林　魁 （1963年6月）
博士 教授
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个人简历
•1983年本科毕业于兰州大学数力系数学专业，1997年兰州大学获理学博士学位；
•1998年1月- 1999年1月在新加坡国立大学生物信息学中心 (BIC, NUS) 博士后，1999年2月- 2000年1月在新加坡国立大学生物信息学中心 (BIC, NUS) 工作 (Research Fellow)，2000年2月- 2001年10月在新加坡分子与细胞生物学研究院 (Institute of Molecular & Cell Biology) 工作 (Research Fellow)，2001年11月- 2002年8月在新加坡基因组研究所 (Genome Institute of Singapore) 工作 (Research Scientist)；
•2002年8月- 2007年6月任北京师范大学生命科学学院生物信息学副教授，2007年7月至今任北京师范大学生命科学学院生物信息学教授。


主要研究内容
■植物与微生物基因组分析：通过建立分析平台，对基因组／转录组数据进行组装、注释以及基因功能与进化分析，并建立起对应的组学数据库供相关研究者使用（主要与中国农科院黄三文研究员合作）。
■大肠杆菌实验进化研究：利用全群体全基因组测序(whole-genome whole-population sequencing)方法研究在特定条件下大肠杆菌群体适应过程中基因组的变化动态（与生态所张大勇教授合作）。
■基因组进化：基于特定进化生物学问题，开发、改进和应用计算方法，对全基因组序列进行比较分析，试图理解基因组水平上物种或者群体的进化历史。


代表性论著
■Lin, K., Limpens, E., Zhang, Z.H, Ivanov, S., Saunders, DGO., Mu, D.S., Pang, E.L., Cao, H.F., Cha, H.H., Lin, T., Zhou, Q., Shang, Y., Li, Y., Sharma, T., Velzen, R.V., Ruijter, N., Aanen, D.K., Win, J., Kamoun, S., Bisseling, T., Geurts, R., Huang, S.W. (2014) Single Nucleus Genome Sequencing Reveals High Similarity among Nuclei of an Endomycorrhizal Fungus. PLoS Genet 10(1): e**. doi:10.1371/journal.pgen.**.
■Zhang, Y. and Lin, K*. (2012) A phylogenomic analysis of Escherichia coli / Shigella group: implications of genomic features associated with pathogenicity and ecological adaptation. BMC Evolutionary Biology, doi:10.1186/1471-2148-12-174.
■Li, Z., Zhang, Z.H., Yan, P.C., Huang, S.W., Fei, Z.j., and Lin, K*. (2011) RNA-Seq improves annotation of protein-coding genes in the cucumber genome. BMC Genomics, doi: 10.1186/1471-2164-12-540.
■Pang, E.L. and Lin, K*. (2010) Yeast protein–protein interaction binding sites: prediction from the motif–motif, motif–domain and domain–domain levels. Molecular BioSystems, doi: 10.1039/C0MB00038H.
■Lin, K., Zhang, D.Y. and He, F. (2009) Demographic trade-offs in a neutral model explains death rate-abundance rank relationship. Ecology, 90(1):31-38.