石婷 副研究员

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邮箱：tshi@sjtu.edu.cn
地址：生命药学楼4-331





学术经历
2007.07-2010.07 中科院上海药物研究所博士后
2010.07-2013.07 上海交通大学医学院 助理研究员
2013.07-至今 上海交通大学生命科学技术学院 副研究员


2007.07-2010.07 中科院上海药物研究所博士后
2010.07-2013.07 上海交通大学医学院 助理研究员
2013.07-至今 上海交通大学生命科学技术学院 副研究员





研究方向
酶催化机制


酶定向改造


生物信息学分析


分子结构优化






运用计算生物学从分子/原子水平解析关键酶的催化机制


酶设计改造


生物信息学分析


分子结构优化及相互作用分析






研究方向

酶催化机制 运用计算生物学从分子/原子水平解析关键酶的催化机制



酶定向改造 酶设计改造



生物信息学分析 生物信息学分析



分子结构优化 分子结构优化及相互作用分析











代表论著
? Theoretical Studies on the Catalytic Mechanism and Substrate Diversity for Macrocyclization of Pikromycin Thioesterase

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? Theoretical Investigation of the Structural Characteristics in the Active State of Akt1 Kinase

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? Insight into Structural Characteristics of Protein-Substrate Interaction in Pimaricin Thioesterase

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? Hybrubins: Bipyrrole Tetramic Acids Obtained by Crosstalk between a Truncated Undecylprodigiosin Pathway and Heterologous Tetramic Acid Biosynthetic Genes

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? Features of S-nitrosylation based on statistical analysis and molecular dynamics simulation: cysteine acidity, surrounding basicity, steric hindrance and local flexibility

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? Engineering of lysine cyclodeaminase conformational dynamics for relieving substrate and product inhibitions in the biosynthesis of L-pipecolic acid

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? DNA gated photochromism and fluorescent switch in a thiazole orange modified diarylethene

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? Exploring the Desumoylation Process of SENP1: A Study Combined MD Simulations with QM/MM Calculations on SENP1-SUMO1-RanGAP1

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? Structural basis for the transcriptional repressor NicR2 in nicotine degradation from Pseudomonas

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? Theoretical Studies on the Mechanism, Enantioselectivity, and Axial Ligand Effect of a Ru(salen)-Catalyzed Asymmetric Cyclopropanation Reaction

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获奖情况
2016年度、2017年度上海交通大学“优秀班主任”称号
2018年上海交通大学生命科学技术学院“第三届教师教学竞赛”二等奖
2018年上海交通大学“第三届青年教师教学竞赛”三等奖




教学情况

曾任课"分子模拟"、"高级生物信息学"、"计算生物学"等
现授课本科生"自然科学基础"




1.匹马霉素硫酯酶的链释放机制解析与定向优化，19ZR** 20万 2019.01-2022.12上海市自然科学基金项目 主持
2 图像智能优化辅助斑点追踪超声心动图及全外显子基因测序以建立儿童肥厚型心肌病的高危预测体系 ZH2018ZDA26 24/100万 2019.01-2022.12 上海交通大学 合作者
3 ANP32B 在子痫前期早期预防、诊断与治疗中的应用性研究 YG2016MS42 7/20万 2017.01-2019.12 上海交通大学 合作者
4 蛋白质模拟与结构预测分析 SA** 30万 2016.01-2018.12 南京工业大学 主持
5 新型SENP1抑制剂的设计、合成及抗前列腺癌活性的研究 13YZ032 8万 2013.01-2015.12 上海教委一般项目 主持
6 重编程造血细胞的基础与临床应用研究 2013CB967400 1070万 2013.01-2017.12 973项目 参与

承担项目


学生培养
刘 雷 硕士生
陶文弢 硕士生
余 倩 硕士生




李佳琪 硕士生
范烁冰 硕士生
张馥雅 本科生
皮云龙 本科生
鲁培声 本科生
陶文弢 本科生
王如凡 本科生
李 琛 本科生





在读学生
毕业学生



在读学生
毕业学生

刘 雷 硕士生
陶文弢 硕士生
余 倩 硕士生




李佳琪 硕士生
范烁冰 硕士生
张馥雅 本科生
皮云龙 本科生
鲁培声 本科生
陶文弢 本科生
王如凡 本科生
李 琛 本科生