刘德培刘德培课题组简介

课题组近年来先后承担国家自然科学基金重大项目珠蛋白基因表达的时空顺序性研究、基因表达的调控网络研究、国家科学基金、科技部“九五”攻关项目人类疾病动物模型的建立、国家863重点项目杂合寡核苷酸介导的基因定点修复与疾病的基因治疗、科技部863重点项目地中海贫血基因治疗、国家973项目疾病来源iPS 的表观调控与突变基因定点修复研究等项目。主持心血管疾病973项目“重大血管性疾病发病机制和防治的基础研究”，“动脉粥样硬化发病机制及其诊治与干预的基础研究”，并获得自然基金委创新群体的荣誉称号。课题组一共毕业博士生80多人，在读博士研究生20人，出站博士后3人，在读博士后2人。
本课题组学术气氛活跃，注重交流，分别与约翰霍普金斯、哈佛、港大等相关实验室建立了长期稳定的合作关系。课题组坚持以人为本，鼓励创新，充分发挥每个人的聪明才智，大家以诚相见，做到和而不同，为而不争，在这种宽松的学术环境中从事科学研究。
课题组负责人介绍


刘德培，男，研究员，博士生导师。1950年5月生，1986年获中国协和医科大学博士学位，1987－1990年美国加州大学旧金山分校博士后，1990年回协和基础所工作，1991年被授予“做出突出贡献的中国博士学位获得者”称号，1993年被评为“全国首届中青年医学科技之星”，1994年被评为国家级有突出贡献的中青年专家，入选原国家教委“跨世纪优秀人才培养计划”，获国家教委跨世纪优秀人才基金，获国家自然科学基金委优秀中青年人才基金，1995年获国家自然科学基金委科学基金，被评为求是基金会。1996年当选中国工程院院士，2008年当选为美国医学科学院（IOM）与第三世界科学院（TWAS）院士，2016年当选为国际医学科学院（IAPH）组织共同主席。先后承担国家自然科学基金重大、重点项目、国家863重点项目等，国家自然科学基金委“优秀创新群体”学术带头人，心血管973项目首席科学家。获得卫生部科技进步奖、北京市科技进步奖、中华医学科技奖、国家自然科学奖。现任医学分子生物学国家重点实验室主任，中华医学会副会长，中华医学杂志副主编，JMM杂志副主编。担任中国生化与分子生物学脂质与脂蛋白专业委员会主任委员，中国生化与分子生物学医学生物化学委员会理事长。
联系方式：E-mail:liudp@pumc.edu.cn，电话:

课题组工作人员介绍


陈厚早：男，副研究员。北京协和医学院生化与分子生物学专业博士。2011年任中国医学科学院基础医学研究所副研究员，2013年破格为博士生导师。获 “国家自然科学基金委优青” 、“中组部青年拔尖人才”等荣誉或资助。现任中国生化与分子生物学脂质与脂蛋白青年委员会副主任委员，中国老年学和老年医学学会抗衰老委员会委员等。
联系方式：E-mail:chenhouzao@ibms.cams.cn，chz6083@126.com， 电话:

张祝琴：男，助理研究员，博士
E-mail:zqzhang@ibms.pumc.edu.cn，jajoking@163.com；电话:

郝德龙：男，技师，本科
E-mail:haodelong@ibms.cams.cn 电话:

课题组研究方向
基因表达调控与基因治疗；心血管疾病发病机制

课题组研究成果
在基因表达调控与基因治疗研究中，发现β珠蛋白基因簇红系增强子HS2及其关键位点，建立BAC介导的α/β珠蛋白基因簇转基因动物模型，发现α-基因簇活性染色质构象（ACH）中珠蛋白基因与看家基因共用转录工厂，发现β基因簇MAR间协同染色质高级构象，发现马利兰可显著增强贫血恒河猴与地贫患儿的胎儿型珠蛋白表达，用杂合寡核苷酸实现了β基因的定点修复并提出复制叉渗漏寡核苷酸掺入假说，发现Sirt1调节成纤维细胞向iPS细胞转化的效率，利用TALEN和CRISPR/Cas9技术结合同源重组修复病人来源的iPS细胞中的globin基因突变并进行两种方法的比较。在心血管疾病发病机制研究中，建立ApoAI/CIII/AIV载脂蛋白基因簇转基因动物模型并发现ApoCIII增强子的调控机制，发现A20在心梗后能明显改善心脏综合功能,发现对氧磷酶（PON）基因簇能抑制动脉粥样硬化斑块形成并稳定斑块，发现内皮特异的III类去乙酰化酶Sirt1能降低ApoE敲除鼠的动脉粥样硬化，发现能量限制升高Sirt1的表达，抑制腹主动脉瘤的发生与严重程度，而衰老抑制Sirt1的表达，促进主动脉瘤的发生，发现Sirt2抑制衰老相关的心肌肥厚，发现Sirt4通过Sirt3促进心肌肥厚的发生，发现Sirt6通过降低NKG2D配体表达抑制ApoE敲除鼠动脉粥样硬化的发生并稳定斑块，合作研究发现IRF9-Sirt1轴在代谢和心脑血管疾病中的作用。以上工作在Circulation;European Heart Journal; Nature Communication; Journal of Experimental Medicine;Circulation Research; PNAS; Nucleic Acids Research等杂志发表。共发表SCI论文200多篇，被引用4000余次。

