生态与进化生物学系是1986年生命科学学院诞生时，遵照生命科学学院首任院长谈家桢院士的指导，将原生物系的动物学、植物学、昆虫学和生态学专业合并而设立的。该系注重于环境生物学和资源生物学的研究，从宏观生物学角度探索生命现象和基本规律。设有植物学、动物学和生态学3个博士点和硕士点以及生物学博士后流动站组成单位之一。现有教学和科研人员20余人，其中教授6名（博士生导师5名）、国内外兼职教授5名、副教授6名，讲师及辅助人员8名。承担校、院的本科生和研究生各类基础学位课程近20余门，如生物多样性科学导论、普通生物学、动物学、植物生物学、普通生态学、生物信息学和生命的进化等。

生态与进化生物学系拥有生物多样性和生态工程教育部重点实验室、生物多样性科学研究所和天然药物研究中心；设有基础生物学教学实验室、种群和进化生态学、基因多样性和生物安全、网络和地理信息系统、生物信息学以及天然药物实验室。结合研究生培养，本系以动物和植物为主要研究对象，开展生态学、遗传学、生理生化、系统与进化生物学和生物信息学等多学科的研究，研究领域偏重于宏观生物学和生物资源的保护及利用，其主要研究方向包括：

1． 生物多样性科学的理论与方法；

2． 种群和进化生态学；

3． 基因多样性和生物安全；

4． 城市生态与生态经济学；

5． 生物信息学；

6． 资源生物学。

学术带头人陈家宽、吴千红、卢宝荣、钟扬、李博教授，在这些领域里分别都承担着国家自然科学基金重大及面上项目、上海市多项重要项目以及和加拿大、日本等多项国际合作项目。