利用siRNA高通量测序和RT-PCR技术鉴定引起茄子斑驳紫花病的病毒种类
柴阿丽，陈利达，曹金强，康华军，石延霞，谢学文，李宝聚*（中国农业科学院蔬菜花卉研究所，北京100081）
出版日期:2019-03-25发布日期:2019-03-25Identification of Viruses Causing Eggplant Purple Mottle Flower Disease by siRNA High-throughput Sequencing and RT-PCR detection
CHAI Ali，CHEN Lida，CAO Jinqiang，KANG Huajun，SHI Yanxia，XIE Xuewen，and LI Baoju*（Institute of Vegetables and Flowers，Chinese Academy of Agricultural Sciences，Beijing 100081，China）
Online:2019-03-25Published:2019-03-25摘要/Abstract
摘要： 为了明确引起茄子斑驳紫花病的病毒种类，利用小干扰RNA（siRNA）高通量测序技术，结合生物信息学方法寻找茄子样本中的病毒序列，发现存在烟草轻型绿花叶病毒（Tobacco mild green mosaic virus，TMGMV）和番茄斑驳花叶病毒（Tomato mottle mosaic virus，ToMMV）。为了验证该结果，对待测样品中TMGMV和ToMMV的外壳蛋白（coat protein，CP）全长基因进行RT-PCR扩增和系统进化分析，分别得到500 bp的TMGMV-CP和482 bp的ToMMV-CP特异性条带，与GenBank中TMGMV和ToMMV序列相似性分别达到98% ~ 100%和100%，说明待测样品中确实存在TMGMV和ToMMV。对采自山东、河南、辽宁、河北等地的23份疑似斑驳紫花病茄子样品，分别采用特异性引物524-F/R和ToMMV-F/R进行检测。结果显示，所有样品中均含有TMGMV，20份样品中含有ToMMV，复合侵染检出率为86.96%。对茄子、番茄和辣椒幼苗的致病性检测显示，接种后茄子花表现出与田间相同的症状，茄子、番茄和辣椒的叶片表现典型的病毒侵染症状，在接种发病组织中检测到病毒ToMMV和TMGMV。结果表明，茄子斑驳紫花病样中鉴定出TMGMV和ToMMV两种病毒。
中图分类号:
S 641.2
引用本文
柴阿丽，陈利达，曹金强，康华军，石延霞，谢学文，李宝聚*. 利用siRNA高通量测序和RT-PCR技术鉴定引起茄子斑驳紫花病的病毒种类[J]. 园艺学报, 2019, 46(3): 508-518.
CHAI Ali，CHEN Lida，CAO Jinqiang，KANG Huajun，SHI Yanxia，XIE Xuewen，and LI Baoju*. Identification of Viruses Causing Eggplant Purple Mottle Flower Disease by siRNA High-throughput Sequencing and RT-PCR detection[J]. ACTA HORTICULTURAE SINICA, 2019, 46(3): 508-518.
PDF全文下载地址:
http://www.ahs.ac.cn/CN/article/downloadArticleFile.do?attachType=PDF&id=6665