课题组发表文章

Pubmed搜索结果：
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=liu%2C+de-pei%5Bfau%5D+OR+liu%2C+depei%5Bfau%5D

代表性论文：
1. Liu Y, Wang TT, Zhang R, Fu WY, Wang X, Wang F, Gao P, Ding YN, Xie Y, Hao DL, Chen HZ, Liu DP. Calorie restriction protects against experimental abdominal aortic aneurysms in mice. J Exp Med 2016;213:2473-2488.
2. Chen HZ, Wang F, Gao P, Pei JF, Liu Y, Xu TT, Tang X, Fu WY, Lu J, Yan YF, Wang XM, Han L, Zhang ZQ, Zhang R, Zou MH, Liu DP. Age-Associated Sirtuin 1 Reduction in Vascular Smooth Muscle Links Vascular Senescence and Inflammation to Abdominal Aortic Aneurysm. Circ Res 2016;119:1076-1088.
3. Zhang R, Chen HZ, Liu DP. The Four Layers of Aging. Cell Syst 2015;1:180-186.
4. Luo YX, Tang X, An XZ, Xie XM, Chen XF, Zhao X, Hao DL, Chen HZ, Liu DP. Sirt4 accelerates Ang II-induced pathological cardiac hypertrophy by inhibiting manganese superoxide dismutase activity. Eur Heart J 2016.
5. Zhang ZQ, Ren SC, Tan Y, Li ZZ, Tang X, Wang TT, Hao DL, Zhao X, Chen HZ, Liu DP. Epigenetic regulation of NKG2D ligands is involved in exacerbated atherosclerosis development in Sirt6 heterozygous mice. Sci Rep 2016;6:23912.
6. Xu P, Tong Y, Liu XZ, Wang TT, Cheng L, Wang BY, Lv X, Huang Y, Liu DP. Both TALENs and CRISPR/Cas9 directly target the HBB IVS2-654 (C > T) mutation in beta-thalassemia-derived iPSCs. Sci Rep 2015;5:12065.
7. Mu WL, Wang YJ, Xu P, Hao DL, Liu XZ, Wang TT, Chen F, Chen HZ, Lv X, Liu DP. Sox2 Deacetylation by Sirt1 Is Involved in Mouse Somatic Reprogramming. Stem Cells 2015;33:2135-2147.
8. Zhang SM, Zhu LH, Chen HZ, Zhang R, Zhang P, Jiang DS, Gao L, Tian S, Wang L, Zhang Y, Wang PX, Zhang XF, Zhang XD, Liu DP, Li H. Interferon regulatory factor 9 is critical for neointima formation following vascular injury. Nat Commun 2014;5:5160.
9. Chen HZ, Guo S, Li ZZ, Lu Y, Jiang DS, Zhang R, Lei H, Gao L, Zhang X, Zhang Y, Wang L, Zhu LH, Xiang M, Zhou Y, Wan Q, Dong H, Liu DP, Li H. A critical role for interferon regulatory factor 9 in cerebral ischemic stroke. J Neurosci 2014;34:11897-11912.
10. Wang PX, Zhang R, Huang L, Zhu LH, Jiang DS, Chen HZ, Zhang Y, Tian S, Zhang XF, Zhang XD, Liu DP, Li H. Interferon regulatory factor 9 is a key mediator of hepatic ischemia/reperfusion injury. J Hepatol 2015;62:111-120.
11. Wan YZ, Gao P, Zhou S, Zhang ZQ, Hao DL, Lian LS, Li YJ, Chen HZ, Liu DP. SIRT1-mediated epigenetic downregulation of plasminogen activator inhibitor-1 prevents vascular endothelial replicative senescence. Aging Cell 2014;13:890-899.
12. Wu J, Zhou LQ, Yu W, Zhao ZG, Xie XM, Wang WT, Xiong J, Li M, Xue Z, Wang X, Zhang P, Mao BB, Hao DL, Lv X, Liu DP. PML4 facilitates erythroid differentiation by enhancing the transcriptional activity of GATA-1. Blood 2014;123:261-270.
13. Chen HZ, Wan YZ, Liu DP. Cross-talk between SIRT1 and p66Shc in vascular diseases. Trends Cardiovasc Med 2013;23:237-241.
