童垚俊 长聘教轨副教授

电话：+86-**
邮箱：yaojun.tong@sjtu.edu.cn
地址：上海市闵行区东川路800号，生命科学技术学院，4C-208
实验室网址：under construction
https://yaojuntong.com微生物合成生物学实验室致力于深度开发合成生物学使能工具，并用其去工程化设计，改造，定制绿色智能微生物细胞工厂，对接活性化合物生产，环境治理，疾病治疗等领域。欢迎具有分子生物学，微生物，代谢工程，合成生物学和计算生物学背景的同学加盟！
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学术经历
教育背景：
2008.09-2013.09,中国科学院微生物研究所，理学博士。
2004.09-2008.06,北京科技大学，理学学士。
工作经历：
2020.12-今，上海交通大学生命科学技术学院，博导，长聘教轨副教授。
2016.02-2020.12,The Novo Nordisk Foundation Center forBiosustainability, Technical University of Denmark.研究员（助理教授）
2013.09-2016.02, The Novo Nordisk Foundation Center forBiosustainability, Technical University of Denmark.博士后,合作导师：Sang Yup Lee院士和Tilmann Weber教授。






教育背景：
2008.09-2013.09,中国科学院微生物研究所，理学博士。
2004.09-2008.06,北京科技大学，理学学士。
工作经历：
2020.12-今，上海交通大学生命科学技术学院，博导，长聘教轨副教授。
2016.02-2020.12,The Novo Nordisk Foundation Center forBiosustainability, Technical University of Denmark.研究员（助理教授）
2013.09-2016.02, The Novo Nordisk Foundation Center forBiosustainability, Technical University of Denmark.博士后,合作导师：Sang Yup Lee院士和Tilmann Weber教授。





研究方向
1.微生物合成生物学使能工具深度开发。


2.智能微生物细胞工厂设计，构建和应用。


3.社会微生物学。






基于CRISPR等的合成生物学工具深度开发，动态转录翻译调控平台的搭建等。


充分应用自主开发的使能工具结合计算生物学设计构建可与重要生物活性化合物绿色智能制造，重要环境污染物降解以及疾病治疗领域对接的微生物细胞工厂。


研究微生物个体在群体中的决策，社会性行为，以及潜在的在生物技术以及合成生物学中的应用价值。






研究方向

1.微生物合成生物学使能工具深度开发。 基于CRISPR等的合成生物学工具深度开发，动态转录翻译调控平台的搭建等。



2.智能微生物细胞工厂设计，构建和应用。 充分应用自主开发的使能工具结合计算生物学设计构建可与重要生物活性化合物绿色智能制造，重要环境污染物降解以及疾病治疗领域对接的微生物细胞工厂。



3.社会微生物学。 研究微生物个体在群体中的决策，社会性行为，以及潜在的在生物技术以及合成生物学中的应用价值。











代表论著
? Tong, Y.*,#, Zhang, J.#, Sun, N.#, Wang, X.#, Wei, Q., Zhang, Y., Huang, R., Pu, Y., Dai, H., Ren, B., Pei, G., Song, F., Zhu, G., Wang, X., Xia, X., Chen, X., Jiang, L., Zhang, J., Ouyang, L., Zhang, B., Jiang, Y., Liu, X., Calderone, R., Bai, F., Zhang, L., Alterovitz, G. Berberine reverses multidrug resistance inCandida albicansby hijacking the drug efflux pump Mdr1p.Science Bulletin. (2020). in press.

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? Tong, Y.*, Deng, Z.*, An aurora of natural products-based drug discovery is coming.Synth. Syst. Biotechnol.5, 92-96. (2020).

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? Tong, Y., Whitford, C. M., Blin, K., Jørgensen, T. S., Weber, T.*, Lee, S. Y.* CRISPR-Cas9-based, CRISPRi, and CRISPR-BEST-mediated genetic manipulation in streptomycetes.Nature Protocols.15, 2470-2502.(2020).

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? Tong, Y., Whitford, C. M., Robertsen, H. L., Blin, K., Jørgensen, T. S., Klitgaard, A. K., Weber, T.*, Lee, S. Y.*Highly efficient DSB-free base editing for streptomycetes with CRISPR-BEST.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.,116,20366-20375 (2019).

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? Palazzotto, E.,Tong, Y., Lee, S. Y., Weber, T.* Synthetic biology and metabolic engineering of actinomycetes for natural product discovery.Biotechnol. Adv.37, 107366. (2019).

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? Tong, Y., Weber, T.*, Lee, S. Y.* CRISPR/Cas-based genome engineering in natural product discovery.Nat. Prod. Rep.36,1262-1280 (2019).Journal cover paper.

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? Tong, Y., Robertsen, H. L., Blin, K., Weber, T.*, Lee, S. Y.* CRISPR-Cas9 Toolkit for Actinomycete Genome Editing.Methods Mol. Biol.1671, 163-184. (2018). Book chapter.

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? Tong, Y., Charusanti, P., Zhang, L., Weber, T.*, Lee, S. Y.* CRISPR-Cas9 Based Engineering of Actinomycetal Genomes.ACS Synth. Biol.4,1020-1029 (2015).Journal cover paper.ESI highly cited paper.

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? Tong, Y.*,^#, Liu, M.^#, Zhang, Y., Liu, X., Huang, R., Song, F., Dai, H., Ren, B., Sun, N., Pei, G., Bian, J., Jia, X-M., Huang, G., Zhou, X., Li, S., Zhang, B., Fukuda, T., Tomoda, H.,ōmura, S., Cannon, R.D., Calderone, R., Zhang, L.* Beauvericin counteracted multi-drug resistant Candida albicans by blocking ABC transporters. Synth. Syst. Biotechnol. 1, 158-168. (2016).

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? Tong, Y.^#, Cao, C.^#, Xie, J., Ni, J., Guan, G., Tao, L., Zhang, L., Huang, G.* N-acetylglucosamine-induced white-to-opaque switching in Candida albicans is independent of the Wor2 transcription factor. Fungal Genet. Biol. 62, 71-77. (2014).

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获奖情况
Best publication award of Novo Nordisk Foundation Center for Biosustainability,2015
Best innovation award of Novo Nordisk Foundation Center for Biosustainability, 2015