物理系原隶属于前基础部（数理系）。2005年大连海事大学进行专业调整，成立物理系。 

    物理系现有一个本科专业（应用物理专业——光电信息科学与技术方向）。下设一个光电子技术研究所，一个等离子体物理化学研究所，一个物理实验中心。目前有四个学科梯队：等离子体物理、凝聚态物理、光学、理论物理。

    物理系现有教职员工35人：正教授6人，副教授12人，讲师2人，助教6人；其中博士14人，硕士7人；博士生导师3人，硕士生导师5人。实验技术人员有高级实验师2人，工程师4人；行政人员5人。

    物理系教学科研力量雄厚，成果卓著。等离子体物理与化学研究所已取得国家重大基础研究973前期研究专项2项；国家自然科学基金重点资助项目1项；国家自然科学基金资助项目4项；获得辽宁省政府科技进步一等奖1项；辽宁省政府技术发明三等奖1项；辽宁省政府科技进步三等奖1项；国际知识产权组织专项奖1项；国家发明专利2项，实用新型4项；2004年又申报国际发明专利4项，国家发明专利7项，实用新型专利2项。1人次入选国家 “新世纪优秀人才支持计划”；1人次入选辽宁省“新世纪优秀人才支持计划”；1人次获辽宁省优秀博士生论文，并获推荐国家优秀博士生论文；2人为辽宁省“新世纪百千万人才工程”的百层次人才。凝聚态物理近年来已取得国家自然科学基金项目2项，经费46万元。物理系教师近几年发表的学术论文被SCI、EI、ISTP三大检索收录50余篇次。已培养博士生3人，硕士生22人。物理系重视学生素质和创新能力的培养，坚持强基础、宽口径、重实际、创特色的办学指导思想，凭着坚实的物理、光电信息技术基础为信息技术、物理学、电子学、材料学类专业输送研究生，努力为学生毕业后从事物理、光学、信息及光电子技术等工作打下坚实的基础。