小西葫芦黄花叶病毒山东南瓜和丝瓜分离物全基因组序列分析
王 健1，冀树娴1，王 莹2，耿 超1，李向东1，田延平1,*1山东农业大学植物保护学院，山东省农业微生物重点实验室，山东泰安 271018；2临沂大学，山东临沂 276000
出版日期:2019-04-25发布日期:2019-04-25基金资助:国家自然科学基金项目（31501612，31871933）；国家重点研发计划项目（2017YFD020900）Complete Genomic Sequence Analysis of Zucchini yellow mosaic virus Pumpkin and Loofah Isolates from Shandong Province
WANG Jian1，JI Shuxian1，WANG Ying2，GENG Chao1，LI Xiangdong1，and TIAN Yanping1,*1College of Plant Protection，Shandong Agricultural University，Shandong Provincial Key Laboratory of Agricultural Microbiology，Tai’an，Shandong 271018，China；2University of Linyi，Linyi，Shandong 276000，China
Online:2019-04-25Published:2019-04-25摘要/Abstract
摘要： 在山东泰安采集到两个表现黄花叶症状的丝瓜和南瓜样品中检测到小西葫芦黄花叶病毒（Zucchini yellow mosaic virus，ZYMV）；通过RT-PCR和RACE方法获得了两个分离物的全基因组序列，分别命名为CN:Cm:17（丝瓜分离物）和CN:Lc:17（南瓜分离物）。结果表明，CN:Cm:17和CN:Lc:17 基因组除Poly（A）尾巴外，分别含有9 593和9 591个核苷酸（Nucleotides，nt），通过多聚蛋白策略编码一个含3 080个氨基酸的多聚蛋白。CN:Cm:17和CN:Lc:17在氨基酸水平上一致率为96.7%；CN:Cm:17与韩国分离物KR:RDA:07的氨基酸一致率最高（97.8%）；CN:Lc:17与CN:CJLX30535:14和CN:spider131932:13的一致率最高（98.4%）。重组分析发现，CN:Lc:17具有显著重组事件，为KR:KR-PA:05和CN:Cm:17的重组体。基于多聚蛋白编码序列的系统进化聚类结果显示分组与分离物的地理起源存在密切相关性，所有中国分离物分别聚集在A-Ⅴ和A-Ⅵ亚组。
中图分类号:
S 642.6
引用本文
王 健1，冀树娴1，王 莹2，耿 超1，李向东1，田延平1,*. 小西葫芦黄花叶病毒山东南瓜和丝瓜分离物全基因组序列分析[J]. 园艺学报, 2019, 46(4): 784-796.
WANG Jian1，JI Shuxian1，WANG Ying2，GENG Chao1，LI Xiangdong1，and TIAN Yanping1,*. Complete Genomic Sequence Analysis of Zucchini yellow mosaic virus Pumpkin and Loofah Isolates from Shandong Province[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2019, 46(4): 784-796.
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