高等真核生物中的可变剪接可以从一个前体mRNA分子产生多个成熟的mRNA分子，极大地拓展了基因功能的多样性。已有的研究表明，可变剪接受到具有特殊碱基短序列的顺式调控元件（RNA motif）和识别这些motif的RNA结合蛋白（RNA binding protein, RBP）调控。因此，发现和鉴定具有特殊序列的RNA motif及其相应RBP可以预测受调控的可变剪接。但是，一些最新的生化结合高通量测序分析研究表明，体内大概只有很少的一部分RNA motif（约15-40%）能够与其相应的RBP结合。这提示，除了motif自身的特殊碱基序列以外，还有一些其它的序列／结构特征能够影响RNA motif与相应RBP的结合。在最新一期Molecular Cell上，来自于美国MIT的Christopher B. Burge教授实验室利用多种生化技术，结合计算和进化生物学方法对这一问题进行了系统分析，系统揭示了除了具有特殊碱基序列的RNA motif以外，区域性的RNA二级结构对RBP与RNA motif的结合具有决定性的作用。一方面来讲，当RNA motif序列位于RNA二级结构的单链开放区间时，其与RBP的结合能力较强，可以显著地调控可变剪接的发生；而从另一方面来讲，当RNA motif序列位于RNA二级结构的双链闭合区间时，其与RBP的结合被抑制，因此不能够调控可变剪接的发生。这一最新的研究成果提示区域性RNA二级结构可以作为调控RBP结合RNA motif的重要开关，为进一步建立更精确的RNA可变剪接预测模型提供了全新的研究基础。
杨力研究员一直从事转录组水平的RNA复杂性及其调控研究，在RNA可变剪接、RNA反向剪接产生环形RNA、RNA编辑修饰和长非编码RNA等领域发表了一系列原创性科研成果，多次受邀为Cell、Molecular Cell、WIREs RNA等期刊发表研究专评和撰写综述。（计算生物学所）
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区域性的RNA二级结构对RBP与RNA motif的结合具有决定性的作用
