3月8日,国际学术期刊Cell Metabolism发表了中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所韩敬东研究组的论文“A Systems Approach to Reverse Engineer Lifespan Extension by Dietary Restriction”。该研究揭示了节食导致线虫寿命延长的分子机制。
众所周知,衰老关乎人类的健康和寿命。随着生物学知识的积累以及现代生物技术的发展,衰老的研究得到了更多的重视,也达到了前所未有的深度。节食,作为在多个物种中可以延长寿命的重要手段,其分子机制的研究是衰老研究的一个经典范式。研究表明,不少与营养感知和应激反应相关的因子和信号通路均参与或调控了节食导致的延寿现象,然而很少有单一因子的遗传学干扰可以完全涵盖节食所带来的有益影响。更进一步的,这些调控因子和信号通路是介导了节食反应的不同侧面,还是它们在不同的阶段起作用,又或者它们之间还有相互作用,这些都尚属未知。韩敬东研究组的工作首先产生了线虫在两种节食方案下以及对照组的时间序列表达谱数据,并基于该表达谱分析发现,节食的早期和晚期响应分别与代谢和细胞周期/DNA损伤有关。研究者接着采用全新的反向工程的策略整合新的转录组与公共数据库中遗传干扰后的转录组数据,构建了节食响应的网络模型。该模型包含三个主要模块,与之相应的是不同的调控因子簇以及不同时期的节食响应。
接下来,研究者通过遗传学干扰这些调控因子来调节对应的模块,发现当越多的模块被调节时,对照组喂养下线虫的转录组越趋同于节食喂养下的情况。另外,当三个模块均被遗传干扰时,线虫的寿命将会极大延长,平均寿命从不到20天延长到50余天,并且节食也不会再对该类线虫有效。这些结果提示在三个模块的同时干扰可以完全涵盖节食的有益影响。上述结果和动态模拟的结果相结合,提示模块之间存在的大量正反馈环使得通过遗传学干扰完全模拟节食的响应成为可能。这项研究从系统生物学的角度揭示了节食调节衰老的分子机制,并为衰老干预策略提供了新概念,即节食依赖于轻微的多模块协同扰动,而轻微的多模块协同扰动远优于单模块靶向的扰动,只有通过多模块协同扰动才能收获节食的长寿功效。
该研究得到了国家自然科学基金、中科院、科技部以及美国国立卫生研究院等项目资助。(计算生物学所)
文章链接
韩敬东研究员的团队利用无偏的系统生物学方法研究秀丽隐杆线虫的节食调控网络,发现了三个转录调控模块,最终通过对这三个模块同时进行遗传学干扰,得到了对节食的延寿效应不敏感的寿命超长的线虫。
删除或更新信息,请邮件至freekaoyan#163.com(#换成@)
Cell Metabolism发表计算生物学所科研人员关于节食导致线虫寿命延长的机制研究新成果2016-03-14_上海生命科学研究院
上海生命科学研究院 免费考研网/2018-05-05
相关话题/干扰 生物学 遗传学 遗传 信号
植生生态所科研人员发现产溶剂梭菌遗传改造新策略2016-03-09_上海生命科学研究院
2月23日,国际学术期刊MetabolicEngineering在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所姜卫红研究组题为“Improvingtheperformanceofsolventogenicclostridiabyreinforcingthebiotinsyntheticpa ...上海营养与健康研究所 上海生命科学研究院 免费考研网 2018-05-05生化与细胞所科研人员揭示内质网蛋白SCAP参与DNA病毒信号通路中STING招募转录因子IRF3的新机制2016-03-02_上海生命科学研究院
2月22日,国际学术期刊PLoSPathogens在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所王琛课题组的最新研究成果“ERAdaptorSCAPTranslocatesandRecruitsIRF3toPerinuclearMicrosomeInducedbyCytosolic ...上海营养与健康研究所 上海生命科学研究院 免费考研网 2018-05-05计算生物学所科研人员发现正常乳腺组织中癌细胞发育的重要线索2016-03-02_上海生命科学研究院
