记基因的机制，功能和进化有更深入的理解，使得我国在该领域的基础研究处于国际领先地位。同时，这些研究成果，将可以为治疗印记基因相关的人类疾病，包括癌症，提供新的思路，促进开发新的治疗方案，从而产生重要的医学健康产业影响。
　　A）表观组学大数据整合用于印记基因的调控区域的鉴定和特征分析
　　B）发展表观基因组编辑工具测试印记基因控制区域的功能
　　C）高通量单细胞转录组技术用于绘制哺乳动物中细胞类型特异的印记基因图谱
　　课题组长个人简介：
　　蒋岚，2013年毕业于中国科学院北京基因组研究所，获得博士学位，师从吴仲义教授（中研院院士）和刘江教授。在哈佛大学医学院波士顿儿童医院从事博士后研究，师从表观遗传学领域著名HHMI研究员张毅教授。主要以高通量测序和生物信息学为手段，对表观遗传学修饰在胚胎发育，干细胞维持以及癌症异质性中的作用和机理进行研究。迄今为止以第一作者或者并列第一作者在Cell, Nature, Genome Biology, Cell Report, Gene Dev等杂志发表学术论文7篇，其他共同作者文章9篇。博士研究生期间获得被誉为华人生物学在读博士最高奖的吴瑞奖学金，以及中科院院长特别奖，中科院百篇优秀博士论文等奖项。博士后研究获得美国Charles A. King Trust Postdoctoral Research Fellowship 资助。


生物学、计算机及相关专业