魏冬青 长聘教授

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邮箱：dqwei@sjtu.edu.cn





学术经历
1987年7月在美属波多黎各大学获博士学位
1987年8月-1992年12月加拿大不列颠哥伦比亚大学做博士后研究和研究****
1993年1月-2006年2月加拿大计算及其应用研究中心，任研究员
2000年2月-2000年7月北京大学教授
2000年8月-2006年2月蒙特利尔理工学院教授
2002年1月起任加拿大康克迪亚大学分子设计研究中心成员(兼职)
2003年1月-2006年1月，天津市及天津师大****（海河****），天津大学博士生导师，生物信息与药物开发研究所所长
2006年2月起任上海交通大学生物信息与生物统计系教授，博士生导师，副主任，以及微生物代谢国家重点实验室成员


1987年7月在美属波多黎各大学获博士学位
1987年8月-1992年12月加拿大不列颠哥伦比亚大学做博士后研究和研究****
1993年1月-2006年2月加拿大计算及其应用研究中心，任研究员
2000年2月-2000年7月北京大学教授
2000年8月-2006年2月蒙特利尔理工学院教授
2002年1月起任加拿大康克迪亚大学分子设计研究中心成员(兼职)
2003年1月-2006年1月，天津市及天津师大****（海河****），天津大学博士生导师，生物信息与药物开发研究所所长
2006年2月起任上海交通大学生物信息与生物统计系教授，博士生导师，副主任，以及微生物代谢国家重点实验室成员





代表论著
? Cited 28 times -Jing Chang, Peng Lian, Dong-Qing Wei*, Xiang-Rong Chen, Zizheng Gong and Qingming Zhang, “Thermal decomposition of the solid phase of nitromethane: Ab initio molecular dynamics simulations”, Phys. Rev. Lett. 105, 188302 -188305(2010).

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? Cited 20 times -Ruo-Xu Gu, Limin Angela Liu*, and Dong-Qing Wei*, “Free Energy Calculations on the Two Drug Binding Sites in the M2 Proton Channel”, J. Am. Chem. Soc., 133 (28), 10817–10825(2011).

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? Cited 25 times - Shigao Chen, Ruoxu Gu* and Dong-Qing Wei*, “Virtual Screening with Respect to alpha7 Nicotinic Acetylcholine Receptor for Possible Leads against Alzheimer's disease”, Journal of Molecular Graphics and Modeling, 39, 98-107(2013).

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? Cited 24 times - Jue Li, Dong-Qing Wei*, Jing-Fang Wang*, and Yi-Xue Li, “A Negative Cooperativity Mechanism of Human CYP2E1 Inferred from Molecular Dynamics Simulations and Free Energy Calculations”, J. Chem. Info. Model., 51 (12), 3217–3225(2011).

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? Cited 10 times - Ruo-Xu Gu, Limin A. Liu, Yong-Hua Wang*, Qin Xu, Dong-Qing Wei*,“Structural comparison of the wild type and drug resistant mutants of the influenza M2 proton channel by molecular dynamics simulations”，J. Phys. Chem. B., 117 (20), 6042–6051(2013).

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? Cited 6 times - Peng Lian, Jue Li, Dongqi Wang* and Dong-Qing Wei, “Car-Parrinello Molecular Dynamics/Molecular Mechanics (CPMD/MM) Simulation study of coupling and uncoupling mechanisms of Cytochrome P450cam”, J. Phys. Chem. B., 117, (2013).

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? Cited 5 times - Ying Wang, Xiao-Lin Wu*, Dong-Qing Wei*, Jing-Fang Wang*, Yi-Xue Li, “Auto-inhibitory Mechanism for Mutation-Induced Impaired FGF Signaling”, J. Chem. Inf. Model., 52(9), 2422-9(2012).

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? Cited 5 times - Maoping Tang, Zhaoxia Wang, Ying Zhou, Wangjie Xu, Shengtian Li,Lianyun Wang, Dong-Qing Wei*, Zhongdong Qiao*, “A novel drug candidate for Alzheimer disease treatment - gx-50 derived from Zanthoxylum Bungeanum”, J. Alzheimer’s Disease, 34, 203–213 (2013).

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? Cited 5 times -Yukun Wang, Tangzheng Zhao, Dong-Qing Wei*, Erik Strandberg, Anne Ulrich, Jakob Ulmschneider*, “How reliable are molecular dynamics simulations of membrane active antimicrobial peptides?”, BBA – Biomembranes， 1838(9), 2280–2288(2014).

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? Cited 3 times - Qi Chen , John K. Buolamwini , Jeremy C. Smith , Aixiu Li , Qin Xu , Xiaolin Cheng* , and Dong-Qing Wei*, “Impact of Resistance Mutations on Inhibitor Binding to HIV-1 Integrase”，J. Chem. Inf. Model., 53 (12), 3297–3307(2013).

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获奖情况
作为大会主席主持召开2008年理论与计算化学国际会议(Theory and Application of Computational Chemistry(TACC) 2008, ****参会，60个大会报告，2/3来自国外，是我国该本领域的盛会)，第二届IEEE生物信息学及生物医学工程大会( Bioinformatics and Biomedical Engineering Conferences， 2009), 以及2009-2013年计算与系统生物学国际会议（ International Conference on Computational and System Biology）。获得第五届焦善庆研究奖，2011年上海交大横山亮次奖，2010以及2011年两次获上海交大推荐申报教育部“十大科技进展”（985 高校每年推荐3人）。




完成国家863项目:“药物代谢酶SNPs与药物的类药性一体化预测软件的研究与开发”, 以及8个国家自然科学基金项目以及2个省部级重点项目。
最近完成的科研项目：
“药物代谢酶SNPs与药物的类药性一体化预测软件的研究与开发”, 国家863计划生物信息专项，项目编号：2007AA02Z333，2007-2011，264万元， 项目负责人。
“阿尔茨海默氏症天然药物的设计、筛选以及相关的理论研究”，国家自然科学基金，项目编号：**, 2009-2011，30万元，项目负责人。
“重大新药创制”科技重大专项“十一五”计划第二批课题, 综合性新药研究开发技术大平台, 9600万元, 项目编号2009ZX9301-007, 项目参与人。
“复杂环境化学反应体系的理论计算方法与应用研究”，国家自然科学基金，项目编号：**, 2008-2010，26万元，项目负责人。

承担项目