1978年开始筹建针灸专业，1983年秋开始招收针灸专科学生。1986年春，正式成立针灸推拿系，并升格为五年制针灸本科专业。1984年被授予针灸专业硕士点。1989年经浙江省教委评审通过为省级重点学科。1994年，建立浙江中医学院针灸推拿气功研所。1992年春，建立浙江中医学院针灸推拿中医门诊部。现有6个教研室和针灸推拿气功研究所下属5个实验室；在编人员29人，其中正高职称3人，副高职称12人，中级职称11人，其中博士学位3人，硕士学位11人。
　　
　　主要承担了针灸推拿专业全日制本科生的主干课程教学任务，同时负责中医专业、中医骨伤专业、护理专业学生的及成教生、外国留学生、进修生的有关课程的讲授。10余年来，共培养针灸、推拿专业本、专科学生逾千人，硕士研究生33人。现有本专科学生327人，硕士研究生16人。
　　
　　1989年开始建设和发展我院第一个省重点学科，十年来学科建设各方面有较大发展，增设了生理实验室、免疫实验室等，并陆续购置电生理仪10套，生物信息仪、16道脑电图机、血液流变仪、超净工作台、c02培养箱、生物倒置显微镜、pcr扩增仪、电子天平、冷冻高速离心机、推拿手法测试仪等一批先进仪器设备。
　　
　　在科研工作上，由“经穴一脏腑相关”一个科研方向逐渐发展成“针刺镇痛与免疫相关”、“针灸调整脑功能障碍”以及“推拿力学原理及其对颈椎病的影响”等方向的研究。其中主编教材1部、副主编教材2部，在国际和国内学术刊物发表了研究论文近300余篇。3项获省、部级科技进步奖。出版论著20余部，目前主持在研省市级课题8项，厅级课题近20项。在此基础上，进一步拓展研究深度和广度，引入新技术、新方法，确立了今后15年的3个主要研究方向。
　　
　　系属针灸推拿中医门诊部下设：针灸治疗室6个；推拿治疗室3个；中医诊疗室4个：医学气功室1个以及中药房、b超室、心电图室、脑电图室。目前设有类风湿性关节炎、痴呆和脑瘫、偏头痛、失眠症、支气管扩张咯血、神经痛、子宫内膜异位症、结肠炎、慢性肾炎、颈椎病、腰突症等专科，年门诊量达4—5万人次，为针灸、推拿专业学生和外国留学生临床见、实习提供了基地。