14. Xue Z, Lv X, Song W, Wang X, Zhao GN, Wang WT, Xiong J, Mao BB, Yu W, Yang B, Wu J, Zhou LQ, Hao DL, Dong WJ, Liu DP, Liang CC. SIRT1 deacetylates SATB1 to facilitate MAR HS2-MAR epsilon interaction and promote epsilon-globin expression. Nucleic Acids Res 2012;40:4804-4815.
15. Zhou S, Chen HZ, Wan YZ, Zhang QJ, Wei YS, Huang S, Liu JJ, Lu YB, Zhang ZQ, Yang RF, Zhang R, Cai H, Liu DP, Liang CC. Repression of P66Shc expression by SIRT1 contributes to the prevention of hyperglycemia-induced endothelial dysfunction. Circ Res 2011;109:639-648.
16. Lu L, Li L, Lv X, Wu XS, Liu DP, Liang CC. Modulations of hMOF autoacetylation by SIRT1 regulate hMOF recruitment and activities on the chromatin. Cell Res 2011;21:1182-1195.
17. Li L, Zhang HN, Chen HZ, Gao P, Zhu LH, Li HL, Lv X, Zhang QJ, Zhang R, Wang Z, She ZG, Wei YS, Du GH, Liu DP, Liang CC. SIRT1 acts as a modulator of neointima formation following vascular injury in mice. Circ Res 2011;108:1180-1189.
18. Li ZY, Xi Y, Zhu WN, Zeng C, Zhang ZQ, Guo ZC, Hao DL, Liu G, Feng L, Chen HZ, Chen F, Lv X, Liu DP, Liang CC. Positive regulation of hepatic miR-122 expression by HNF4alpha. J Hepatol 2011;55:602-611.
19. Zhuo ML, Huang Y, Chen JZ, Sun LH, Yang RF, Chen HZ, Lv X, Li HL, Wei YS, Liu G, Zhang R, Ma TM, Cai H, Hui RT, Liu DP, Liang CC. Endothelium-specific overexpression of human IC53 downregulates endothelial nitric oxide synthase activity and elevates systolic blood pressure in mice. Cardiovasc Res 2009;84:292-299.
20. She ZG, Zheng W, Wei YS, Chen HZ, Wang AB, Li HL, Liu G, Zhang R, Liu JJ, Stallcup WB, Zhou Z, Liu DP, Liang CC. Human paraoxonase gene cluster transgenic overexpression represses atherogenesis and promotes atherosclerotic plaque stability in ApoE-null mice. Circ Res 2009;104:1160-1168.
21. Zhang QJ, Wang Z, Chen HZ, Zhou S, Zheng W, Liu G, Wei YS, Cai H, Liu DP, Liang CC. Endothelium-specific overexpression of class III deacetylase SIRT1 decreases atherosclerosis in apolipoprotein E-deficient mice. Cardiovasc Res 2008;80:191-199.
22. Li HL, Zhuo ML, Wang D, Wang AB, Cai H, Sun LH, Yang Q, Huang Y, Wei YS, Liu PP, Liu DP, Liang CC. Targeted cardiac overexpression of A20 improves left ventricular performance and reduces compensatory hypertrophy after myocardial infarction. Circulation 2007;115:1885-1894.
23. Wei GH, Liu DP, Liang CC. Chromatin domain boundaries: insulators and beyond. Cell Res 2005;15:292-300.
24. Wu XS, Xin L, Yin WX, Shang XY, Lu L, Watt RM, Cheah KS, Huang JD, Liu DP, Liang CC. Increased efficiency of oligonucleotide-mediated gene repair through slowing replication fork progression. Proc Natl Acad Sci U S A 2005;102:2508-2513.
25. Ke XS, Liu CM, Liu DP, Liang CC. MicroRNAs: key participants in gene regulatory networks. Curr Opin Chem Biol 2003;7:516-523.
26. Xin L, Liu DP, Ling CC. A hypothesis for chromatin domain opening. Bioessays 2003;25:507-514.


发表论著




已授权专利
PON基因簇在制备用于治疗动脉粥样硬化的药物中的用途
同时表达抗原特异性受体和外源基因的重组逆转录病毒
SIRT1在制备上调珠蛋白基因表达及在制备治疗贫血药物中的用途
Immt基因敲除鼠的培育方法及该小鼠模型的用途
SIRT1在制备预防内皮细胞功能失常导致的疾病的药物中的用途
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