刘艾林



刘艾林，女，博士，博士生导师, 研究员，PI。兼任世界中医药学会联合会网络药理学专业委员会理事，中国药理学会网络药理学专业委员会委员，中国补益药药理专业委员会委员，北京精神神经药理专业委员会委员，国内外若干专业期刊审稿专家，若干项目评审专家等社会职务。
研究领域
1、计算药理学，网络药理学，药物信息学，虚拟筛选与新药发现
2、防治神经退行性疾病新药发现与机制研究
3、抗流感新药发现与机制研究
教育背景
2005年－2009年，澳门大学中华医药研究院，获生物医学博士学位；1992年－1995 年，南开大学化学系，获理学硕士学位；1985年－1989 年，厦门大学化学系，获理学学士学位。
工作经历
2018年-2019年，Purdue University in USA, 访问；1995年至今，中国医学科学院药物研究所，助理研究员、副研究员、研究员；1989年-1992年，山东鲁抗制药集团，助理工程师。
研究经历
1995年就职于中国医学科学院北京协和医学院药物研究所，主要从事药物发现，计算药理学，神经和感染药理学的科研与教学工作。1998年-2000年参与筹建了国家药物筛选中心，建立了药物筛选信息化管理体系，包括样品信息的现代化管理系统、药学科学数据中心的建设、虚拟药物筛选与理性药物发现，系统地建立了神经退行性疾病-阿尔茨海默病、感染性疾病-流感相关药物筛选模型，经大规模化合物的理性筛选与新药发现，发现了一些活性化合物。
参与完成了抗脑缺血1.1类化药匹诺塞林、抗帕金森病1.1类新药百可利以及治疗糖尿病神经病变的1.2类化药丹酚酸A等3个新药的研发。主持承担了抗阿尔茨海默病新药DL0410的临床前研究，已完成其合成工艺的中试放大、晶型制备、药效药理、药代动力学、制剂处方、安全评价等各项研究。目前正在开展的研究还有天然产物来源抗感染创新药物研发关键技术体系研究。
主持承担“重大新药创制专项” 、国家自然科学基金等等项目10余项，参与国家级项目30余项。近十年发表研究论文100余篇，申请专利20余项。获奖项目 “高通量药物筛选技术体系研究和应用”及“新型高通量药物筛选用蛋白质芯片技术的研究与应用”分别于2002年和 2011年获北京市科学技术二等奖，“高通量药物筛选技术体系研究和应用”、“天然产物的生物活性评价研究”、“天然产物成药性评价技术创新及应用”分别于2002年、2011年和2018年获得中华医学科技奖三等奖。
从事药学科研和教学工作十余年，培养硕、博士研究生20余名；参与编写《迈向药物创新之路—“1035工程”实施回顾》、《天然小分子药物》、《中药材“毒”古今研究概评》、《Natural Small Molecule Drugs from Plants》、《Dietary Phytochemicals and Microbes》、《高通量药物筛选》、《实验药理学》、《新药研究与评价概论》等专著18部，获“优秀指导教师”等个人荣誉奖多项。
联系方式：
E-mail: liuailin@imm.ac.cn，电话:
计算药理学研究方向：
1、虚拟筛选与新药发现。基于蛋白结构、基于配体结构及网络药理学的技术方法和策略，围绕神经退行性疾病、感染性疾病、心脑血管疾病、肿瘤、代谢性疾病等疾病，建立化合物活性预测模型，并用于化合物数据库的虚拟筛选和新药发现，以降低药选成本，减少盲目性，提高药物发现的几率。
2、化合物-蛋白相互作用预测体系的建立。基于机器学习算法、药物信息学、生物信息学、虚拟筛选等方法技术，建立化合物-疾病相关靶点相互作用的系列预测模型，为多靶点活性化合物的发现及化合物作用机制研究提供有力工具。
3、网络药理学在中药复方研究与开发中的应用。基于生物信息学、药物信息学等信息学资源，利用网络构建、通路富集等技术方法和策略，探索研究中药及中药复方防治复杂疾病的“化学成分-靶点-通路-病症-疾病”的网络机制，以揭示中药复方的药效物质基础及网络作用机制，为进一步研究提供信息依据。
抗阿尔茨海默病新药研究：
阿尔茨海默病（Alzheimer’s Disease, AD）已成为严重危害老年人健康的疾病，目前尚无理想治疗药物。国际上目前多以抗AD药物为母核设计合成多靶向先导物，DL0410即是经过计算机辅助设计、结构优化、多靶点模型评价而发现的结构新颖、作用独特的新型抗AD药物。DL0410抗AD的药效机制具有多向网络药理作用机制：（1）通过抑制脑中APP 的表达，从而抑制Aβ的生成和聚集；（2）通过对H3R、AchE和BuChE等多个神经递质有关靶点的抑制作用，增加神经递质；（3）通过抑制氧化应激，抑制炎症反应，从而减少神经元的死亡；（4）通过长时程增强（LTP）作用，提高海马区的记忆能力。
