原为铁路、公路、水运流动站，1987年建站，1998年调整为交通运输工程和土木工程两个流动站。2000年获得土木工程一级学科博士学位授予权。共培养博士后32人，在站博士后8人。

　　所包括的二级学科专业为：

　　1、桥梁与隧道工程于1986年获得博士学位授予权，为铁道部重点学科，现有工程院院士1人，教授7人（博士生导师6人），副教授25人，其中具有博士学位的教师15名。主要研究方向包括：桥梁振动与动力可靠性理论、混凝土桥梁结构设计理论、桥梁非线性动力性态与控制、隧道施工技术、地下工程岩土环境影响与控制、隧道工程中的岩石力学问题。

　　2、岩土工程1998年获得博士学位授予权，现有工程院院士1人，教授7人（博士生导师6人），副教授6人，其中8人具有博士学位，国外大学高访归国学者5名。通过“隧道及地下工程试验研究中心”与中国铁路工程总公司、建筑总公司及北京市各设计科研单位开展密切的合作。本专业主要研究方向包括：地下空间的开发与利用、土动力学与岩土工程抗震、路基工程与边坡稳定、岩土工程环境、岩土介质工程特性研究。

　　3、结构工程于2000年获得博士学位授予权，现有教授5人（博士生导师4人），副教授3人，其中3名具有博士学位。主要研究方向：新型复合材料、混凝土非线性及计算机仿真、空间结构、高层建筑、钢管混凝土结构、复杂结构的动力分析。

　　4、市政工程于2000年获得博士学位授予权，现有教授6人（博士生导师4人），副教授8人，其中具有博士学位的教师8名。主要研究方向包括：市政工程规划设计与管理、给水处理理论与技术、污水处理理论与技术、城市垃圾处理与处置。

　　5、防灾减灾工程及防护工程于2001年获得博士学位授予权，该学科点为北京市重点学科，现有教授15人（博士生导师10人），副教授25人，其中具有博士学位的教师15名。主要研究方向包括：工程结构抗震减灾、线路减灾及防护工作、振动控制试验分析。

　　6、地下工程于2004年获得博士学位授予权，现有工程院院士1人，博士生导师3人，现有教师中85%具有博士学位。主要研究方向包括：地下空间开发技术、地下空间开发中的岩土力学问题。

　　7、环境岩土工程于2004年获得博士学位授予权，现有工程院院士1人，博士生导师6人，现有教师中85%具有博士学位。主要研究方向包括：工程岩土环境影响与控制、垃圾与废弃物填埋与堆放技术。

　　8、城市轨道工程于2004年获得博士学位授予权，现有工程院院士2人，博士生导师6人。主要研究方向包括：城市轨道交通线网规划、线路勘测设计、建设管理与工务管理、轨道结构与动力响应分析、新型城市轨道交通、交通环境理论与技术、隧道施工技术。

　　9、水文地质与工程地质于2004年获得博士学位授予权，现有博士生导师3人。主要研究方向包括环境工程地质、工程地质勘察技术、环境水文地质。