摘要： 【目的】梨小食心虫Grapholitha molesta是一种重要的世界性果树害虫。昆虫中肠在食物消化、免疫反应、生长发育等方面发挥着重要作用。本研究旨在建立梨小食心虫幼虫中肠转录组数据库，挖掘其基因信息。【方法】利用高通量测序平台(Illumina HiSeq X Ten)对梨小食心虫幼虫中肠进行转录组测序、组装及生物信息学分析；进而利用转录组数据进行梨小食心虫幼虫中肠SSR分子标记鉴定。【结果】总计获得梨小食心虫幼虫中肠转录组96 419条unigenes，与公共数据库比对，共注释到57 300条unigenes。通过GO数据库注释，将unigenes的功能分为生物学进程、细胞组分和分子功能三大类55个功能区，其中参与细胞进程、细胞和细胞组分及结合功能的unigenes比例较大。KOG结果显示，10 090条unigenes归到25个基因家族，注释到一般功能预测的最多。KEGG数据库中，10 250条序列注释到232个代谢通路，注释到核糖体的基因数最多。此外，用MISH软件，在10 600条unigenes中搜索到12 690个SSR位点，通过PCR开发出6个SSR位点。【结论】本研究成功组装梨小食心虫幼虫中肠参考转录组，为以中肠为靶标的害虫防治提供理论依据。
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梨小食心虫幼虫中肠转录组及SSR分子标记分析
本站小编 Free考研考试/2022-01-03
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