数学、统计及精算学学院, 肯特大学,英格兰肯特郡坎特伯雷市,英国
出版日期:
2015-12-25发布日期:
2016-01-12SCREENING TESTS FOR DISEASE RISK HAPLOTYPE SEGMENTS IN GENOME BY USE OF PERMUTATION
ALI Fadhaa ,ZHANG JianSchool of Mathematics, Statistics and Actuarial Science, University of Kent, Canterbury, England
Online:
2015-12-25Published:
2016-01-12摘要
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通过测试的一群而不是单个的变异与疾病的关联捕获变 异的集体行为,文章提出了单倍型关联分析.这种分析通常涉及未知 相位多位置基因型在病例和对照组中稀疏频率.它从推断单倍型基因 型,共同分类和边际筛查疾病相关的基因单倍型开始.不幸的是,解未 知相位的不确定性可能对单倍型共同分类 (因此对预测风险单倍型的精度) 产生强烈影响. 在这里, 为了解决这一问题, 文章提出一个替代办法: 在阶段一中,选择风险基因型而不是共同分类推断单 倍型.在阶段二中,从前一阶段选择风险基因型推断出风险单 体型.采用仿真研究和实际 数据分析评定提议的程序性能.相比现有的多个 $Z$-检验程序,通过使用建议的程序可增加全基因组关联研究的功效.
MR(2010)主题分类:
62P10
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