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基于泛函线性模型的基因水平关联性分析

本站小编 Free考研考试/2021-12-27

郭浩1,刘湘涛2,龚浩博1,黄健飞1
1. 扬州大学数学科学学院, 扬州 225002; 2. 天佳吉 瑞基因科技有限公司, 合肥 238000
出版日期:2019-11-25发布日期:2020-03-20




Gene Level Association Analysis Based on Functional Linear Model

GUO Hao1 ,LIU Xiangtao2 ,GONG Haobo1 ,HUANG Jianfei1
1. College of Mathematical Sciences, Yangzhou University, Yangzhou 225002; 2. Tianjia Genomes Tech Co. Ltd., Hefei 238000
Online:2019-11-25Published:2020-03-20







摘要



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采用泛函线性模型进行基因水平关联性分析时, 需要对基因片段上离散位点的遗传变异值进行数值逼近. 为了改善传统样条函数在逼近时精度不高, 且在推导时比较耗时的问题, 文章提出了采用勒让德多项式来进行数值逼近, 并利用该类多项式的正交性来提高获得泛函线性模型的效率. 通过分析模拟的基因数据, 文章提出的 方法可以在控制好第一类统计错误的前提下, 提高统计检验能力, 并减少计算时间. 因此, 在采用泛函线性模型进行基因水平关联分析时, 使用勒让德多项式估计的模型比传统的样条函数模型更有实际应用价值.

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