抗阿尔茨海默病新药DL0410的临床前研究已完成其合成工艺的中试放大、质量控制、药效及机制、药代动力学、制剂处方、安全评价等各项研究。DL0410疗效确定，安全性好，易合成，成本低，优于临床一线用药多奈哌齐、艾斯能，具有良好的研发前景。
本研究得到 “十一五”重大新药创制专项（2009ZX09302-003）、“十二五”重大新药创制专项（2014ZX**-002）、北京市自然基金（**）以及中国医学科学院医学与健康科技创新工程（2016-I2M-3-007）等项目资助。
抗流感新药研究：
流感是由流感病毒引起的上呼吸道感染性疾病。由于流感病毒为RNA病毒，由8个基因片段所组成，因此病毒复制时易于变异，是流感病毒产生耐药性的根本原因。目前抗流感的上市化学药均靶向病毒蛋白，因此易产生耐药性。如M2阻断剂金刚烷胺和金刚乙胺，其耐药性达90%以上；神经氨酸酶抑制剂扎那米韦和奥塞米韦，其耐药性报道也逐年增多。因此寻找发现可以避免产生耐药性的抗流感药物靶点显得尤为迫切。
本实验室针对流感疾病建立了一系列抗流感药物筛选模型，结合虚拟筛选技术方法，发现了若干具有不同作用机制和不同结构类型的活性化合物，经系统评价确定J10688为候选物。J10688是从抗流感中药中分离得到的化学成分，具有多靶点抗流感作用，既有流感病毒来源的药物靶点NA、HA的抑制作用，又有宿主来源蛋白CLK1的抑制作用，同时对炎症因子IL-6、TNF-α等以及化学趋化因子MCP-1、RANTES等也有明显的抑制作用，通过多靶点、多途径抑制流感病毒的复制，改善流感病毒感染所引起的机体症状，从而达到治疗流感疾病的作用。
体内外抗流感实验结果表明，J10688对常见流感病毒作用与达菲（Oseltamivir）相当，且对达菲耐药毒株和利巴韦林耐药毒株均有显著药效，且对机体的抗炎作用也优于达菲，且安全性好，因此具有很好的发展前景。目前，正在开展系统深入的研究。
本研究亦得到多项基金项目的资助，包括国家自然基金项目（**），北京市自然基金项目（**，**），“十二五”国家重大新药创制专项（2012ZX**-2013HXW-11），“十三五”国家重大新药创制专项（2018ZX**-003-002）等项目。
药物信息学相关工作：
自2004年参加国家人口与健康科学数据共享平台建设以来，在从事计算药理学和新药发现研究的同时，从事药学科学数据中心建设和管理工作，包括药学数据资源的调查与规划，药学数据资源的分级分类研究，标准规范研究，药学数据中心网站设计，药学数据库需求分析，数据结构框架和功能设计，数据资源管理与网上共享等。
目前已完成20余个药学数据库的共享建设，覆盖药物研究、开发、药品生产、使用、管理全链条的信息资源，以链条上游信息为重点，以链条下游为辅助的建设理念，目前数据总量达数百万条，可为政府决策、科研教育、生产经营、医疗卫生和百姓健康等提供科学数据服务。药学数据中心网址为http://pharmdata.ncmi.cn/。
基于药学数据中心的共享数据库建设成果，已申请计算机软件著作权多项，包括药学数据中心网站著作权、中国天然产物化学成分库著作权、代谢组学数据库著作权等。
本工作得到科技部基础性工作和社会公益研究专项（2003DIB1J085）、国家科技基础条件平台建设项目（2005DKA32406）、 “十一五”重大新药创制专项（2009ZX09309-001）、863项目(2014AA021101)等项目资助。
发表论文
抗流感药物相关研究
1、Lin D, Yi YJ, Xiao MW, Chen J, Ye J, Hu AX*, Lian WW, Liu AL*, Du GH. Design, synthesis and biological evaluation of honokiol derivatives as influenza neuraminidase inhibitors. J Asian Nat Prod Res. 2019, 21(11): 1052–1067.
