家兔是生物医学研究中的一种重要模式生物。相比于大小鼠,家兔的脂代谢特征与人类更加接近。研究人员对三种最常用的实验家兔品系,包括新西兰白兔(NZW)、日本白兔(JW)和渡边可遗传性高脂血症家兔(WHHL)进行了全基因组测序。群体遗传分析表明WHHL的遗传多样性最低,但却积累了最高比例的高频有害突变。除了已知的LDLR缺陷以外,其他一些高频有害突变可能也与WHHL的病理表型相关。研究人员同时对WHHL和高胆固醇饮食喂养的NZW中的相关组织开展了转录组测序。比较发现,这两种家兔模型虽然高胆固醇血症的类型不同,但主动脉病变却显示了类似的表达谱。然而,肝脏的表达谱仅在高胆固醇喂养的NZW,而不在WHHL中显示出炎症反应和异常的脂代谢。这些结果为合理选择家兔模型提供了重要依据,同时也为脂代谢和相关心血管疾病的分子机制研究提供了新的启示。
这项工作在李亦学研究员的指导和协调下完成,得到了科技部、国家自然科学基金委、中国科学院、美国国立卫生研究院等项目经费的支持。(计算生物学所)

WHHL中高频有害突变筛选

WHHL和高胆固醇饮食NZW的表达谱比较