王颖教授 研究方向：生物及健康大数据挖掘
系别：自动化系
联系电话：**
电子邮箱：wangying@xmu.edu.cn



个人简介
研究成果
承担项目
学术奖励


厦门大学航空航天学院自动化系副系主任，教授。于1995年进入中国科学技术大学自动化系本科，1999 年提前免试攻读硕士学位，2002 年获得中国科学技术大学模式识别与智能系统硕士学位，2002 年进入厦门大学自动化系工作，2007 年获得控制理论与控制工程博士学位。目前主要研究方向为生物信息和医疗大数据挖掘。曾获得厦门大学青年教师授课技能特等奖，全国计算机课件评比一等奖。主持国家自然科学基金两项，福建省自然科学基金两项，福建省教改项目两项，自动化教指委教改项目一项。
学术经历
访问****, 美国加州大学欧文分校统计系 (2016.12-2017.12)
短期访问****, 美国南加州大学分子与计算生物中心 (2013.01-2013.02)
短期访问****，美国南加州大学分子与计算生物中心 (2012.07-2012.09)
访问****, 美国南加州大学分子与计算生物中心(2009.10-2011.1)
教授，厦门大学自动化系（2017-至今）
副教授，厦门大学自动化系（2011-2017）
助理教授，厦门大学自动化系（2006-2011）

社会服务
中国机械工业教育协会自动化学科教学委员会 委员；2014-05-01至2019-05-01
福建省系统工程学会 常务理事；2014-04-26至2018-04-25
中国人工智能学会生物信息学与人工生命专业委员会 委员；2015-05-18 至2020-05-17
厦门市自动化学会 理事；2015-07-18至2020-07-16



Wang Y*, Kun Wang, Yang Young Lu and Fengzhu Sun Improving contig binning of metagenomic data using d2sBin oligonucleotide frequency dissimilarity. BMC Bioinformatics, 18:425(2017)(JCR3)
Wang Y*, Lei X., Wang S., Wang Z., Song N., Zeng F., Chen T., Effect of k-tuple length on sample-comparison with high-throughput sequencing data. Biochemical and Biophysical Research Communications, 2016, 469(4):1021-7.(JCR3)
Wang Y*, Chen L,Song N, Lei X, GASS: genome structural annotation for Eukaryotes based on species similarity. BMC Genomics, 2015, 16:150(JCR2)
Zhang L, Guo T, Xi B, Yang F, Wang K, Bi J, Wang, Y* Automatic recognition of cardiac arrhythmias based on the geometric patterns of Poincaré plots. Physiological Measurement, 2015, 36, 283–301(JCR4)
Wang Y*, Liu L, Chen L, Chen T, Sun F Comparison of Metatranscriptomic Samples Based on k-Tuple Frequencies. PLoS ONE, 2014, 9(1): e84348. doi:10.1371/journal.pone.**(JCR3)
Wang Y*, Liu L. RNA-Seq-based assessment for genome annotation databases (in Chinese). Chin Sci Bull (Chin Ver), 2013, 58: 3471–3482, doi: 10.1360/972012-1038
Wang Y.*, Gaurang Mehta, Rajiv Mayani, Jingxi Lu, Tade Souaiaia, Chen Y., Andrew Clark, Oleg V. Evgrafov, James A. Knowles, Ewa Deelman, Chen T., RseqFlow: Workflows for RNA-Seq data analysis, Bioinformatics. 2011 Sep 15;27(18):2598-600(JCR2)
软件著作权： RNA-Seq数据分析工作流软件
软件著作权：基因注解库的全面分析和完整评估软件
软件著作权：基于物种相似性的基因组注解软件



主持以下科研项目：
国家自然科学基金面上项目，高通量测序下微生物群落的比较、分析与理解 ，68.40万元，2017年1月-2020年12月
国家自然科学基金青年项目，高通量 RNA-Seq 数据的偏差建模和差异表达基因识别，24万，2013年1月-2015年12月
福建省自然科学基金，不依赖参考序列的环境微生物群落测序数据分析，2016年4月-2019年4月，5万
福建省自然科学基金，基于体映射的人脑MRI数据分析和疾病诊断，2009年1月-2011年12月，2万
国家自然科学基金，基于宏基因组测序的病毒株序列重建与识别方法，2016年1月-2018年12月，22万，第一参与人
主持以下教改项目
2014年教育部高教司自动化教指委专业教育教学改革项目，竞赛驱动的学、赛、研递进自动化人才培养， (2015 年1 月-2016 年12 月)
福建省2015年高等学校创新创业教育自动化专业改革试点(2016.4-2018.4)
福建省2017年高等学校创新创业教育资源共享精品课程(2017.4-2019.4)


2018年 厦门大学第九届高等教育教学成果特等奖
2017年 厦门大学第八届高等教育教学成果二等奖
2014年厦门大学 华为奖教金
2014年厦门大学第七届高等教育教学成果二等奖
2010年全国高等学校计算课件评比一等奖
2008年第八届厦门大学青年教师授课技能大赛特等奖
2009年厦门大学清源奖教金
2007年福建省自然科学论文三等奖
2003年cast奖教金