2、 Chen A, Liang Y, Ye J, Hu A*, Lian W, Liu A*, Du G. Synthesis of Chalcone Derivatives Containing Furan or/and Pyran Ring as Neuraminidase Inhibitors. Chem Res Chinese Universities, 2019, 35(3):395-402.
3、 Li C, Xu LJ, Lian WW, Pang XC, Jia H, Liu AL*, Du GH*. Anti-influenza effect and action mechanisms of the chemical constituent gallocatechin-7-gallate from Pithecellobium clypearia Benth. Acta Pharmacol Sin. 2018 Dec; 39(12):1913-1922.
4、 14. Liu J*#, Zu M#, Chen K, Gao L, Min H, Zhuo W, Chen W, Liu A*. Screening of neuraminidase inhibitory activities of some medicinal plants traditionally used in Lingnan Chinese medicines. BMC Complement Altern Med. 2018, 18(1):102. doi: 10.1186/s12906-018-2173-1.
5、 Zhang W, Xue W, Jia Y, Wen G, Lian X, Shen J, Liu A and Wu S*. A concise synthesis of (±)-7-O-galloyltriceti?avan. RSC Advances, 2018, 8: 14389-14392.
6、 Liu J*, Zu M, Chen K, Gao L, Min H, Zhou W, Chen W, and Liu A*. Screening of neuraminidase inhibitory activities of some medicinal plants traditionally used in Lingnan Chinese medicines. BMC Complementary and Alternative Medicine, 2018, 18:102. https://doi.org/10.1186/ s12906-018-2173-1.
7、 He Z^#, Lian W^#, Liu J*, Zheng R, Xu H, Du G, Liu A*. Isolation, structural characterization and neuraminidase inhibitory activities of polyphenolic constituents from Flos caryophylli. Phytochemistry Letters, 2017, 19:160-167.
8、 Fang Y, Xiao M, Hu A * Ye J, Lian W, Liu A *. Design, Synthesis, and Evaluation of 3-((4-(t-Butyl)-2-(2-benzylidenehydrazinyl) thiazol-5- yl)methyl)quinolin- 2(1H)-ones as Neuraminidase Inhibitors. Chinese J Chem, 2016, 34: 403-411.
9、 Li C, Song X, Song J, Pang X, Wang Z, Zhang Y, Lian W, Liu A*, Du G*. Pharmacokinetic study of gallocatechin-7-gallate from Pithecellobiumclypearia Benth. in rats. Acta Pharmaceutica Sinica B, 2016, 6(1): 64-70.
10、 Lian W, Fang J, Li C, Pang X, Liu AL*, Du GH*. Discovery of Influenza A virus neuraminidase inhibitors using support vector machine and Naïve Bayesian models. Mol Divers, 2016, 20(2):439-51.
11、 Yang XY, Liu AL, Liu SJ, Xu XW, Huang LF. Screening for Neuraminidase Inhibitory Activity in Traditional Chinese Medicines Used to Treat Influenza. Molecules, 2016, 21(9): 1138. doi: 10.3390.
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13、 Li C, Song X, Song J, Pang X, Wang Z, Zhang Y, Lian W,Liu A*, Du G*. Pharmacokinetic study of gallocatechin-7-gallate fromPithecellobium clypearia Benth. in rats. Acta Pharmaceutica Sinica B, 2016, 6(1): 64-70.
14、 Lian W, Fang J, Li C, Pang X,Liu AL*, Du GH*. Discovery of Influenza A virus neuraminidase inhibitors using support vector machine and Naïve Bayesian models. Mol Divers, 2015, DOI 10.1007/s11030-015-9641-z.
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18、 Li W, Xia L, Hu A*,Liu A*, Peng J, Tan W. Design and synthesis of 4-alkyl-2-amino (acetamino)-6-aryl-1,3-thiazine derivatives as influenza neuraminidase inhibitors. Arch Pharm (Weinheim). 2013, 346(9):635-44.
19、 Zu M, Yang F, Zhou W,Liu A*, Du G*, Zheng L*.In vitroanti-influenza virus and anti-inflammatory activities of theaflavin derivatives. Antiviral Res. 2012, 94: 217-224.
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36、 Zhang J, Xu W,Liu A, Du G. Design, synthesis, and preliminary evaluation of new pyrrolidine derivatives as neuraminidase inhibitors. Med Chem. 2008; 4(3): 206-9.
37、 Zhang J, Wang Q, Fang H, Xu WF*,Liu AL, Du GH. Design, synthesis, inhibitory activity, and SAR studies of pyrrolidine derivatives as neuraminidase inhibitors. Bioorg. Med. Chem. 2007, 15, 8286–8294.
