中国樱桃 LTR 类反转录转座子反转录酶序列的克隆和分析
刘厚宇 1,2,3，吴敏芳 1，文晓鹏 1,*1 贵州大学农业生物工程研究院/贵州大学生命科学院，山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室，贵阳550025；2 贵州大学林学院/贵州省森林资源与环境研究中心，贵阳 550025；3 贵州省清镇市农业农村局，贵州清镇551400
出版日期:2020-02-25发布日期:2020-02-25基金资助:贵州省农业攻关项目（黔科合支撑[2016]2520）Cloning and Analysis of LTR Reverse Transcriptase from Chinese Cherry （Prunus pseudocerasus Lindl.）
LIU Houyu1,2,3，WU Minfang1，and WEN Xiaopeng 1,*1The Key Laboratory of Plant Resource Conservation and Germplasm Innovation in Mountainous Region（Ministry of Education），Institute of Agro-bioengineering and College of Life Sciences，Guizhou University，Guiyang 550025，China； 2Research Center for Fortest Resources and Environment of Guizhou Province，College of Forestry，Guizhou University，Guiyang 550025，China；3Agricultural and Rural Affairs Bureau of Qingzhen，Qingzhen，Guizhou 551400，China
Online:2020-02-25Published:2020-02-25摘要/Abstract
摘要： 利用同源序列法根据 Ty1-copia 和 Ty3-gypsy 类反转录转座子反转录酶保守区设计简并引物，从中国樱桃（Prunus pseudocerasus Lindl.）中分别扩增出约 260 和 430 bp 的目标片段，并进行克隆、测序、序列分析及转录活性检测。共获得 44 条 Ty1-copia 类反转录酶序列，13 条 Ty3-gypsy 类反转录酶序列，序列间显示高度异质性，部分序列存在缺失、终止密码子及移码突变。系统发育树显示 Ty1-copia 可以分为 TAR、Ale 两类，Ty3-gypsy 可以分为 Tat、Reina、Tekay 等 3 类。Ty1-copia 和 Ty3-gypsy 类反转录酶 dN/dS值均小于 1，其中 Ty3-gypsy 高于 Ty1-copia。13 条 Ty1-copia 以及 7 条 Ty3-gypsy 反转录酶序列在樱桃正常生长条件下均有转录活性，但不受 8 种非生物胁迫的诱导。PpRT7 在高温胁迫 24 h 时转录活性升高，并且具有组织特异性。
中图分类号:
S 662.5
引用本文
刘厚宇 1,2,3，吴敏芳 1，文晓鹏 1,*. 中国樱桃 LTR 类反转录转座子反转录酶序列的克隆和分析[J]. 园艺学报, 2020, 47(2): 355-369.
LIU Houyu1,2,3，WU Minfang1，and WEN Xiaopeng 1,*. Cloning and Analysis of LTR Reverse Transcriptase from Chinese Cherry （Prunus pseudocerasus Lindl.）[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2020, 47(2): 355-369.
PDF全文下载地址:
http://www.ahs.ac.cn/CN/article/downloadArticleFile.do?attachType=PDF&id=7014
