刘斯洋

中山大学公共卫生学院（深圳） 副教授



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工作经历2021/01-至今? ? ? ? ? ? ? 中山大学公共卫生学院（深圳），一级副教授，博导
2018/01-2020/12????? ??深圳华大生命科学研究院 基因组学研究员(正高)，博导
教育经历2015/05-2017/12?? 丹麦哥本哈根大学，生物信息学博士
2012/09-2015/04?? 丹麦哥本哈根大学，生物信息学硕士
2007/09-2011/07?? 中山大学,生命科学学院，理学学士
讲授课程《卫生统计学》
《Python与R语言编程》
《流行病学》
承担课题及科研项目迄今主持经费660余万，择选如下
中山大学“****”启动项目，20201-2025.12, 项目负责人
国家自然科学基金青年项目，2020.01-20212，25万元，项目负责人
深圳华大生命科学研究院自主科研项目，人类群体基因组研究，352 万元，2014-2018, 项目负责人
Innovation Fund Denmark, Discovery, genotyping and characterization of structural variants in clinical sequencing applications, 104万，2015-2018, 项目负责人
代表性文章至今发表SCI论文22篇，详见google scholar Siyang Liu
(#共同第一作者; *共同通讯作者)
Wang F#, Huang S#, Gao H#, Zhou Y#, Lai C, Li Z, Xian W, Qian X, Li Z, Huang Y, Tang Q, Liu P, Chen R, Liu R, Li X, Xin T, Xuan Z, Bai Y, Duan G, Zhang T, Xu X, Wang J, Yang H, Liu S*, He Q*, Jin X*, Liu L*: Initial Whole Genome Sequencing and Analysis of the Host Genetic Contribution to COVID-19 Severity and Susceptibility. Cell Discov. 2020 Nov; 6(1):0-83
Liu S#, Huang S#, Chen F#, Zhao L#, Yuan Y#, Francis S, Fang L, Li Z, Lin L, Liu R, Zhang Y, Xu H, Li S, Zhou Y, Liu Q, Walters R, Lin K, Ju J, Korneliussen T, Yang M, Fu Q, Wang J, Zhou L, Krogh A, Zhang H, Wang W, Chen Z, Yin Y, Yang H, Mao M, Shendure J, Wang J*, Albrechtsen A*, Jin X*, Nielsen R*, Xu X*. Genomic Analyses from Non-invasive Prenatal Testing Reveal Genetic Associations, Patterns of Viral Infections, and Chinese Population History. Cell. 2018 Oct 4:176(2)
Maretty L#, Jensen JM#, Petersen B#, Sibbesen JA#, Liu S#, Villesen P#, SkovL#, Belling K#, Theil Have C, Izarzugaza JMG, Grosjean M, Bork-Jensen J, Grove J,Als TD, Huang S, Chang Y, Xu R, Ye W, Rao J, Guo X, Sun J, Cao H, Ye C, van Beusekom J, Espeseth T, Flindt E, Friborg RM, Halager AE, Le Hellard S, Hultman CM, Lescai F, Li S, Lund O, L?ngren P, Mailund T, Matey-Hernandez ML, Mors O, Pedersen CNS, Sicheritz-Pontén T, Sullivan P, Syed A, Westergaard D, Yadav R, Li N, Xu X, Hansen T, Krogh A, Bolund L, S?rensen TIA, Pedersen O, Gupta R, Rasmussen S, Besenbacher S, B?rglum AD, Wang J, Eiberg H, Kristiansen K*, Brunak S*, Schierup MH*. Sequencing and de novo assembly of 150 genomes from Denmark as a population reference. Nature. 2017 Aug 3;548(7665):87-91.
Liu S#, Huang S#, Rao J#, Ye W#; Genome Denmark Consortium, Krogh A*, Wang J*. Discovery, genotyping and characterization of structural variation and novel sequence at single nucleotide resolution from de novo genome assemblies on a population scale. Gigascience. 2015 Dec 24;4:6
Besenbacher S#, Liu S#, Izarzugaza JM#, Grove J, Belling K, Bork-Jensen J, Huang S, Als TD, Li S, Yadav R, Rubio-García A, Lescai F, Demontis D, Rao J, Ye W, Mailund T, Friborg RM, Pedersen CN, Xu R, Sun J, Liu H, Wang O, Cheng X, Flores D, Rydza E, Rapacki K, Damm S?rensen J, Chmura P, Westergaard D, Dworzynski P, S?rensen TI, Lund O, Hansen T, Xu X, Li N, Bolund L, Pedersen O, Eiberg H, Krogh A, B?rglum AD, Brunak S, Kristiansen K, Schierup MH, Wang J, Gupta R, Villesen P, Rasmussen S. Novel variation and de novo mutation rates in population-wide de novo assembled Danish trios. Nat Commun. 2015 Jan 19;6:5969.
Zhao M#, Liu S#, Luo S, Wu H, Tang M, Cheng W, Zhang Q, Zhang P, Yu X, Xia Y, Yi N, Gao F, Wang L, Yung S, Chan TM, Sawalha AH, Richardson B, Gershwin ME, Li N*, Lu Q*. DNA methylation and mRNA and microRNA expression of SLE CD4+ T cells correlate with disease phenotype. J Autoimmun. 2014 Nov; 54:127-3
Liu S#, Lin J#, Wu H#, Wang C, Huang S, Luo Y, Sun J, Zhou J, Yan S, He J*, Wang J*, He Z*. Bisulfite sequencing reveals that Aspergillus flavus holds a hollow in DNA methylation. PLoS One. 2012;7(1):e30349.
Cao H#, Wu H#, Luo R#, Huang S#, Sun Y#, Tong X, Xie Y, Liu B, Yang H,Zheng H, Li J, Li B, Wang Y, Yang F, Sun P, Liu S, Gao P, Huang H, Sun J, Chen D,He G, Huang W, Huang Z, Li Y, Tellier LC, Liu X, Feng Q, Xu X, Zhang X, Bolund L, Krogh A, Kristiansen K, Drmanac R, Drmanac S, Nielsen R, Li S, Wang J, Yang H, Li Y, Wong GK, Wang J. De novo assembly of a haplotype-resolved human genome. Nat Biotechnol. 2015 Jun;33(6):617-22.
专利情况一种基于基因组组装的变异检测方法和装置, 2015年，发明专利，专利号: ZL3.2
获奖情况2012-2014 Danish Government Scholarship
2007-2010?国家奖学金
兼职情况Genome Denmark Consortium成员，基于已有的高深度基因组测序进行生物信息学算法开发，侧重基于二代和三代测序技术与群体数据的结构性变异识别分型。
深圳华大生命科学研究院，专家顾问
Frontier in Genetics, 特约编辑
招生信息接收本科生2-3人/年进行科研培训，招收博士生1人/年、硕士生3人/年，常年招收博士后以及专职科研（研究员、副研究员、助理研究员以及研究助理）。欢迎对医学遗传学、生物信息学、系统流行病学、演化医学、数据挖掘、数学建模等领域感兴趣的医学、生物、数学、计算机及相关方向的博士后、研究生和本科生加入我们的研究团队！联系人：刘斯洋，联系方式：liusy99@mail.sysu.edu.cn ，来信请注明申请方向及职位。
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