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暨南大学生物化学讲义-第三章 核酸的结构与功能(4)

暨南大学 /2011-11-25

    原核生物的 rRNA共有5S、16S、23S三种(S是大分子物质在超速离心沉降中的一个物理学单位,可间接反映分子量的大小)。其中 16s rRNA与 20多种蛋白质构成核蛋白体的小亚基,大亚基则由 5S及23S rRNA再加上30余种蛋白质构成。

    真核生物的核蛋白体小亚基由 18s rRNA及30余种蛋白质构成;大亚基则由5S、5.8S及28S三种rRNA加上近50种蛋白质构成(表3—3)。

各种rRNA的碱基序列测定均已完成,并据此推测出其二级结构。真核生物的18sRNA的二级结构呈花状(图3-14),形似40S小亚基,其中多个茎环结构为核蛋白体蛋白的结合和组装提供了结构基础。

将纯化的参与组成核蛋白体蛋白质和rRNA在试管内混合,不需加入酶或ATP就可以自动组装成有活性的大、小亚基,但rRNA之间不能互相代替。因此,核蛋白体立体结构的形成可能是由其中的rRNA所决定的。

                        四、其他小分子RNA

    除了上述三种RNA外,细胞的不同部位还存在着另外一些小分子的RNA,它们分别被称为小核RNA、小核仁RNA、小胞质RNA等。这些小RNA分别参与hnRNA和rRNA的转运和加工。

                            五、核酶

    某些RNA分子本身具有自我催化能力,可以完成rRNA的剪接。这种具有催化作用的 RNA被称为核酶(ribozyme)(详见第十二章)。

    核酶的发现一方面推动了对于生命活动多样性的理解,另外在医学上也有其特殊的用途。由于核酶可以将过度表达的肿瘤相关基因生成的mRNA进行切割使其不能翻译成蛋白质,也可以用于切割病毒的RNA序列,因此已被试用于治疗肿瘤和病毒性疾病,如艾滋病。

            第五节  核酸的理化性质及其应用

                      一、核酸的一般理化性质

    核酸为多元酸,具有较强的酸性。DNA是线性高分子,因此粘度极大,而RNA分子远小于DNA,粘度也小得多。DNA分子在机械力的作用下易发生断裂,为基因组DNA的提取带来一定困难。由于碱基成分的紫外吸收特征,DNA和RNA溶液均具有280nm紫外吸收峰,这是DNA和RNA定量最常用的方法。

二、DNA的变性

    在某些理化因素作用下,DNA分子互补碱基对之间的氢键断裂,使DNA双螺旋结构松散,变成单链,即为DNA变性。监测DNA是否发生变性的一个最常用的指标是DNA在紫外区 260nm波长处的吸光值(A260)变化。

    实验室最常用的使DNA分子变性的方法之一是加热。加热时,DNA的双链发生解链。解链过程中,DNA的A260增加,并与解链程度有一定的比例关系。这种关系称为DNA的增色效应(hyperchromic effect)。如果在连续加热DNA的过程中以温度对A260的关系作图,所得的曲线称为解链曲线(图3-15)。从曲线中可以看出,DNA的变性从开始解链到完全解链,是在一个相当窄的温度内完成的,在这一范围内,紫外光吸收值达到最大值的50﹪时的温度称为DNA的解链温度,由于这一现象和结晶的融解过程类似,又称融解温度(melting pore,Tm)。在Tm时,核酸分子内50%的双链结构被解开。一种 DNA分子的 Tm值的大小与其所含碱基中的G+C比例相关,G+C比例越高,Tm值越高。DNA的Tm值可以根据其G+C含量计算,计算公式为:Tm=69.3+0.41(%G+C),小于 20hp的寡核苷酸的Tm的计算公式为: Tm=4(G+C)+2(A+T)。

    三、DNA的复性与分子杂交

    变性DNA在适当条件下,两条互补链可重新恢复天然的双螺旋构象,这一现象称为复性。热变性的DNA经缓慢冷却后即可复性,这一过程也称为退火(annealing)。

    DNA的复性速度受到温度的影响,复性时温度缓慢下降才可使其重新配对复性。如加热后,将其迅速冷却至4℃以下,则几乎不可能发生复性。这一特性被用来保持DNA的变性状态,一般认为,比Tm低25℃的温度是DNA复性的最佳条件。

在DNA复性过程中,如果将不同的DNA单链分子放在同一溶液中,或者将DNA和RNA分子放在一起,双链分子的再形成既可以发生在序列完全互补的核酸分子间,也可以发生在那些碱基序列部分互补的不同的DNA之间或DNA与RNA之间(图3-16),这种现象称为核酸分子杂交(hybridization)。DNA与DNA及RNA与DNA间的分子杂交在核酸研究中的应用十分广泛(见第二十三章)。  

第六节  核酸酶

    核酸酶(nucleases)是指所有可以水解核酸的酶,在细胞内催化核酸的降解,以维持核酸(尤其是RNA)的水平与细胞功能相适应。食物中的核酸也需要在核酸酶的作用下被消化。

    按照作用底物的不同,核酸酶可以分为DNA酶(DNase)和RNA酶(RNase)。有的核酸酶作用在多孩着酸链的5’末端或3’朱端,因此被称为核酸5’末端外切酶或3’末端外切酶;有的核酸酶作用于链的内部,称为核酸内切酶,其中一部分具有严格的序列依赖性(4~8 bp),被称为限制性内切酶。

    核酸酶在DNA重组技术中是不可缺少的重要工具,尤其是限制性核酸内切酶的应用更是所有基因人工改造的基础(见第十五章)。

                            小结

    核酸是生物大分子,天然存在的核酸包括DNA和RNA。核酸的基本组成单位是核苷酸,而核苷酸则由碱基、戊糖和磷酸三种成分连接而成。DNA分子中的碱基成分为A、G、C、T,RNA分子中为A、G、C、U。核糖或脱氧核糖与碱基通过糖苷键形成核苷,核苷与磷酸通过酯键结合构成核苷酸。

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