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中国科学院上海药物研究所导师教师师资介绍简介-黄宇

本站小编 Free考研考试/2021-02-10
xm:黄宇
xb:男
zc:研究员
xl:博士
dh:
cz:
dzyj:yuhuang@simm.ac.cn
grzy:http://www.yfish.org/
zjlb:研究员；新药；
zw:研究组长
txdz:上海市浦东新区海科路501号　201203
grjj:团队研究方向是个性化药物开发中的生物信息算法和模型开发。我们与合作团队，在临床病人、PDX、细胞株等不同层面收集大量的组学和药物响应数据，开发先进的人工智能算法和模型，揭示不同疾病的致病机制，从而发现潜在药物靶标和预测药物响应差异的标志物，加速个性化药物的开发和上市。
加入药物所之前，黄宇在美国Illumina 公司生物信息科学家，从事开发DNA甲基化BaseSpace(云计算)-App 及其应用到检测癌症取得一系列科研成果。2010年在计算生物鼻祖Prof. Michael Waterman创建的南加州大学计算生物系获得生物信息博士学位，从事统计模型和算法研究，并在2010年在Nature上发表第一个非人类GWAS研究成果。后在加利福尼亚大学洛杉矶分校担任博士后，从事1000个黑脸猴（Vervet）基因组研究，共同研制出第一个非人灵长类群体基因资源，第一个复杂系谱Trait Mapping。

教育经历：

2003.8 - 2010.10 美国南加州大学，计算生物学，博士

1999.9 - 2003.7 复旦大学，生物科学，学士


yjfx:1.计算生物学中的人工智能算法和模型：组学数据建模，药物靶标和标志物发现。
2.个性化药物数据挖掘: Biomarker/靶标发现、组学层面细分和优化药物目标病人群体、研究耐药机制。
dblz:1.Z Luo*, X Fan*, Y Su, YS Huang# (2018) Accurity: accurate tumor purity and ploidy inference from tumor-normal WGS data by jointly modelling somatic copy number alterations and heterozygous germline single-nucleotide-variants. Bioinformatics

2.YS Huang, V Ramensky, et al., Nelson Freimer (2015) Sequencing strategies and characterization of 721 vervet monkey genomes for future genetic analyses of medically relevant traits. BMC Biology

3.MW Horton, AM Hancock*, YS Huang*, C Toomajian*, S Atwell, A Auton, NW Muliyati, A Platt, FG Sperone, BJ Vilhjálmsson, M Nordborg, JO Borevitz, J Bergelson (2012): Genome-wide patterns of genetic variation in worldwide Arabidopsis thaliana accessions from the RegMap panel. Nature Genetics

4.YS Huang#, M Horton, BJ Vilhjálmsson, ü Seren, D Meng, C Meyer, MA Amer, JO Borevitz, J Bergelson, M Nordborg (2011): Analysis and visualization of Arabidopsis thaliana GWAS using web 2.0 technologies. Database

5.S Atwell*, YS Huang*, BJ Vilhjálmsson*, G Willems*, M Horton, Y Li, D Meng, A Platt, A Tarone, TT. Hu, R Jiang, NW Muliyati, X Zhang, MAi Amer, I Baxter, B Brachi, J Chory, C Dean, M Debieu, J de Meaux, JR Ecker, N Faure, JM Kniskern, JD Jones, T Michael, A Nemri, F Roux, DE Salt, C Tang, M Todesco, MB Traw, D Weigel, P Marjoram, JO Borevitz, J Bergelson, M Nordborg (2010): Genome-wide association study of 107 phenotypes in a common set of Arabidopsis thaliana inbred lines. Nature

6.A Platt, M Horton*, YS Huang*, Y Li*, A Anastasio, NW Mulyati, J ?gren, O Bossdorf, D Byers, K Donohue, M Dunning, E Holub, A Hudson, V Le Corre, O Loudet, F Roux, N Warthmann, D Weigel, L Rivero, R Scholl, M Nordborg, J Bergelson, JO. Borevitz (2010): The Scale of Population Structure in Arabidopsis thaliana. Plos Genetics

7.Y Huang*, H Li*, H Hu, X Yan, MS. Waterman, H Huang and XJ Zhou (2007): Systematic discovery of functional modules and context-specific functional annotation of human genome. Bioinformatics (ISMB 2007)


jyjl:美国南加州大学，计算生物学，博士。复旦大学，生物科学，学士。
gzjl:上海药物研究所，研究员，研究组长。Illumina Inc. 圣地亚哥，生物信息科学家加利福尼亚大学洛杉矶分校，博士后
ktxm:中科院先导专项-个性化药物生物信息数据共享系统新药研究国家重点实验室-自主课题
ryhj:USC Graduate Student Merit Award复旦大学人民奖学金复旦大学计算机竞赛，三等奖
xpwj:http://sourcedb.simm.cas.cn/zw/gb2020/yjzz/202008/P.jpg
kycg:1.低纯度癌症样本拷贝数变异发现方法；

2.第一个非人灵长类群体基因资源（BMC Biology）以及第一个复杂系谱Trait Mapping （Nature Genetics）；

3.DNA甲基化BaseSpace(云计算)-App；

4.第一个非人类GWAS (Nature, 2010)。


shrz:
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