1月29日,NatureCommunications(《自然—通讯》)发表了中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所AndrewTeschendorff研究组和英国伦敦大学学院妇科癌症研究中心MartinWidschwendter研究组的合作论文“DNAmethylationoutliersinno ...上海营养与健康研究所 上海生命科学研究院 免费考研网 2018-05-05生化与细胞所科研人员及其合作者发现线粒体苯丙氨酰-tRNA合成酶基因的错义突变引起常染色体隐性遗传痉挛瘫痪2016-03-02_上海生命科学研究院
2015年11月10日,国际学术期刊HumanMutation在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所王恩多研究组与第四军医大学基础医学部DNA分型中心吴元明教授的最新合作研究成果,揭示了编码线粒体苯丙氨酰-tRNA合成酶(mtPheRS)的FARS2基因可能是神经退行性疾病 ...上海营养与健康研究所 上海生命科学研究院 免费考研网 2018-05-05生化与细胞所科研人员发现Hippo信号通路核心成员Yorkie的入核调控机制2016-03-02_上海生命科学研究院
2月17日,国际学术期刊JournalofBiologicalChemistry在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所张雷研究组关于Hippo信号通路调控机制的最新研究成果“Importinα1mediatesYorkienuclearimportviaN-terminal ...上海营养与健康研究所 上海生命科学研究院 免费考研网 2018-05-05植生生态所科研人员揭示NAC1参与根从头再生的遗传调控途径2016-02-19_上海生命科学研究院
2月5日,《PlantPhysiology》杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所徐麟研究组题为“Auxin-independentNACpathwayactsinresponsetoexplant-specificwoundingandpromotesroottipemerg ...上海营养与健康研究所 上海生命科学研究院 免费考研网 2018-05-05营养所科研人员在多不饱和脂肪酸遗传易感基因研究方面取得新进展2016-01-19_上海生命科学研究院
1月6日,国际遗传学研究领域知名期刊HumanMolecularGenetics《人类分子遗传学》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所林旭研究组开展亚洲人群多不饱和脂肪酸全基因组关联研究成果:Genome-widemeta-analysesidentifynovellociassoc ...上海营养与健康研究所 上海生命科学研究院 免费考研网 2018-05-05Science:中科院科学家在获得性性状跨代遗传机理方面取得重要突破2016-01-06_上海生命科学研究院
12月31日,Science在线发表了中国科学院动物研究所周琪、段恩奎研究组与中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所翟琦巍研究组合作的研究成果,该研究发现在高脂饮食诱导的父代肥胖小鼠模型中,存在一类成熟精子中高度富集的小RNA(tsRNAs)可作为一种表观遗传信息的载体,将高脂诱导的父代代谢紊乱 ...上海营养与健康研究所 上海生命科学研究院 免费考研网 2018-05-05生化与细胞所科研人员揭示蛋白Chi和dLMO调节Notch信号通路活性的新机制2016-01-06_上海生命科学研究院
1月7日,国际学术期刊ScientificReports在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所赵允研究组题为“ChianddLMOfunctionantagonisticallyonNotchsignalingthroughdirectlyregulationoffngtr ...上海营养与健康研究所 上海生命科学研究院 免费考研网 2018-05-05逆境中心科研人员发现小干扰RNA前体介导DNA甲基化2015-12-14_上海生命科学研究院
12月8日,CellResearch杂志在线发表了中国科学院上海植物逆境生物学研究中心朱健康课题组题为"Dicer-independentRNA-directedDNAmethylationinArabidopsis”的研究论文。该研究首次揭示了小干扰RNA前体在介导DNA甲基化中的作用,推翻了24 ...上海营养与健康研究所 上海生命科学研究院 免费考研网 2018-05-05