一、 基本原则
1、 坚持求实创新的原则
遵循国际软件人才培养标准，努力实现教学模式创新，管理体制创新，教学内容创新，课程体系创新，教学方法创新。
2、 坚持面向需求的原则
根据软件产业发展的人才需求，确定人才培养方向，根据市场需求和技术发展，调整教学内容，安排招生计划，形成灵活的课程体系，动态的教学计划。
3、 坚持质量第一的原则
按照社会主义办学方向，切实加强素质教育，以培养学生的创新精神和创业能力、工程实践能力，严格教育标准，提高教学质量，培养合格人才。
二、 培养目标与方向
1、 培养目标
面向产业和领域需求，培养高层次、实用型、复合型、国际化人才。培养学生具有扎实的理论基础、合理的知识结构，创新能力和优秀的职业素养，侧重提高学生的软件设计与开发能力，工程组织与管理能力，外语交流与国际竞争能力。
选修第二学位的学生已经具有不同领域专业知识的优势，经过软件工程方向的学习和工程实践，学生可以快速成为既具有专业领域知识，又具有软件专业知识和技能的复合型人才，可以更好地服务于本行业的信息化建设。
2、 培养方向
基于对我国软件产业发展的分析和对产业人才需求趋势的预测，结合北京大学创世界一流大学的总体发展规划和学科设置特点，软件学院确定对第二学位的培养主要方向包含软件开发、软件测试、软件项目管理、信息安全与电子服务等。
三、 课程体系
软件学院课程体系是一种多层次、多方向、多领域、模块化的课程体系，素质教育贯穿学院教学过程始终。
1、 多层次：
代表课程之间的关联，设置由浅入深，分为基础课、专业核心课、专业选修课、领域系统分析四个层次；
2、 多方向：
指在软件工程这个较大领域中，学生可以根据自身基础、经历和就业方向，有侧重地选修课程；
3、 多领域：
指每个学生可以重点了解1－2个应用领域，学习如何利用软件技术开发适合不同应用领域的软件与系统；
4、 模块化：
指所有的课程按照模块的方式组织，便于各专业方向的调整和组合。
四、 学分
完成软件工程第二学士学位需要至少修满80学分，具体分配如下：
B. 专业基础课（必修、25学分）
C. 专业核心课（选修、16学分）
D. 专业选修课（选修）
E. 领域专业课（限选）
F. 毕业实习（必修、16学分）
G. 素质教育与前沿技术（必修、4学分）
H. 毕业论文（必修、6学分）
五、 学习时间安排
1、 学习时限
软件学院允许学生在2-5年内完成第二学位学业。
2、 教学时间
软件学院每年安排三个学期的教学计划。其中：
第一学期：9月－次年1月；
第二学期：2月－6月；
第三学期：6月－8月。
六、 选课与成绩
1、 选课
软件学院实行学分制，学生在教学指导委员会的指导下选择专业方向，并根据专业方向选课。学生在试听后决定确认选修或退选课程。
2、 合格标准
根据北京大学的规定，本科生各科考试成绩以60分为及格线。成绩及格者累加该课程规定学分。
3、 单科成绩核定
软件学院规定，学生单科成绩由案例分析或实践、作业、期末考试等部分综合核定，由教师给出该课程的总成绩。
4、 重修
软件学院规定，学生单科成绩不及格者不累加学分。学院对所有的课程不安排补考，学生需要重修不及格的课程或选修其它课程 (按照课程对应的学分支付学费)。
七、 毕业实习
在修满规定的学分后，学生可以进入实习阶段。实习题目一般来自企业，并在企业中进行。实习期至少为6个月。实习结束后，由学院教授和企业专家共同组成评审小组对学生的实习工作进行评定。
八、 论文
论文选题一般以学生的实习工作为基础，具有明确的工程背景与应用价值，并具有一定的技术难度和工作量。论文形式可以是工程项目技术报告、关键技术的研究论文等。
九、 毕业与学位
完成培养目标教学计划的课程，修满80学分，各科成绩合格者准予毕业，授予北京大学本科毕业证书；毕业论文通过并符合学位授予条件，授予北京大学软件工程第二学士学位证书。