38、 许律捷，姜雯，庞晓丛，康德，熊婉迪，刘睿，邢建国，刘艾林*，杜冠华。复方一枝蒿抗流感有效成分的网络药理学研究。药学学报，2017,52（5）：745-752。
39、 周伟玲, 杨帆, 祖勉, 李超, 刘艾林*, 杜冠华。流感病毒核酸内切酶抑制剂高通量筛选模型的建立。中国新药杂志，2013，22（10）：1137－1142。
40、 陈考坛，周伟玲，刘嘉炜，祖勉，何紫凝，杜冠华，陈蔚文，刘艾林*。虎杖抗H1N1流感病毒神经氨酸酶活性成分研究。中国中药杂志，2012，37（20）：3068-73。
41、 杨帆，刘艾林，杜冠华。流感病毒神经氨酸酶抑制活性测定方法的标准研究。药学学报，2012，47(6): 730-733。
42、 祖勉，周丹，高丽，刘艾林*，杜冠华。临床常用中成药的体外抗流感病毒活性评价。药学学报，2010，45（3）：408－412。
43、 杨帆，刘艾林，杜冠华。阿比朵尔药理作用与临床应用研究进展。中国药学杂志，2010，45（2）：90－92。
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45、 王海娣，刘艾林*，杜冠华。黄酮类化合物神经氨酸酶抑制活性评价。中国新药杂志，2009，18（15）：55-59。
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神经退行性疾病药物相关研究
1. Pang X, Zhao Y, Song J, Kang, Wu S, Wang L, Liu A*, Du G*. Pharmacokinetics, excretion and metabolites analysis of DL0410, a dual?acting cholinesterase inhibitor and histamine?3 receptor antagonist. Mol Med Rep. 2019, 20: 1103-1112.
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4. Pang XC, Kang D, Fang JS, Zhao Y, Xu VJ, Lian WW, Liu AL*, Du GH*. Network pharmacology-based analysis of Chinese herbal Naodesheng formula for application to Alzheimer’s Disease. Chinese Journal of Natural Medicines, 2018, 16(1): 0053-0062.
5. Wang DM, Feng B, Fu H, Liu AL, Wang L, Du GH, Wu S*. Design, Synthesis, and Biological Evaluation of a New Series of Biphenyl/Bibenzyl Derivatives Functioning as Dual Inhibitors of Acetylcholinesterase and Butyrylcholinesterase. Molecules, 2017, 22: 172; doi:10.3390.
6. Lian W, Fang J, Xu L, Zhou W, Kang D, Xiong W, Jia H, Liu AL*, Du GH*. DL0410 Ameliorates Memory and Cognitive Impairments Induced by Scopolamine via Increasing Cholinergic Neurotransmission in Mice. Molecules. 2017, 22(3), 410. pii: E410.
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9. Pang X, Fu H, Yang S, Wang L, Liu AL*, Wu S*, Du GH*. Evaluation of Novel Dual Acetyl- and Butyrylcholinesterase Inhibitors as Potential Anti-Alzheimer’s Disease Agents Using Pharmacophore, 3D-QSAR, and Molecular Docking Approaches. Molecules 2017, 22(8): 1254. doi: 10.3390/molecules**.
10. Pang X, Zhao Y, Wang J, Zhou QM, Xu LJ, Kang D， Zhou W, Liu AL*, Du GH*. The bioinformatic analysis of the dysregulated genes and microRNAs in entorhinal cortex, hippocampus and blood for Alzheimer’s disease. BioMed Research International. 2017.7.
11. Fang J, Pang X, Yan R, Lian W, Li C, Wang Q, Liu AL *, and Du GH *. Discovery of Neuroprotective Compounds by Machine Learning Approaches. RSC Adv., 2016, 6: 9857-9871.
12. Fang J, Pang X, Wu P, Yan R, Gao L, Li C, Lian W, Wang Q, Liu AL*, Du GH*. Molecular Modeling on Berberine Derivatives toward BuChE: An Integrated Study with Quantitative Structure–Activity Relationships Models, Molecular Docking, and Molecular Dynamics Simulations. Chem Biol Drug Des. 2016 May; 87(5):649-63.
13. Zhou D, Zhou W, Song JK, Feng ZY, Yang RY, Wu S, Wang L, Liu AL*, Du GH*.DL0410, a novel dual cholinesterase inhibitor, protects mouse brains against A-β-induced neuronal damage via the Akt/JNK signaling pathway. Acta Pharmacol Sin.2016, 37(11):1401-1412.
