xm:邵强
xb:男
zc:副研究员
xl:博士
dh:-1304
cz:
dzyj:qshao@simm.ac.cn
grzy:
zjlb:
zw:
txdz:上海浦东张江祖冲之路555号
grjj:　 现任中国科学院上海药物研究所副研究员、硕士生导师。1999年毕业于南京大学，获得化学工程专业学士学位。之后于2003年在南京大学研究生毕业。2004年在威廉与玛丽学院（College of William & Mary）获得高分子化学专业硕士学位，2009年在德克萨斯农工大学（Texas A&M University）获得理论与计算化学专业博士学位。在2010年1月加入北京大学高毅勤教授课题组开始博士后研究工作，2011年至今在中国科学院上海药物研究所工作。

　　本人致力于运用化学和计算等交叉学科方法，开发可以广泛使用的计算模拟方法和软件，在蛋白质科学、药物设计等学术领域进行基础性和创新性研究。目前针对药物靶标蛋白质的动态功能性构象变化研究开发了一系列增强取样的分子模拟方法。此外,应用计算生物学方法研究多个药物靶标蛋白的功能分子机制及其药物筛选、设计（如HIV-1 蛋白酶、重要天然免疫系统信号分子STING蛋白、膜转运蛋白等）。通过我们的研究，可以1）拓展分子模拟方法在生物大分子体系的应用范围，2）深入了解重要的疾病相关的靶标蛋白的生理功能机制，3）研究靶标蛋白和药物分子的结合并以此来了解蛋白质-药物分子相互关系机制，为药物设计提供新的研究思路和模拟手段。相关研究成果发表在Physical Chemistry Chemical Physics、Journal of Physical Chemistry B、Scientific Reports、Accounts of Chemical Research等国际学术期刊上。至今，共发表SCI学术论文50余篇（其中第一或通讯作者30余篇）。获得自然科学面上项目1项（主持），并结题青年基金1项，参加科技部“973计划”项目2项以及中科院受体结构与功能重点实验室开放课题1项。

yjfx:1.针对生物体系的理论计算模拟方法发展

2. 药物靶标蛋白质的功能性构象变化及与药物分子相互作用机制研究、药物设计

3. 蛋白质的折叠、错误折叠机制研究以及蛋白质结构设计

4. 环境因素对蛋白质结构的影响研究

　　

dblz:1.Shao, Q.* Enhanced conformational sampling technique provides an energy landscape view of large-scale protein conformational transitions. Phys. Chem. Chem. Phys. 2016, 18, 29170-29182.

2. Yu, Y.¹; Wang, J.¹; Shao, Q.*; Shi, J.*; Zhu, W.* Effects of drug-resistant mutations on the dynamic properties of HIV-1 protease and inhibition by Amprenavir and Darunavir. Sci. Rep. 2015, 5, 10517.

3.Yu, Y.¹; Wang, J.¹; Shao, Q.*; Shi, J.*; Zhu, W.* Increasing the sampling efficiency of protein conformational transition using velocity-scaling optimized hybrid explicit/implicit solvent REMD simulation. J. Chem. Phys. 2015, 142, 125105.

4.Yang, L.; Liu, C.; Shao, Q.; Zhang, J.; Gao, Y. Q.^* From thermodynamics to kinetics: Enhanced sampling of the rare events. Acc. Chem. Res. 2015, 48, 947-955.

5.Wang, J.; Shao, Q.^*; Crossins, B. P.; Shi, J.^*; Chen, K.; Zhu, W.^* Thermodynamics calculation of protein-ligand interactions by QM/MM polarizable charge parameters. J. Biomol. Struct. Dyn. 2015, 34, 163-176.

6.Wang, J.; Shao, Q.*; Xu, Z.; Liu, Y.; Yang, Z.; Cossins, B. P.; Jiang, H.; Chen, K.; Shi, J.*; Zhu, W.* Exploring transition pathway and free energy profile of large-scale protein conformational change by combining normal mode analysis and umbrella sampling molecular dynamics. J. Phys. Chem. B 2014, 118, 134-143.

7.Shao Q.*, Shi J., Zhu W.* Enhanced sampling molecular dynamics simulation captures experimentally suggested intermediate and unfolded states in the folding pathway of Trp-cage miniprotein. J. Chem. Phys. 2012, 137, 125013.

8.Shao Q., Fan Y., Yang L., Gao Y. Q.* Counterion effects on the denaturing activity of guanidinium cation to protein. J. Chem. Theory Comput. 2012, 8, 4364-4373.

9.Shao Q., Gao Y. Q.* Temperature dependence of hydrogen-bond stability in β-hairpin structures. J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 3750-3760.

10.Shao Q., Gao Y. Q.* On the hand-over-hand mechanism of kinesin. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2006, 103, 8072-8077.

jyjl:
gzjl:
ktxm:
ryhj:
xpwj:http://sourcedb.simm.cas.cn/zw/gb2020/dsh/202009/P.jpg
kycg:
shrz: