基本信息
教育经历
工作经历
研究概述
发表文章

董梦秋 博士

北京生命科学研究所研究员

Meng-Qiu Dong, Ph.D. Associate Investigator, NIBS, Beijing, China

Phone：-8515

Fax：

E-mail：dongmengqiu@nibs.ac.cn


教育经历
Education
2001年
耶鲁大学分子生物物理学与生物化学系博士
Ph.D., Department of Molecular Biophysics & Biochemistry, Yale University, USA

1995年
中国科学院上海生物化学研究所硕士
M.Sc., Shanghai Institute of Biochemistry, Chinese Academy of Sciences, China

1992年
四川大学生物系学士
B.Sc., Department of Biology, Sichuan University, China


工作经历
Professional Experience
2015年-
北京生命科学研究所高级研究员

Associate Investigator, National Institute of Biological Sciences, Beijing, China

2007年-2015年
北京生命科学研究所研究员
Assistant Investigator, National Institute of Biological Sciences, Beijing, China

2003年-2007年
美国斯克利普斯研究院博士后
Postdoctoral Research Associate, The Scripps Research Institute, USA

2001年-2003年
美国加洲大学圣地亚哥分校医学院博士后
Postdoctoral researcher, UCSD School of Medicine, USA



研究概述
Research Description
本实验室的研究主题包含生物学和质谱技术两部分，二者相辅相成，共同发展。
在生物学研究方面，我们以线虫为模式生物，试图了解衰老的生物学过程及其调控机制。在自然衰老过程中，线虫的转录组和蛋白质组将不可避免地发生一系列变化，借助高通量测序及质谱技术，我们可以对这些变化进行定量分析，并进一步探讨这些变化在长寿突变体线虫与野生型线虫之间有何不同。衰老过程在细胞器水平（如线粒体）上引起的变化也在我们的关注范围之内。对这些变化进行分析与归纳可以使我们更加深入地认识衰老过程，并为进一步研究调节衰老的机制打下坚实的基础。在衰老的调节机制的研究中，我们主要关注胰岛素信号通路。目前已经知道，从上游的胰岛素受体直至下游的FoxO转录因子，所有胰岛素信号通路的关键组分都具有调节寿命的功能。然而，FoxO转录因子可以在转录水平调节一系列靶蛋白，哪些关键靶蛋白最终导致了寿命的延长仍不清楚。我们希望找到这些关键靶蛋白，通过它们了解胰岛素信号通路调节寿命的奥秘。
在质谱方面，我们致力于基于质谱的蛋白质组学技术的应用与开发，以期为生物学研究提供新的思路与方法。目前，我们实验室日常的质谱分析工作包括蛋白鉴定、定量蛋白质组学分析以及翻译后修饰分析。样品多为免疫沉淀的蛋白复合物或全细胞裂解液。此外，我们与所内外其他研究者合作开发生物质谱技术，主要包括肽序列从头测序的算法开发、基于电子转移解离（ETD）谱图的高效蛋白质鉴定技术、和通过鉴定交联肽段来研究蛋白－蛋白相互作用的方法。实验室装备的质谱仪包括一台 Q Exactive和一台LTQ-Orbitrap-ETD。


发表文章
Selected Publications:
(From work conducted at NIBS since 2007. *corresponding author, ^? equal contribution)
1. Liu C^?, Song CQ^?, Yuan ZF, Fu Y, Chi H, Wang LH, Fan SB, Zhang K, Zeng WF, He SM, Dong MQ*, Sun RX*. (2014) pQuant Improves Quantitation by Keeping out Interfering Signals and Evaluating the Accuracy of Calculated Ratios. Anal Chem. 86(11): 5286-94
2. Shen EZ^?, Song CQ^?, Lin Y^?, Zhang WH, Su PF, Liu WY, Zhang P, Xu J, Lin N, Zhan C, Wang X, Shyr Y, Cheng H*, Dong MQ* (2014) Mitoflash frequency in early adulthood predicts lifespan in Caenorhabditis elegans.Nature 508(7494): 128-132
3. Coffman K, Yang B, Lu J, Tetlow AL, Pelliccio E, Lu S, Guo DC, Tang C,Dong MQ*, Tamanoi F* (2014) Characterization of the Raptor/4E-BP1 interaction by chemical cross-linking coupled with mass spectrometry analysis. J Biol Chem. 289(8): 4723-4734
4. Li TM, Chen J, Li X, Ding XJ, Wu Y, Zhao LF, Chen S, Lei X*, Dong MQ*(2013) Absolute Quantification of a Steroid Hormone that Regulates Development in Caenorhabditis elegans. Anal Chem. 85(19): 9281-9287
5. Tao L, Xie Q, Ding YH, Li ST, Peng S, Zhang YP, Tan D, Yuan Z*, Dong MQ* (2013)CAMKII and Calcineurin Regulate the Lifespan ofCaenorhabditis elegans through the FOXO Transcription Factor DAF-16.eLife 2:e00518
6. Ding YH^?, Du YG^?, Luo S^?, Li YX, Li TM, Yoshina S, Wang X, Klage K, Mitani S, Ye K*, Dong MQ* (2013) Characterization of PUD-1 and PUD-2, Two Proteins Up-Regulated in a Long-Lived daf-2 Mutant. PLoS One8(6):e67158
7. Chi H^?, Chen H^?, He K, Wu L, Yang B, Sun RX, Liu J, Zeng WF, Song CQ, He SM*, Dong MQ* (2013) pNovo+: De Novo Peptide Sequencing Using Complementary HCD and ETD Tandem Mass Spectra. J Proteome Res.12(2): 615-625
8. Yang B^?, Wu YJ^?, Zhu M^?, Fan SB^?, Lin J, Zhang K, Li S, Chi H, Li YX, Chen HF, Luo SK, Ding YH, Wang LH, Hao Z, Xiu LY, Chen S, Ye K, He SM*, and Dong MQ* (2012) Identification of Cross-linked Peptides from Complex Samples. Nature Methods 9(9): 904-906
9. Zhao Y, Sun W^?, Zhang P^?, Chi H^?, Zhang M^?, Song CQ, Ma X, Shang Y, Wang B, Hu Y, Hao Z, Hühmer A, Meng F, L'Hernaultf S, He SM, Dong MQ*, Miao L* (2012) Nematode Sperm Maturation Triggered by Protease Involves Sperm-secreted Serine Protease Inhibitor (Serpin). Proc Natl Acad Sci U S A. 109(5): 1542-1547
10. Sun RX*, Dong MQ*, Song CQ, Chi H, Yang B, Xiu LY, Tao L, Jing ZY, Liu C, Wang LH, Fu Y, He SM (2010) Improved Peptide Identification for Proteomic Analysis Based on Comprehensive Characterization of Electron Transfer Dissociation Spectra. J Proteome Res. 9(12): 6354-6367
11. Li YH, Dong MQ, Guo Z. (2010) Systematic analysis and prediction of longevity genes in Caenorhabditis elegans. Mech Ageing Dev. 131(11-12): 700-709.
12. Chi H, Sun RX, Yang B, Song CQ, Wang LH, Liu C, Fu Y, Yuan ZF, Wang HP, He SM*, Dong MQ* (2010) pNovo: De novo Peptide Sequencing and Identification Using HCD Spectra. J Proteome Res. 9(5): 2713-2724
（From postdoctoral or graduate work）
13. Dong MQ, Venable JD, Au N, Xu T, Park SK, Cociorva D, Johnson J, Dillin A, and Yates JR, III (2007) Quantitative Mass Spectrometry Identifies Insulin Signaling Targets in C. elegans. Science 317: 660-663
14. McClatchy DB*, Dong MQ*, Wu CC*, Venable, JD, Yates JR, III (2007)¹⁵N Metabolic Labeling of Mammalian Tissues with Slow Protein Turnover.J Proteome Res. 6(5); 2005-2010 * These authors contributed equally.
15. Varsano T*, Dong MQ*, Niesman I*, Gacula H, Lou X, Ma T, Testa JR, Yates JR, III, and Farquhar MG. (2006) GIPC is recruited by APPL to peripheral TrkA endosomes and regulates TrkA trafficking and signaling.Mol. Cell. Biol. 26(23): 8942-8952 * These authors contributed equally.
16. Venable JD, Dong MQ, Wohlschlegel J, Dillin A, and Yates JR, III. (2004) Automated approach for quantitative analysis of complex peptide mixtures from tandem mass spectra. Nature Methods 1(1): 39-45.
17. Dong MQ, Chase D, Patikoglou GA, Koelle MR. (2000) Multiple RGS proteins alter neural G protein signaling to allow C. elegans to rapidly change behavior when fed. Genes Dev. 14: 2003-2014.