复旦大学计算机科学与工程系前身为复旦大学计算机科学系，成立于 1975年，是我国最早从事计算机教育与科研的单位，现隶属于信息科学与工程学院。1986年获计算机软件与理论二级学科博士授予权；1995年被批准建立计算机科学与技术博士后流动站；1996年计算机软件与理论二级学科被批准为上海市重点学科；2000年获计算机科学与技术一级学科博士授予权；2002年成立复旦大学智能信息处理开放实验室，2004年1月该室发展成上海市智能信息处理重点实验室。
经过近30年发展壮大，复旦大学计算机科学与工程系拥有了一支理论基础扎实、学术造诣高、富有创新精神的学术团队，做出了许多出色的研究成果。目前我系有教职工90名，其中全职教授19名（双聘院士1名、外籍教授1名，博士生导师16名），复旦大学特聘讲座教授1名，副教授39名，在具有博士学位的30余名青年教师中，三分之二已申请到国家自然科学基金项目。
我系现有在校学生近千名，其中本科生700名，研究生240名。
近10多年来，我系教师承担、参与和完成200百项科研项目，其中包括973子课题3项、国家自然科学基金重大计划项目子课题3项、重点项目3项和面上项目20多项、863计划以及上海市资助课题20余项等，获得各种奖项数十项，包括国家科技进步奖、上海市科技进步奖、国家教育部和其它部委科技进步奖等。据统计，自2000年以来，我系教师和学生在各类学术期刊和国际学术会议发表论文200余篇，整体科研学术水平日益提高。
2000年以来，我系加大了人才引进和科研基地建设力度。2002年在“智能信息处理领域” 建立了以陆汝钤院士为学术带头人的研究团队，2004年1月获上海市政府批准建设“上海市智能信息处理重点实验室”。2003年12月，聘请美国密西根州立大学翁巨扬教授为复旦大学特聘讲座教授，成立了“肢体化智能实验室”，重点研究“自主心智发育算法和智能机器人”； 2004 年 6 月德国人 Rudolf Fleischer 教授以复旦大学杰出人才引进方式，加盟计算机理论与算法组
根据信息技术迅猛发展的趋势，通过人才引进和优化组织，在保持并加强传统优势研究领域外，在智能信息处理相关领域逐步形成了多个富有特色的研究团队，包括：陆汝钤院士领导的非规范知识研究队伍；吴立德教授和薛向阳教授领导的文本、图像和视频信息检索和处理研究团队；周傲英教授和周水庚教授领导的数据库和对等计算研究团队；朱传祺教授和臧斌宇教授领导的并行处理与优化编译研究团队；朱洪教授和Rudolf教授领导的算法与复杂性研究团队；翁巨扬教授领导的自主心智发育研究队伍；陆佩忠教授领导的数字水印和信息隐藏研究团队等。在其它研究方向上还有钱乐秋教授和赵文耘教授领导软件工程研究团队；陈章龙教授和涂时亮教授领导的嵌入式系统研究团队等。
近五年来，我系与国内外计算机院系和研究机构建立了日益密切和广泛的学术交流与合作关系，包括香港大学、香港科技大学、香港中文大学、新加坡国立大学、微软亚洲研究院、美国贝尔实验室等。每年有数十位师生出国访问和开展合作研究、出席国际学术会议；也有数十位海外学者来我系进行学术交流和短期访问。

◆ 主要研究方向
（1） 人工智能和知识工程；陆汝钤院士在知识工程语言和开发环境、分布式人工智能、知识自动获取研究、基于知识的软件工程、基于知识的计算机动画自动生成、软件的机械化生产和移植、形式语义学研究等方面进行了开拓性研究工作，先后获全国科学大会奖、中科院科技进步一等奖（两次）、国家科技进步二等奖；
（2） 大规模文本处理；该方向由吴立德教授负责。主要研究自然语言（特别是中文信息）的处理技术和方法，包括三个方面内容：首先是基础性工作，主要是基础性的理论和算法, 包括自动分词、未登录词识别、词性和概念标注、句法分析和语义分析等,也包括语料库的搜集整理等；其次是中文信息处理的应用技术，包括自动索引、文本检索、文本摘要、文本分类、文本过滤和机器翻译，特别是上述技术在网络环境下的应用；另外，还研究文本处理技术在办公自动化、网络安全、电子出版系统等各个领域的具体应用；
（3） 算法分析与设计；该方向由朱洪教授负责，他设计的在一般任意情况下的并行合并网络被北美各大学计算机系普遍采用的教科书‘Introduction to Parallel Algorithms’（Akl著） 以长达两页的篇幅详述。朱洪教授是仅有的其文章被国际著名计算理论和算法会议STOC和FOCS录用的三个大陆学者之一。
（4） 并行处理；该方向由朱传琪教授负责。曾研制了多台计算机系统。目前主要从事计算机系统软件与体系结构的研究开发工作，特别是并行处理与高性能计算。
（5） 图像视频信息检索；该方向由吴立德、薛向阳教授负责。吴立德、薛向阳长期从事计算机视觉、图象视频检索等工作。具有很好的研究基础，研究成果“石油勘探地震资料的数字处理”获全国科学大会奖，“控制上海地面沉降”获全国科学大会奖，关于计算机视觉的研究获国家教委科技进步一等奖一次，三等奖一次，国家自然科学四等奖一次，“RFSS目标模拟系统软件” 获国家教委科技进步二等奖。在此基础上总结出的专著“计算机视觉”获得1995年全国优秀科技图书二等奖。从2001年起，实验室参加国际文本检索会议视频检索项目的评测，并在视频分割中获得两次第三名。
（6） 数据挖掘、XML数据管理和P2P计算；该方向由周傲英教授负责。在数据挖掘的聚类分析、离群点发现、文本分类、Web搜索、模式提取和流数据挖掘等方面开展了多年的研究，开发了一个大规模数据库的数据挖掘工具集（GoldenEye）。在XML数据管理方面，该小组开发了一个XML数据库原型系统VXMLR，得到国际知名数据库专家高度评价。该小组和美国贝尔实验室合作，开发了一个DTD驱动的XML信息发布中间件PRATA，有关论文被2002年VLDB录用，相关技术已在美国申请专利。；在P2P计算方面，该小组与新加坡国立大学合作，在P2P系统平台和P2P在信息检索、数据库和Web缓存等方面的应用上进行了卓有成效研究；
（7） 生物信息学；生物信息学是新开辟的研究方向。在广泛调查研究的基础上确定了通过机器学习获取并精化基因文法的研究方向。我们选取了启动子（Promoter）识别作为基因识别的突破口，因为启动子在基因的转录和表达方面起着关键的作用。我们已用机器学习的方法获得了基因文法的初步样品。这项工作正在深入中；
（8） 软件工程：该方向由钱乐秋教授负责；
（9） 嵌入式系统：该方向由高传善教授、陈章龙教授负责；


◆ 主要科研成果
计算机科学与工程系一贯重视科研工作，积极鼓励教师参与国内外高水平的科研合作。近三年来纵向项目完成和正在进行的863项目有6项；973项目子课题有5项；国家自然科学基金项目在研有16项；2004年纵向合计项目数73项，经费到款一千一百余万元；2003年发表的文章各类文章80余篇，其中SCIE、EI 检索30余篇；
2004年我系获获上海市科技进步一等奖一项，主办大型国际会议2次，和企业合作在研项目有28项。