14. FangJ, Pang X, Yan R, Lian W, Li C, Wang Q,Liu AL*, Du GH*.Discovery of Neuroprotective Compounds by Machine Learning Approaches.RSC Adv., 2016,6: 9857-9871.
15. Fang J, Li Y, Liu R, Pang X, Li C, Yang R, He Y, Lian W,Liu AL*, Du GH*. Discovery of multitarget-directed ligands against Alzheimer's disease through systematic prediction of chemical-protein interactions. J Chem Inf Model. 2015, 55(1):149-64.
16. Fang J, Pang X, Wu P, Yan R, Gao L, Li C, Lian W, Wang Q,Liu AL*, Du GH*. Molecular Modeling on Berberine Derivatives toward BuChE: An Integrated Study with Quantitative Structure–Activity Relationships Models, Molecular Docking, and Molecular Dynamics Simulations. Chem Biol Drug Des, 2015, doi: 10.1111/cbdd.12700.
17. Gao L, Li C, Yang RY, Lian WW, Fang JS, Pang XC, Qin XM,Liu AL*, Du GH*. Ameliorative effects of baicalein in MPTP-induced mouse model of Parkinson's disease: A microarray study. Pharmacol Biochem Behav. 2015, 133: 155-163.
18. Yang RY, Zhao G, Wang DM, Pang XC, Wang SB, Fang JS, Li C,Liu AL*, Wu S*, Du GH*. DL0410 can reverse cognitive impairment, synaptic loss and reduce plaque load in APP/PS1 transgenic mice. Pharmacol Biochem Behav. 2015, 139(Pt A):15-26.
19. Gao L, Zhao G, Fang JS, Yuan TY,Liu AL*, Du GH*.. Discovery of the neuroprotective effects of alvespimycin by computational prioritization of potential anti-parkinson agents. FEBS Journal, 2014, 281:1110-1122.
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24. Gao L, Zhao G, Fang JS, Yuan TY,Liu AL*, Du GH*. Discovery of the neuroprotective effects of alvespimycin by computational prioritisation of potential anti-parkinson agents. FEBS J. 2013, doi: 10.1111/febs.12672.
25. Lam IK, Alex D, Wang YH, Liu P,Liu AL, Du GHand Lee SM*.In vitroandin vivostructure and activity relationship analysis of polymethoxylated flavonoids: identifying sinensetin as a novel anti-angiogenesis agent. Molecular Nutrition and Food Research, 2012 56(6):945-56.
26. Liu R, Meng F, Zhang L,Liu A, Qin H, Lan X, Li L, Du G. Luteolin isolated from the medicinal plant Elsholtzia rugulosa (Labiatae) prevents copper-mediated toxicity in β-amyloid precursor protein Swedish mutation overexpressing SH-SY5Y cells. Molecules. 2011, 16(3):2084-96.
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参与编写专著
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2、 杜冠华。《中药材“毒”古今研究概评》。北京：中国医药科技出出版社，2019年。
3、 杜冠华。《天然小分子药物》。北京：人民卫生出版社，2018年。
4、 Du GH. Natural Small Molecule Drugs from Plants. Springer, 2018.
5、李晓辉等。《新药研究与评价概论》，北京：人民卫生出版社，2014。
6、艾铁民。《中国药用植物志》第十二卷，北京：北京大学医不出版社，2013年。
7、Patra A.K. (ed.) Dietary Phytochemicals and Microbes. 93-126, Springer sciences, Business Media Dordrecht, 2012.
8、再帕尔.阿不力孜。《天然产物研究方法和技术》，北京：化学工业出版社，2010年。
9、刘丽华。《医药卫生领域标准规范资料汇编》，北京：中国协和医科大学出版社，2010年。
10、杜冠华。《药理学原理》，北京：人民卫生出版社，2009年。
11、《新药发现—寻找维护人类健康的武器》，北京：中国科学技术出版社，2009年。
12、杜冠华。《药物与营养物质的相互作用》，北京：人民卫生出版社，2008年。
13、张均田，杜冠华。《丹参大全－丹参药理学》，人民卫生出版社，2008年。
14、《药物发现》，北京：科学出版社，2007年。
15、王德心。《组合化学原理、技术及应用》, 北京：中国协和医科大学出版社， 2005年。
16、甄永苏。《抗肿瘤药物研究与开发》，北京：化学工业出版社，2004年。
17、杜冠华。《实验药理学》，北京：中国协和医科大学出版社， 2004年。
18、杜冠华。《高通量药物筛选》，北京：化学工业出版社，2002年。