吕培涛
教授,硕士生导师
联系方式:
福建农林大学海峡联合研究院福州350002
Email:ptlv@cau.edu.cn
学习及工作经历:
2019- 福建农林大学海峡联合研究院 教授
2015-2019 香港中文大学,博士后
2010-2015 中国农业大学,博士
研究兴趣:
1)园艺作物采后与逆境响应的转录调控机制
2)园艺作物品质形成的调控机理
3)植物ENCODE
研究方向:
园艺作物采后不可避免地会遭受营养缺乏,生物和非生物逆境胁迫的影响,导致大量的采后损耗。因此阐释园艺作物品质形成和采后成熟、衰老及逆境生物学机理尤为重要。我们主要以番茄、草莓、菠萝、龙眼和柚子等园艺作物为研究对象,通过功能基因组学和生物信息学等手段,与二代测序相结合的ChIP-Seq, ATAC-Seq, BS-Seq, RNA-Seq等多组学交叉相关技术,在全基因组水平上观测生物学过程的表观修饰动态,解析园艺作物采后生物学及逆境生理相关的转录调控网络,挖掘潜在的调控机制。
目前大部分重要作物的基因组已经被测序,但是通过全基因组测序和比较基因组手段,很难解析复杂的生物学过程和多基因在不同群体中的调控特征。因为趋同进化会使不同基因有相似功能,相同基因会因启动子区域调控元件和表观修饰不同而调节机制不同。因此我们利用人类ENCODE计划的方法,在植物中创建ENCODE数据,通过系统研究植物发育过程的基因表达、染色质可及性、DNA甲基化和组蛋白修饰等动态变化和转录因子结合位点,全面剖析生物学过程的转录调控网络。
发表文章:
Peitao Lü?, Sheng Yu?, Ning Zhu?, Yun-Ru Chen?, Biyan Zhou?, Yu Pan, David Tzeng, Joao Paulo Fabi, Jason Argyris, Jordi Garcia-Mas, Nenghui Ye, Jianhua Zhang, Donald Grierson, Jenny Xiang, Zhangjun Fei, James Giovannoni, Silin Zhong. Genome encode analyses reveal the basis of convergent evolution of fleshy fruit ripening. Nature Plants, 2018, 4: 784-791.
Pengfei Dong, Xiaoyu Tu, Po-Yu Chu, Peitao Lü, Ning Zhu, Donald Grierson, Baijuan Du, Pinghua Li, Silin Zhong. 3D chromatin architecture of large plant genomes determined by local A/B compartments. Molecular Plant, 2017, 10: 1497-1509.
Congcong Wang, Peitao Lü, Silin Zhong, Houbin Chen, Biyan Zhou. LcMCII-1 is involved in the ROS-dependent senescence of the rudimentary leaves of Litchi chinensis. Plant Cell Reports, 2017, 36: 89-102.
Muhammad Ali Khan, Yonglu Meng, Daofeng Liu, Hongshu Tang, Suhui Lü, Muhammad Imtiaz, Guimei Jiang, Peitao Lü, Yuqi Ji, Junping Gao, Nan Ma. Responses of rose RhACS1 and RhACS2 promoters to abiotic stresses in transgenic Arabidopsis thaliana. Plant Cell Reports, 2015, 34: 795-804.
Peitao Lü, Changqing Zhang, Jitao Liu, Xiaowei Liu, Guimei Jiang, Xinqiang Jiang, Muhammad Ali Khan, Liangsheng Wang, Bo Hong, Junping Gao. RhHB1 mediates the antagonism of gibberellins to ABA and ethylene during rose (Rosa hybrida)petal senescence. The Plant Journal, 2014, 78: 578-590.
Xinqiang Jiang, Changqing Zhang, Peitao Lü, Guimei Jiang, Xiaowei Liu, Fanwei Dai, Junping Gao. RhNAC3, a stress-associated NAC transcription factor, has a role in dehydration tolerance through regulating osmotic stress‐related genes in rose petals. Plant Biotechnology Journal, 2014, 12: 38-48.
Guimei Jiang, Xinqiang Jiang, Peitao Lü, Jitao Liu, Junping Gao, Changqing Zhang. The rose (Rosa hybrida) NAC transcription factor 3 gene, RhNAC3, involved in ABA signaling pathway both in rose and Arabidopsis. PloS one, 2014, 9: e109415.
Peitao Lü?, Mei Kang?, Xinqiang Jiang, Fanwei Dai, Junping Gao, Changqing Zhang. RhEXPA4, a rose expansin gene, modulates leaf growth and confers drought and salt tolerance to Arabidopsis. Planta. 2013, 237: 1547-1559.
Fanwei Dai, Changqing Zhang, Xinqiang Jiang, Mei Kang, Xia Yin, Peitao Lü, Xiao Zhang, Yi Zheng, Junping Gao. RhNAC2 and RhEXPA4 are involved in regulation of dehydration tolerance during the expansion of rose petals. Plant Physiology, 2012, pp. 112.207720.
Peitao Lü, Xinmin Huang, Hongmei Li, Jiping Liu, Shenggen He, Daryl C Joyce, Zhaoqi Zhang. Continuous automatic measurement of water uptake and water loss of cut flower stems. Hortscience, 2011, 46: 509-512.
Peitao Lü, Xinmin Huang, Yimin Lu, Jiping Liu, Zhaoqi Zhang, Shenggen He. Determination of Nano-silver spatiotemporal distribution in cut gerbera flowers by ICP-AES. Spectroscopy and Spectral Analysis, 2011, 31, 2253-2255.
Peitao Lü, Shenggen He, Hongmei Li, Jinping Cao, Hui-lian Xu. Effects of nano-silver treatment on vase life of cut rose cv. Movie Star flowers. Journal of Food, Agriculture and Environment, 2010, 8, 1118-1122.
Peitao Lü, Jinping Cao, Shenggen He, Jiping Liu, Hongmei Li, Guiping Cheng, Yuelian Ding, Daryl C Joyce. Nano-silver pulse treatments improve water relations of cut rose cv. Movie Star flowers. Postharvest Biology and Technology. 2010, 57: 196-202.
Jiping Liu, Shenggen He, Zhaoqi Zhang, Jinping Cao, Peitao Lv, Sudan He, Guiping Cheng, Daryl C Joyce. Nano-silver pulse treatments inhibit stem-end bacteria on cut gerbera cv. Ruikou flowers. Postharvest Biology and Technology. 2009, 54: 59-62.
Jiping Liu, Zhaoqi Zhang, Daryl C Joyce, Shenggen He, Jinping Cao, Peitao Lv. Effects of postharvest nano-silver treatments on cut-flowers. ISHS Acta Horticulturae 2008, 847: 245-250.
实验室成员:
李云(科研助理)
李华(科研助理)
胡萌萌(2019级硕士在读研究生)
麻荣慧(2019级硕士在读研究生)
范迎康(2019级硕士在读研究生)
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