遗传学和遗传工程系始建于1983年，原名为生物工程系。

遗传学和遗传工程系与遗传学研究所、遗传工程国家重点实验室相互依托、资源共享，在教学、科研方面密切配合，成为全国遗传学重点学科。每年招收本科生、硕士生、博士生，为国家培养了大批遗传学方面的优秀人才。

遗传学和遗传工程系承担20多门本科生和研究生教学课程，其中生命科学导论、生物工程概论为面对全校的普教课，细胞生物学、遗传学为面向全院的基础课，细胞生物学实验、遗传学实验为面向全院的基础实验课，教师的辛勤耕耘取得了良好的教学效果。编写的遗传学、遗传学实验获得国家教委优秀教材一等奖,遗传学课程获得国家级优秀教学成果二等奖、上海市优秀教学成果一等奖。

在科研方面，本系参加了国家教育部“面向二十一世纪生物学教学改革”项目的研究，为总项目负责人；参加了国家教育部主持的“生物学试题库”研究工作，承担遗传学学科试题库的建设；参加了国家教育部主持的“生物学多媒体教学软件”研究工作，承担遗传学学科CAI教学软件的研制。此外，本系科研的主要方向为发育遗传学的研究，主要从事与发育有关基因的功能研究。正在进行“P27基因在个体发育过程中抑制细胞分裂的作用”及“果蝇神经发育基因在人类基因组中同源序列”的研究，近年来发表了SCI论文及其他杂志的论文数十篇，在当前学科最热门的研究领域中取得了令人瞩目的成果。

遗传学和遗传工程系是生物学科第一批国家教育部重点人才培养基地，也是“211工程”实验教学中心建设重点，己完成“细胞生物学及遗传学实验室”和“基因工程实验室”的改建工程，在实验条件上有了很大的改善，在教学内容上有了很大的充实与提高，为提高教学质量打下了良好的基础。