2017年10月12日,北京大学生命科学学院伊成器课题组与魏文胜研究组合作在Nature communications杂志上发表了题为“Deciphering TAL effectors for 5-methylcytosine and 5-hydroxymethylcytosine recognition”的研究论文,首次全面解码了TALE蛋白对DNA表观修饰5-甲基胞嘧啶(5mC)和5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)的特异性识别。
TALE蛋白是二代基因编辑工具TALEN的核心识别模块;其由若干个长约34个氨基酸的重复单元组成,每个重复单元利用第12、13个氨基酸(RVD, repeat-variable diresidue)与DNA碱基发生相互作用,从而实现对DNA的序列特异性识别。因为RVD与DNA碱基直接相互作用,所以TALE-DNA相互作用对DNA修饰敏感;而作为第三代基因编辑工具的CRISPR/cas则不具备这一特点。在这项工作中,研究团队筛选了全部理论上的RVD组合对5mC及5hmC这两种重要表观遗传修饰的识别,并由此鉴定出5mC、5hmC的特异性及简并性识别RVD。应用这些新型RVD,该研究实现了活细胞中甲基化依赖的基因激活和基因编辑,也在体外实现了单碱基分辨率的5hmC检测。这项工作为基于TALE蛋白的甲基化特异性基因激活、抑制及基因编辑等提供了依据。
全面解码TALE蛋白对5-甲基胞嘧啶及5-羟甲基胞嘧啶的特异性识别
北京大学生命科学学院张媛博士,博士生刘璐璐、郭生杰及宋靖慧为该论文的并列第一作者;北京大学生命科学学院伊成器研究员、魏文胜研究员为该论文的共同通讯作者。该项研究得到了科技部973计划、国家自然科学基金、北京大学未来基因诊断高精尖创新中心及北大清华生命科学联合中心等的资助。
编辑:山石
删除或更新信息,请邮件至freekaoyan#163.com(#换成@)
生命科学学院伊成器课题组与魏文胜课题组合作全面解码TALE蛋白对5-甲基胞嘧啶及5-羟甲基胞嘧啶的特异识别
本站小编 Free考研/2020-04-10
相关话题/基因 北京大学
北京大学白凡课题组与中山大学曾木圣课题组揭示食管癌早期病变与食管癌演化特征
2017年9月12日,北京大学生物动态光学成像中心白凡课题组与中山大学肿瘤防治中心曾木圣课题组合作在NatureCommunications上在线发表了题为“Genomiccomparisonofesophagealsquamouscellcarcinomaanditsprecursorlesion ...北京大学通知公告 本站小编 Free考研 2020-04-10北京大学分子医学研究所王显花课题组揭示线粒体炫调控心脏ATP稳态平衡
ATP是细胞的能量货币,也是许多生命过程的重要信号物质。生理条件下,细胞的ATP浓度通常维持在十分稳定的水平,尤其是对于高耗能的心脏,剧烈运动时,其ATP的产生与消耗发生5-10倍的变化,而其ATP浓度却保持不变。那么心脏是如何维持ATP稳态平衡的?这看似简单的科学难题困扰着研究者们几十年。近日,北 ...北京大学通知公告 本站小编 Free考研 2020-04-10欧阳颀课题组在人工基因线路方面取得突破性进展
基因表达调控作用是细胞生长、代谢和分化等重要生命活动的基础。然而受制于技术的发展,生物基因工程领域的工作者长期以来都只能对基因进行敲入、敲除、敲低等简单操作而无法对相对复杂的基因表达调控进行设计。随着生物与数学、物理、化学等学科的交叉融合,基因工程研究者开始尝试在细胞内通过对基因表达调控过程进行理性 ...北京大学通知公告 本站小编 Free考研 2020-04-10北京大学-腾讯协同创新实验室关于分布式机器学习系统Angel的研究取得重要进展
日前,《国家科学评论》(NationalScienceReview,NSR)在线发表了由北京大学信息科学技术学院、高可信软件技术教育部重点实验室崔斌教授课题组与腾讯数据平台部合作撰写的论文《一种新型大规模分布式机器学习系统Angel》(Angel:anewlarge-scalemachinelear ...北京大学通知公告 本站小编 Free考研 2020-04-10北京大学第三医院张幼怡团队研究应激性心脏损伤取得新进展
2017年5月26日,北京大学第三医院心血管内科张幼怡研究员团队在心血管领域顶级期刊EuropeanHeartJournal在线发表了最新研究成果(肖晗助理研究员与李昊博士为该文章的共同第一作者)。此研究成果是该团队围绕交感神经系统过度激活所致心脏损伤机制开展研究,与心血管内科临床团队合作,从临床问 ...北京大学通知公告 本站小编 Free考研 2020-04-10我国海域天然气水合物研究取得历史性突破 北京大学卢海龙教授团队作出突出贡献
2017年5月18日,我国海域天然气水合物研究取得历史性突破,在南海进行的首次天然气水合物试采宣告成功。北京大学作为此次海域天然气水合物试采工程项目四大核心单位之一,承担了海域天然气水合物试开发体系等相关研究任务。工学院、地球与空间科学学院、物理学院和海洋研究院等院系的多学科研究人员通过合作和参与, ...北京大学通知公告 本站小编 Free考研 2020-04-10北京大学白凡、谢晓亮团队与天津医科大学张宁团队揭示循环肿瘤细胞基因组特征与癌症转移机制
2017年5月9日,国际专业基因组学研究刊物GenomeResearch在线发表了北京大学白凡、谢晓亮团队与天津医科大学张宁团队合作研究成果。作者团队使用单细胞测序技术对来自同一病人的循环肿瘤细胞和单个原发灶癌细胞的拷贝数变异进行分析,揭示了在肿瘤转移过程中基因拷贝数变异的演化过程。作者团队进一步对 ...北京大学通知公告 本站小编 Free考研 2020-04-10北大第六医院杨莉副研究员在Molecular Psychiatry杂志报告首个注意缺陷多动障碍执行抑制缺陷全基因组关联易感基因
注意缺陷多动障碍(attentiondeficithyperactivitydisorder,以下简称“ADHD”)是最常见的儿童期行为障碍,近年研究显示其症状可能持续至成年期,可能共患其他多种精神疾病,给患者本人、家庭及社会均带来不良影响。执行抑制功能缺陷是ADHD的核心缺陷,它与患者的多动、冲动 ...北京大学通知公告 本站小编 Free考研 2020-04-10北京大学乔杰和汤富酬团队合作研究人类生殖细胞发育取得新进展
2017年4月27日,北京大学第三医院乔杰教授团队与生命科学学院汤富酬研究员团队合作,在CellStemCell杂志在线发表了最新研究成果。此研究成果是该团队围绕人类生殖细胞与胚胎发育机制开展的系列研究最新进展。在全球范围,人类生育力呈明显下降趋势,我国不孕不育率超过10%,预计有2000多万夫妻承 ...北京大学通知公告 本站小编 Free考研 2020-04-10生命科学学院汤富酬研究组在Cell Stem Cell在线发表论文揭示人类胚胎期生殖细胞基因表达调控机制
2017年4月27日,北京大学生命科学学院BIOPIC中心汤富酬课题组与北医三院乔杰课题组在CellStemCell杂志在线发表了题为“Single-CellRNA-SeqAnalysisMapsDevelopmentofHumanGermlineCellsandGonadalNicheIntera ...北京大学通知公告 本站小编 Free考研 2020-04-10