崔 立
职称：研究员
所属学科：预防兽医学
研究方向：人兽共患病与比较医学
电子信箱：lcui@sjtu.edu.cn
联系地址：东川路800号农业与生物学院A楼

个人简介：
预防兽医学博士，英国伦敦大学皇家兽医学院访问****；主要从事动物疾病模型、微生物与宿主互作、病毒宏基因组学等研究。主讲本科生和研究生的实验动物学和兽医分子流行病学等课程；近年指导研究生30余名，发表SCI论文45篇。中国比较医学杂志、中国实验动物学报编委（2018-2022）；亚洲兽医病例研究编委（2017-2020）;PLOS ONE, Epidemiology and Infection，Pakistan Journal of Zoology, Journal of Veterinary Science，Journal of Public Health and Epidemiology等杂志特约审稿人。
主要成果：
（1）实验用小型猪SPF种群净化技术及疾病模型的建立。主持完成国家十五攻关项目“中国实验用小型猪资源开发和研究应用-子课题”。
（2）猪戊型肝炎病毒、猪萨佩罗病毒等与宿主互作机制。主持完成国家自然科学基金项目“肝细胞表面猪戊型肝炎病毒候选受体的筛选和鉴定”，参与完成国家自然科学基金项目“猪萨佩罗病毒受体的筛选与互作关键位点鉴定”及“猪札幌病毒受体鉴定的研究”；主持完成上海市科委标准化技术专项“生猪屠宰产品中猪戊型肝炎病毒检测技术标准制定”及家畜疫病病原学国家重点实验室开放基金“VOPBA法鉴定人/猪肝细胞表面与猪戊型肝炎病毒互作蛋白”，上海市科委科技攻关计划重点项目“戊型肝炎阻断技术研究”。研究成果对揭示猪HEV及PSV致病机理及其与宿主细胞互作机制，了解HEV跨种间（人/猪）感染与传播等问题提供有价值的证据。
（3）近年在国家重点研发计划“重要疫源微生物组学研究”的支持下，采用病毒宏基因组学方法构建病毒基因文库，结合高通量测序和生物信息学分析，开展了不同宿主不同健康状态体内病毒群落初步分析，已完成冠心病患者与健康人群的肠道细菌组与病毒组比较、传播媒介蜱在不同地域携带病毒多样性分析、腹泻仔猪及腹泻儿童肠道病毒组学多样性和演化规律，对未来继续研究病毒组在疾病发展中的的功能、病毒-细菌共感染和病毒与宿主基因互作，以及对潜在性致病病毒的预防奠定基础。
获奖：2018年江苏省科学技术奖励三等奖“人兽共患戊型肝炎病毒流行规律及跨种间传播机制”排名第二；2011年上海市科学进步三等奖“戊型肝炎病原学、流行病学、致病机制和综合防治技术的研究”排名第二；201年教育部科技进步二等奖“附红细胞体病原学和综合防治技术研究”排名第三；2003年上海市科技进步二等奖“生物医学实验用清洁级猪的培育”排名第三。
近期代表性论文：
1. Shuyu Zheng, Tingting Zhao, Shuijuan Yuan, Lingyu Yang, Jinmei Ding and Li Cui*，Crosstalk between gut microbiota and immune deficiency – an observation of dynamic microbial shift in immunodeficient mice, Frontiers in Microbiology，2019.9accepted
2. Tingting Zhao, Xiaojuan Shen, Haiyan Gong, Wen Zhang, Tongling Shan, Xiangqian Yu, Seongjin Wang, Li Cui, Virome Comparisons in Ticks from Different Domestic Animals, Virologica Sinica,2019.10accepted
3. Seong Jin Wang, Xue Wei liu, Xiaojuan Shen, Xiu guo hua, Li cui*, Epidemiological and molecular analysis of avian influenza A(H7N9) virus in Shanghai, China, 2013–2017，Infection and Drug Resistance 2018:11 2411–2424
4. Tingting Zhao, Xiaojuan Shen, Chang Dai, Li Cui* ，Benefits of procyanidins on gut microbiota in Bama minipigs and implications in replacing antibiotics，J Vet Sci 2018; 19(6): 798-807
5. Li Cui* Tingting Zhao，Haibing Hu，Wen Zhang，Xiuguo Hua . Association Study of Gut Flora in Coronary Heart Disease through High-Throughput Sequencing，BioMed research international 2017：**.
6. Guo L, Hua X, Zhang W, Yang S, Shen Q, Hu H, Li J, Liu Z, Wang X, Wang H, Zhou C, Cui L*. Viral metagenomics analysis of feces from coronary heart disease patients reveals the genetic diversity of the Microviridae (J). Virologica Sinica, 2017, 32(2):130-138.
7. 沈小娟, 李晶娇, 边疆, 赵婷婷, 华修国, 崔立*. 腹泻仔猪肠道病毒组学分析[J]. 畜牧兽医学报, 2019, 50(3): 611-619.
8. 郭靓骅,吴孔菊,华修国，崔立*.病毒宏基因组学方法鉴定出小熊猫粪便中一株新型指环状病毒[J].上海交通大学学报（农业科学版）,2018,35(1):14-19.
9. LI J, Cui L, Deng X, Yu X, Zhang Z, Yang Z, Delwart E, Zhang W, Hua X. Canine Bufavirus in feces and plasma of dogs with diarrhea, China(J). Emerging Microbes & Infections. 2019, 1(8):245-247.
10. Li J, Zhang W, Cui L, Shen Q, Hua X. Metagenomic identification, genetic characterization and genotyping of porcine sapoviruses(J). Infection Genetics & Evolution Journal of Molecular Epidemiology & Evolutionary Genetics in Infectious Diseases, 2018, 62.
11. Li J, Shen Q, Zhang W, Zhao T, Li Y, Jiang J, Yu X, Guo Z, Cui L, Hua X. Genomic organization and recombination analysis of a porcine sapovirus identified from a piglet with diarrhea in China(J). Virology Journal, 2017, 14(1):57.
12. Ling Y, Zhang X, Qi G, Yang S, Li J, Shen Q, Wang X, Cui L, Hua X, Deng X, Delwart E, Zhang W. Viral metagenomics reveals significant viruses in the genital tract of apparently healthy dairy cows(J). Archives of Virology, 2019, DOI: https://doi.org/10.1007/s00705-019-04158-4.
13. Wang H, Li S, Mahmood A, Yang S, Wang X, Shen Q, Shan T, Deng X, Li J, Hua X, Cui L, Delwart E, Zhang W. Plasma virome of cattle from forest region revealed diverse small circular ssDNA viral genomes(J). Virology Journal, 2018, 15(1):11.
14. Zhang et al. Virome comparisons in wild-diseased and healthy captive giant pandas, Microbiome (2017) 5:90 DOI 10.1186/s40168-017-0308-0
著作：
主编国家职业资格培训教材：宠物健康护理员（基础知识）；宠物健康护理员（高级）
主编上海市职业技术及职业资格培训教材：宠物健康护理员（初级中级高级）
参编 全国高等农林院校十三五规划教材：兽医高级病理学（研究生）