研究室      
    海洋渔业资源研究室 020-89108329
    渔业生态环境研究室 020-89108306
    水产养殖与生物技术研究室 020-84451432
    食品工程与质量安全研究室 020-84195166
    渔业生物病害防治研究室 020-89022636
    渔业工程研究室 020-84458415
       
  　重点开放实验室    
    农业部南海渔业资源开发利用重点实验室 020-89108329
    农业部水产品加工重点实验室 020-84195166
    广东省渔业生态环境重点开放实验室 020-84450770
    中国水科院水产种质资源与养殖技术重点开放实验室 020-84451432
       
  　社会公益体系    
    国家水产品加工技术研发中心 020-84195166
    农业部渔业环境及水产品质量监督检验测试中心（广州） 020-84450770
    农业部南海区渔业生态环境监测中心 020-84450770
    农业部南海渔业资源与环境野外科学观测试验站 020-89108326
    农业部南海区海水养殖病害防治研究中心 020-89022636
    博士后科研工作站 020-89108363
    农业部斑节对虾遗传育种研究中心 020-84451346
    农业部华南水产品加工与质量安全研究中心 020-84195166
    全国水产技术标准化委员会渔业资源分技术委员会 020-89108353
    广东省水产标准化技术委员会
 020-84451320
    人力资源与社会保障部特有工种技能鉴定站  
  　科技企业    
    南海水产研究所科技服务公司 020-89108309
     
       
  　管理机构    
    办公室 020-84451246
    　　　党务与监审处 020-89108365
    　　　档案室 020-89108350
    科研处 020-84455784
    人事处 020-89108360
    　　　离退休人员服务中心 020-89108362
    科技条件处 020-84457573
 
   财务处 020-89108352
    成果转化处 020-89108309
 
   后勤处 020-84459849
       
 
 　科技支持机构    
    深圳基地 020-84451657
    花都基地 020-84451657
    海南热带水产研究开发中心 0898-88599073
    调查船基地 020-84453124
    渔业信息中心 020-89109305
    　　　《南方水产科学》编辑部 020-84458694
    　　　图书馆 020-89108356
    　　　网站与局域网管理 020-89108337
    　　　海洋生物标本室 020-89108339